هدایت اله روشنفکر
استاد، گروه علوم دامی، دانشگده علوم دامی و صنایع غذایی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین-خوزستان
[ 1 ] - بررسی سازوکار مولکولی فعالسازی سامانه ایمنی گاو با استفاده از دادههای بیان دیجیتالی لوکوسیتها
کاربرد مسیرهای ژنی مؤثر در بروز صفات مختلف در اصلاح نژاد به راحتی امکانپذیر نمیباشد، اما شناسایی مسیرهای ژنی بدست آمده از برهم کنش دادههای ترانسکریپتومی تأثیرگذار بر یک فرآیند زیستی، میتواند گام مهمی در فهم بهتر سازوکارهای تنظیمی آن فرآیند باشد. در این پژوهش، چگونگی سازوکار مولکولی تقویت پاسخ ایمنی با در نظر گرفتن مسیرهای ژنی فعال شده در لوکوسیتها، مورد بررسی قرار گرفت. برای رسیدن به این ه...
[ 2 ] - تأثیر سطوح مختلف اسیدآمینه ترئونین بر عملکرد و پاسخ ایمنی جوجههای گوشتی سویه آرین در دوره آغازین
بهمنظور بررسی تأثیر سطوح مختلف اسیدآمینه ترئونین بر عملکرد و پاسخ ایمنی جوجههای گوشتی سویه آرین 386در دوره آغازین (1 تا 21 روزگی)، آزمایشی با استفاده از 600 قطعه جوجه گوشتی و در قالب طرح کاملاً تصادفی با 6 تیمار، 5 تکرار و 30 قطعه جوجه در هر واحد آزمایشی انجام گردید. تیمارهای آزمایشی شامل سطوح 66/0، 76/0، 86/0، 96/0، 06/1 و 16/1 درصد ترئونین بودند. جهت جلوگیری از اثرات محدودکنندگی سایر اسیدها...
[ 3 ] - ارزیابی انفرادی و ترکیبی قابلیت هضم و تخمیر گیاهان شورزی سلمکی ساقهسفید، سیاهشور و اشنان در شترهای یک کوهانه
در این مطالعه تخمیرپذیری سه گونه گیاهی شورزی تحت چرای شترهای تک کوهانه بنامهای سلمکی ساقه سفید، اشنان و سیاه شور بهصورت انفرادی و با جایگزینی 0، 5/33، 5/66 و 100 درصد با یکدیگر در قالب طرح کامل تصادفی با نه تیمار آزمایشی توسط روش تولید گاز ارزیابی شد. نمونههای گیاهی در طول فصل چرای پاییزه و زمستانه از مراتع جنوب استان خوزستان گردآوری شدند. جیرههای مورد بررسی تفاوت معنیداری از نظر سرعت و ...
[ 4 ] - ارزیابی کارایی تکنیک نمونهگیری تجمعی بوتاسترپ بر صحت روش بهترین پیشبینی نااُریب خطی ژنومی
به منظور افزایش صحت ارزیابیهای روش بهترین پیشبینی نااُریب خطی ژنومی (GBLUP)، تکنیک نمونهگیری تجمعی بوتاسترپ (بگینگ) بکار گرفته شد. بدین منظور ژنومی حاوی 10000 نشانگر تکنوکلئوتیدی دو آللی (SNP) با فواصل یکسان روی 10 کروموزوم هریک به طول 100 سانتیمورگان شبیهسازی شد. برای ایجاد عدم تعادل پیوستگی (LD) بین SNPها و جایگاههای ژنی کنترلکنندة صفات کمی (QTL)، به مدت 100 نسل بین 100 فرد ...
[ 5 ] - Estimation of Genetic Parameters for Kleiber Ratio and Trends for Weight at Birth and Weaning in Arabi Sheep
Objective: Estimation of genetic parameters for Kleiber ratio (KR) and genetic trends for pre-weaning weights of Arabi sheep has not been previously conducted.Methods: Data and pedigree information were collected at the Khuzestan Ramin Agricultural and Natural Resources University, Animal Science Research Station, located in southwest Iran, from 2001 to 2008. (Co)variance components and corresp...
[ 6 ] - برآورد اجزای واریانس وزن بدن گوسفند مرینوس در تولد و شیرگیری با استفاده از نشانگرهای تک نوکلئوتیدی و دو رویکرد حداکثر درستنمایی محدود شده و بیزی
مقدمه: برآورد دقیق اجزای واریانس ژنتیکی و غیر ژنتیکی با اطلاعات شجرهای و ژنومی، از ملزومات پیشبینی صحیح ارزشهای اصلاحی میباشد. دسترسی به آرایههای چندشکلی تکنوکلئوتیدی (SNP) با تراکم بالا و افزایش تعداد حیوانات با اطلاعات ژنوتیپی، دقت و صحت برآوردهای مبتنی بر جمعیت را افزایش میدهد. انتخاب ژنومی بهطور بالقوهای قادر است بیشتر واریانس ژنتیکی را توسط نشانگرها توجیه نماید. هدف از مطالعه حاضر...
