مصطفی صادقی
دانشیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
[ 1 ] - تأثیر اسناد کردن و تراکم نشانگری در بهبود درستی ارزیابی‌های ژنگانی
با دسترسی به اطلاعات نشانگرهای تک نوکلئوتیدی (SNP)، پیشبینی شایستگی ژنتیکی افراد بدون اطلاعات پدیدگانی (فنوتیپی) با استفاده از ارزیابی ژنگانی (ژنومی) امکانپذیر شده است. لیکن، استفاده از تراشه (چیپ)های متراکم برای ارزیابی همۀ افراد جمعیت مقرون‌به‌صرفه نیست. برای دستیابی به بیشترین بازدهی در بررسی‌های ژنگانی میتوان گروهی از حیوان‌ها را با تراشههای با تراکم بالا و دیگر افراد را با تراشههای ...
[ 2 ] - بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت اسب کرد ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
در این تحقیق با استفاده از شش نشانگر ریزماهواره (HMS07, HMS03, HMS02, HMS06, ASB02, ASB23) تنوع ژنتیکی درون جمعیت 52 نمونه اسب کرد اصیل که از استانهای کردستان، کرمانشاه، ایلام، آذربایجان غربی، اصفهان، کرمان و همدان به‌طور تصادفی نمونهگیری شده‌اند، بررسی شد. از نمونۀ خونهای گرفته‌شده DNA به روش نمکی بهینه یافته استخراج شد. واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) برای افزونش قطعه‌های شش جایگاه ریزماهوار...
[ 3 ] - پروفایل ترانسکریپتوم یاختههای گرانولوزای تخمدان گاو در مراحل مختلف فولیکولوژنسیز
آخرین مرحلۀ فولیکولوژنسیز در فولیکول تخمدان پستانداران شامل بیشترین توسعه و اوج فعالیت لایههای بافت پوششی (اپیتلیال) یاختههای گرانولوزا است که حفرۀ آنترال را احاطه کردهاند. در طول رشد و توسعۀ فولیکول، یاختههای گرانولوزا تکثیر میشوند و هورمونهای لازم برای رشد اووسیت را ترشح میکنند. در گاو، فولیکول نیاز به رشد تا قطر بالای 10 میلی‌متر دارد تا آماده برای تخمکریزی شود و پس از این مرحله یاخت...
[ 4 ] - چندشکلی ژن دی آسیل گلیسرول آسیل ترانسفراز 1 (DGAT1) در جمعیت گاومیشهای ایران
دی آسیل گلیسرول آسیل ترانسفراز1 (DGAT1) آنزیم کلیدی در ساخت (سنتز) تری گلیسیرید است. ایجاد یک جهش جایگزینی باعث تبدیل گوانین به آدنین و منجر به جایگزینی لیزین با آلانین در آنزیم میشود که در گاو تأثیری بزرگ بر شیر و ترکیب‌های آن دارد. در این تحقیق، چندشکلی در ناحیۀ اگزون 3 تا اگزون 17 ژن DGAT1 در سه تودۀ بومی گاومیشهای ایران بررسی شد. استخراج DNA از پیاز مو با استفاده از کیت استخراج DNA از 200...
[ 5 ] - بررسی چندریختی اگزون چهار ژن هورمون رشد و اگزون ده گیرنده هورمون رشد و ارتباط آنها با صفات لاشه در گوسفند نژاد لری بختیاری
ژن هورمون رشد ((GH ژنی نامزد (کاندیدا) برای رشد حیوانات اهلی است و هورمون رشد نقش مهمی در سوخت‌وساز (متابولیسم) رشد دارد. برای اینکه هورمون رشد بتواند در سوخت‌وساز رشد شرکت کند نیاز به گیرندههای آن (GHR) در سطح یاختههای هدف دارد. این پژوهش با هدف بررسی ارتباط چندریختی ژنهای GH و GHR با صفات لاشه در نژاد لری بختیاری انجام شد. برای این منظور، از سیاهرگ وداج تعداد 152 رأس گوسفند نژاد لری بختیار...
[ 6 ] - تأثیر دی آسپارتیک اسید بر کیفیت اسپرم خروس های مادر گوشتی
این پژوهش بهمنظور بررسی تأثیر دی آسپارتیک اسید بر برخی فراسنجههای کیفی اسپرم خروس‌های سویۀ راس 308 انجام شد. شمار 30 قطعه خروس با سن 60 هفته به شش گروه دسته‌بندی و به شیوۀ کامل تصادفی درون قفسهای انفرادی منتقل شدند. به همۀ گروههای آزمایشی جیرۀ پایۀ یکسان داده شد و سطوح مختلف دی آسپارتیک اسید شامل: 0 (A-0)، 40 (A-40)، 80 (A-80)، 120 (A-120)، 160 (A-160) و 200 (A-200) میلیگرم /کیلوگرم وزن بد...
