اردشیر نجاتی جوارمی
گروه علوم دامی، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران
[ 1 ] - توجیه واریانس ژنتیکی صفت باقیمانده مصرف خوراک با چندشکلی های تک نوکلئوتیدی (SNP) کشف شده بر روی ترانسکریپتوم گاو هلشتاین
چندشکلی‌های تک نوکلئوتیدی ( SNP) امروزه به مهم‌ترین و کارآمدترین ابزار به نژادی تبدیل شدهاند. مطالعات پویش کل ژنوم و انتخاب ژنومی دو کاربرد مهم در اصلاح نژاد دام هستند که هر دو مبتنی بر تعیین ژنوتیپ تعداد بسیار زیادی از این جایگاهها هستند. بدین منظور آرایه های با تراکم بالا از این نشانگرها در صنعت گاو شیری ارایه شده اند. از آنجاییکه ترانسکریپتوم تنها حاصل رونویسی بخشهایی از ژنوم است که رمزگر ب...
[ 2 ] - بررسی ساختار جمعیت و شناسایی نواحی تحت انتخاب در ژنگان اسبهای کرد و عرب ایرانی
اسب عرب از قدیمیترین نژادهای اسب جهان است. این نژاد عملکرد بسیار خوبی در مسابقات استقامتی و به‌طورکلی عملکرد ورزشی داشته و در تشکیل برخی نژادهای مهم جهان نقش داشته است. در مقابل، اسب کرد که بیشتر در زمین‌های ناهموار و مناطق کوهستانی زندگی میکند، مناسب سواری در مناطق کوهستانی و مسابقات چوگان است. برای بررسی ساختار جمعیت و شناسایی قطعه‌های کروموزمی تحت انتخاب در این دو جمعیت، از 38 اسب عرب و 58...
[ 3 ] - پویش ژنگانی نشانههای انتخاب مرتبط با بیماری ورم پستان در گاو هلشتاین آلمانی
اهلیسازی و انتخاب به‌شدت در ویژگی‌های ظاهری و رفتاری حیوان‌های اهلی امروزی تغییر ایجاد کرده است. در این مسیر انتخابهای انجام‌شده توسط انسان نشانههای قابل شناسایی را در ژنگان (ژنوم) گاوهای امروزی به جا گذاشته که آشکارسازی این نشانهها میتواند به اصلاح و بهبود ژنتیکی صفات مهم اقتصادی در این دام‌ها کمک کند. امروزه بیماری ورم پستان یکی از مهم‌ترین چالشهای اقتصادی در صنعت گاو شیری است که به‌طو...
[ 4 ] - تعیین جایگاههای تحت انتخاب مثبت در نژادهای گوسفند ایرانی بلوچی و زل
نشانههای انتخاب در کل ژنگان (ژنوم)، ما را در درک سازوکارهای انتخاب و شناسایی مناطقی از ژنگان که در طی سالیان متمادی به‌صورت طبیعی و یا مصنوعی انتخاب شدهاند، راهنمایی میکنند. هدف این تحقیق شناسایی نقاطی از ژنگان در گوسفندان زل و بلوچی بود که در طی سالهای مختلف به‌صورت مصنوعی یا طبیعی انتخاب شدهاند. 143 رأس گوسفند بلوچی (96 رأس) و زل (47 رأس)، با استفاده از آرایههای ژنگانیIllumina ovine SN...
[ 5 ] - چندشکلی ژن دی آسیل گلیسرول آسیل ترانسفراز 1 (DGAT1) در جمعیت گاومیشهای ایران
دی آسیل گلیسرول آسیل ترانسفراز1 (DGAT1) آنزیم کلیدی در ساخت (سنتز) تری گلیسیرید است. ایجاد یک جهش جایگزینی باعث تبدیل گوانین به آدنین و منجر به جایگزینی لیزین با آلانین در آنزیم میشود که در گاو تأثیری بزرگ بر شیر و ترکیب‌های آن دارد. در این تحقیق، چندشکلی در ناحیۀ اگزون 3 تا اگزون 17 ژن DGAT1 در سه تودۀ بومی گاومیشهای ایران بررسی شد. استخراج DNA از پیاز مو با استفاده از کیت استخراج DNA از 200...