[ 7 ] - مطالعۀ چندشکلی ژن ACACA و ارتباط آن با صفات رشد و تولید شیر در بزهای نژاد مهابادی با روش PCR-SSCP
این پژوهش با هدف مطالعۀ چندشکلی ژن ACACA و ارتباط آن با صفات شیر در بزهای نژاد مهابادی انجام گرفت. به این منظور برای 150 رأس بز شیری نژاد مهابادی، خون‌گیری و استخراج DNA از خون به روش نمکی بهینه‌یافته صورت گرفت. قطعۀ اینترون 44 ژن ACACA، به کمک واکنش‌های زنجیره‌ای پلیمراز تکثیر شد. برای بررسی چندشکلی قطعات تکثیرشده، از روش چندشکلی فضایی تک‌رشته‌ای DNA (SSCP) استفاده شد. در نهایت هفت الگوی متفاو...
[ 8 ] - پویش ژنومی نشانههای انتخاب در گاومیشهای خوزستانی و مازندرانی
شناسایی مناطق ژنومی که هدف انتخاب بوده‌اند، از بحث‌برانگیزترین مباحث در حوزة تحقیقات ژنتیک حیوانی، به‌خصوص در حیوانات اهلی است. در این مطالعه، پویش کل ژنوم برای شناسایی مناطقی از ژنوم که در گاومیشهای خوزستانی و مازندرانی هدف انتخاب‌های طبیعی یا مصنوعی قرار گرفته‌اند، اجرا شده است. بدین منظور 148 رأس گاومیش رودخانهای شامل جمعیتهای خوزستانی (121 رأس) و مازندرانی (27 رأس)، به وسیلة آرایههای ژن...
[ 9 ] - Study on DGAT1-exon8 Polymorphism in Iranian Buffalo
Objective: Diacylglycerol acyltransferase 1 is a microsomal enzyme that catalyzes the final step of triglyceride synthesis. The objective of this project is to check out the polymorphism at the exon 8 region of DGAT1 gene using PCR-SSCP technique in Iranian water buffaloes (Bubalus bubalis). Recent activities have shown that a significant association between lysine at amino acid positi...
[ 10 ] - شناسایی چندشکلی‌های تک‌نوکلئوتیدی ژن PPP2CA و اثر آن بر صفات لاشه، رشد و ذخیره چربی در گوسفندان لری‌بختیاری و زل
هدف این مطالعه، تعیین چندشکلی‌های ژن PPP2CA در کروموزوم 5 گوسفند و اثر آن بر صفات لاشه، رشد و ذخیره چربی در گوسفندان لری بختیاری و زل بود. از 140 رأس گوسفند زل (اصلاحی یا کشتاری) و 165 رأس گوسفند لری‌بختیاری خون‌گیری و استخراج DNA به عمل آمد. سپس قطعه 243 جفت بازی از اگزون یک ژن PPP2CA تکثیر و الگوهای مختلف آن توالی‌یابی شد. دو الگوی باندی متفاوت مشاهده شد و نتایج توالی‌یابی وجود دو جهش را نشان...
[ 11 ] - Association Between Plasma Metabolites and Insulin Sensitivity Indexes in Fat-Tailed and Thin-Tailed Lambs During Negative and Positive Energy Balances
Background: Fatty acid mobilization and inflammatory response of adipose tissues vary in various depots, hence the response of fat-tailed and thin-tailed sheep breeds to different energy balances was hypothesized to be different due to differences in proportion and metabolism of various adipose depots in these breeds which may affect whole body insulin sensitivity. Objective: Current study aime...
[ 12 ] - Study on DGAT1-exon8 Polymorphism in Iranian Buffalo
Objective: Diacylglycerol acyltransferase 1 is a microsomal enzyme that catalyzes the final step of triglyceride synthesis. The objective of this project is to check out the polymorphism at the exon 8 region of DGAT1 gene using PCR-SSCP technique in Iranian water buffaloes (Bubalus bubalis). Recent activities have shown that a significant association between lysine at amino acid positi...
[ 13 ] - بررسی تنوع ژنتیکی در جمعیت گاومیشهای آذری با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
با توجه به اهمیت حفظ تنوع در نژادهای بومی و شناسایی ذخایر ژنتیکی کشور، تنوع ژنتیکی جمعیت گاومیش آذری با استفاده از ده نشانگر ریزماهوارهای (BoLA-DRB3، BM1818، BM1824، CSSM033، CSSM047، ILSTS017، ILSTS033، ILSTS058، ILSTS061 و ILSTS089) بررسی شد. شمار 70 نمونه مو از گاومیشهای آذری در سه منطقۀ شمالغربی کشور (استانهای اردبیل، آذربایجانشرقی و آذربایجانغربی) گردآوری شد. استخراج DNA ژنگانی (ژنو...
[ 14 ] - بررسی همگنی ساختار ژنتیکی در جمعیت گوسفند نژاد زندی با استفاده از داده‌های ژنومی
داده‌های ژنومی می‌تواند ما را به چگونگی شکل‌گیری نژادها و جمعیت‌ها و روند تأثیرگذاری رخدادهای ژنتیکی هرچند کمیاب در گذر زمان رهنمون سازد. از موارد بسیار ارزشمند جهت حفظ ذخایر ژنتیکی که خود موضوعی پر اهمیت تلقی می‌گردد و همچنین بهبود برنامه‌های اصلاح نژادی، پی‌بردن به ساختار ژنتیکی جوامع مورد مطالعه است. جهت مطالعه ساختار ژنتیکی جمعیت گوسفند زندی واقع در ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند زندی ته...
[ 15 ] - جستجوی نشانههای انتخاب بین گاومیشهای آذری و مازندرانی با استفاده از نشانگرهای SNP با تراکم زیاد
بهمنظور یافتن نشانههای انتخاب بر روی ژنوم گاومیش از 287 رأس گاومیش رودخانهای شامل 260 رأس آذری و 27 رأس مازندرانی استفاده شد. ژنوتیپ نمونهها بهوسیله آرایههای ژنومی Axiom® Buffalo Genotyping 90K تعیین شد و برآوردگر نااریب FST (θ) برای یافتن نشانههای انتخاب مورد استفاده قرار گرفت. در مجموع 14 منطقه که نشانگرهای SNP آنها بالاتر از 1/0 درصد حد بالای توزیع تجربی FST بودند، بهعنوان نشانهها...
[ 16 ] - ارزیابی صحت ارزش‌های اصلاحی ژنومی برخی صفات اقتصادی جمعیت گاوهای هلشتاین ایران با استفاده از SNP ها و بلوک های هاپلوتایپی
هدف پژوهش حاضر، بررسی صحت ارزش‌های اصلاحی ژنومی (GEBV) بدست آمده برای دو صفت اقتصادی مهم تولید شیر و امتیاز سلول های بدنی با استفاده از SNPها و بلوک‌های هاپلوتایپی مبتنی بر LD به کمک دو روش آماری GBULP و بیز B بود. اطلاعات ژنوتیپی مربوط به 1654راس گاو نر که با استفاده از تراشه‌هایی با تراکم‌های مختلف تعیین ژنوتیپ شده بودند مورد استفاده قرار گرفت. صحت ارزش‌های اصلاحی بدست آمده هنگام استفاده از S...
[ 17 ] - برآورد اندازه مؤثر جمعیت گاومیشهای آبی ایران با استفاده از اطلاعات ژنومی
به منظور تعیین اندازه مؤثر جمعیتهای گاومیش ایران از 407 رأس حیوان (260 آذری، 120 خوزستانی و 27 مازندرانی) نمونهگیری به‌عمل آمد. نمونهها بعد از استخراج DNA، با استفاده از آرایه های ژنومیکیAxiom Buffalo Genotyping 90K Array، تعیین ژنوتیپ شدند. اندازه مؤثر جمعیت از 700 تا 4 نسل قبل با استفاده از اطلاعات پیوستگی که برای نمونه تصحیح شده بودند و برای نسل حاضر با استفاده از نرمافزار (V2)NeEstimato...
[ 18 ] - شناسایی ژنهای مؤثر بر میزان چربی محوطۀ بطنی جوجههای گوشتی با استفاده از داده‌های ریزآرایه و توالی‌یابی RNA
امروزه انتخاب ژنتیکی برای افزایش رشد و تولید پروتئین حیوانی با کیفیت بالا در جوجههای گوشتی (Gallus gallus domesticus)، معمولاً منجر به افزایش وزن بیش از حد خواهد شد که نتیجۀ آن تأثیر منفی بر راندمان مصرف خوراک و کیفیت لاشه مانند افزایش چربی محوطه بطنی میشود. هدف این مطالعه استفاده از پروفایل ترانسکریپتوم بافت چربی دو دسته جوجههای گوشتی با چربی بالا و پایین در محوطۀ بطنی، بهمنظ...
Co-Authors