[ 6 ] - راهبردهای آمیزشی جهت کاهش اثرات ناهنجاری‌های مغلوب موثر بر سقط در برنامه‌های اصلاحی گاو شیری
به‌منظور مدیریت ناهنجاری‌های ژنتیکی مغلوب مؤثر بر سقط جنین در یک جمعیت گاو شیری، دو طرح آمیزش شبیه‌سازی شد. اولین طرح آمیزش به‌صورت کنترل‌شده تحت سه برنامۀ راهبردی آمیزشی مختلف انجام گرفت: 1. از آمیزش بین افراد حامل هاپلوتیپ‌های کشندۀ یکسان جلوگیری شد، 2. از آمیزش بین گاو نر حامل هاپلوتیپ کشنده و گاو ماده‌ای که پدرش حامل همان هاپلوتیپ بود، جلوگیری شد و 3. از آمیزش بین گاو نر حامل هاپلوتیپ کشنده...
[ 7 ] - شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با قطر پشم در نژادهای گوسفند ایرانی
هدف از این پژوهش پویش ژنوم گوسفند برای شناسایی جایگاههای مؤثر بر قطر پشم در نژادهای بومی کشور بود. برای این منظور نمونه‌های خون 94 حیوان، شامل 47 رأس از نژاد ایرانی زل و 47 رأس از نژاد ایرانی لری‌بختیاری تهیه شد و پس از استخراج DNA، نمونه‌ها با استفاده از آرایههای Ovine 50k SNP Chip تعیین ژنوتیپ شدند. داده‌های حاصل به منظور بررسی کیفی آنالیز شدند. پس از این مراحل، در نهایت مجموع 48056 نشانگر ...
[ 8 ] - اثر تره هالوز و سیستئین بر کیفیت اسپرم گاو بعد از انجماد
هدف از این پژوهش مطالعه اثر مقادیر مختلف تره‌هالوز و سیستئین بر کیفیت اسپرم گاو بعد از انجماد-یخ‌گشایی بود. در این مطالعه، نمونه‌های منی از سه رأس گاو نر جمع‌آوری و پس مخلوط شدن به شش بخش مساوی تقسیم شده و هر بخش با یکی از رقیق کننده‌های زیر رقیق و منجمد شد. 1- فاقد سیستئین و تره‌هالوز (T0C0)، 2- دارای 5 میلی‌مول سیستئین و فاقد تره‌هالوز (T0C5)، 3- دارای 10 میلی‌مول سیستئین و فاقد تره‌هالوز (T0...
[ 9 ] - شناسایی نواحی تحت انتخاب مثبت در ژنگان اسبهای کرد و عرب ایرانی با استفاده از روش مبتنی بر نامتعادلی پیوستگی ژنی
اسبهای عرب به داشتن عملکرد خوب در مسابقه‌های استقامتی، پرش و زیبایی شهرت دارند. اسبهای کرد بومی منطقه‌های کوهستانی غرب ایران، مناسب مسابقه‌های چوگان هستند. اسبهای کرد، قد کوتاهتر و وزن سنگینتری نسبت به اسبهای عرب دارند. در این بررسی آمارۀ XP-EHH که مبتنی بر نامتعادلی پیوستگی ژنی (لینکاژی) است برای شناسایی قطعه‌های کروموزومی تحت انتخاب در ژنگان (ژنوم) اسبهای کرد و عرب ایرانی استفاده شد. ب...
[ 10 ] - مقایسه میزان هوموزیگوسیتی در جایگاههای SNP و ROH در گاوهای شیری پر تولید و کم تولید هلشتاین
افزایش هوموزیگوسیتی حاصل از آمیزش حیوانات خویشاوند، بهعنوان یکی از چالشهای فرا روی صنعت پرورش گاو شیری میباشد که توجه زیادی را به خود جلب کرده است. پژوهش حاضر به منظور بررسی هوموزیگوسیتی بر مبنای جایگاههای SNP و ROH در دامهای پر تولید و کم تولید هلشتاین انجام شده است. در این مطالعه، برای تعیین حیوانات کاندیدا برای تعیین ژنوتیپ از دو رویکرد تابعیت تصادفی و شاخص شجرهای استفاده شد. برای ا...
Co-Authors