[ 7 ] - ارزیابی ژنتیکی صفت وزن کرک در بز کرکی خراسان جنوبی با استفاده از آمار بیزی
هدف از این مطالعه بررسی برخی اثرات محیطی (جنس،سال و فصل زایش، نوع زایش و سن مادر) مؤثر بر تولید کرک، تخمین پارامترها و روند ژنتیکی و فنوتیپی این صفت در بز کرکی خراسان جنوبی میباشد. در این مطالعه برای تخمین پارامترهای ژنتیکی و محیطی از رکورد 1455 بزغاله با 127 پدر و 562 مادر که بین سالهای 1376 تا 1392جمعآوری گردیده، مورد استفاده قرار گرفت. آنالیز با استفاده از برنامه ام تی جی سم اجرا شد.نتای...
[ 9 ] - افزوده سازی و شناسایی مولکولی توالی cDNA کد کننده یک پپتید توکسین از غده زهر عقرب Mesobuthus eupeus در استان خوزستان
زمینه مطالعه: زهر عقرب Mesobuthus eupeus شامل پپتید توکسینهایی است که برخی از آنها در عملکرد کانالهای پتاسیمی دخالت دارند. این نقش میتواند تأثیر مهمی در مطالعات فارماکولوژی و فیزیولوژی این کانالها ایفا کند. هدف: با توجه به نبود اطلاعات کافی از بیولوژی مولکولی پپتیدهای زهر عقرب ایرانی، هدف کلی ما در این پژوهش افزوده سازی و آنالیز توالی cDNA کد کننده یک پپتید توکسین از غده زهر عقرب Mesobuth...
[ 10 ] - طراحی پلاسمید یوکاریوتی بیان کننده اپیتوپ G1 از ژن گلیکوپروتئین G ویروس تب بی دوام گاوی در سلول های جنینی کلیه انسان
گلیکوپروتئین G ویروس تب بیدوام گاوی (BEFV) به عنوان یک نامزد احتمالی جهت ایمنسازی حیوانات در برابر بیماری تب بیدوام شناخته شده است. در سالهای اخیر، این پروتئین جهت تولید یک واکسن نوترکیب مورد توجه ویژه بوده است. هدف از مطالعهی حاضر، ساخت یک پلاسمید یوکاریوتی بیان کنندهی اپیتوپ G1 از ژن گلیکوپروتئین G ویروس تب بیدوام گاوی، برای استفاده به عنوان یک واکسن DNA احتمالی در مطا...
[ 11 ] - بررسی چندشکلی ژن پرولاکتین در برخی توده های مرغان بومی خوزستان با روش PCR-RFLP
پرولاکتین هورمونی است که نقش مهمی در رفتار کرچی پرندگان دارد. بسیاری از مطالعات نشان دادهاند که ژن پرولاکتین میتواند ژن کاندیدا برای کرچی باشد و تنوع موجود در بخشهای مختلف این ژن، پتانسیل ویژهای برای استفاده به عنوان نشانگرهای ژنتیکی از خود نشان داده و میتواند به بهبود ژنتیکی جمعیتها کمک کند. هدف از این مطالعه، بررسی چندشکلی ژن پرولاکتین در برخی تودههای مرغان بومی خوزستان با روش P...
[ 12 ] - Estimation of Genetic Parameters for Kleiber Ratio and Trends for Weight at Birth and Weaning in Arabi Sheep
Objective: Estimation of genetic parameters for Kleiber ratio (KR) and genetic trends for pre-weaning weights of Arabi sheep has not been previously conducted.Methods: Data and pedigree information were collected at the Khuzestan Ramin Agricultural and Natural Resources University, Animal Science Research Station, located in southwest Iran, from 2001 to 2008. (Co)variance components and corresp...
[ 13 ] - مقایسه رویکرد حداکثر درست نمایی محدود شده با بیزی در برآورد اجزای واریانس ژنومی صفات پشم گوسفند مرینوس
برآورد دقیق اجزای واریانس ژنتیکی و غیرژنتیکی با اطلاعات شجرهای و ژنومی، از ملزومات پیشبینی صحیح ارزشهای اصلاحی میباشد. از آنجایی که تراشههای چندشکلی تکنوکلئوتیدی (SNP) کل ژنوم را پوشش میدهند، نشانگرها تمامی جایگاههای صفات کمی را تحت پوشش قرار داده و به طور بالقوه تمام واریانس ژنتیکی را توجیه میکنند. در این پژوهش از SNPهای گوسفندان مرینوس استرالیایی استفاده شد. صفات طول و قطر تار پشم مو...
[ 14 ] - RNA-Seq Bayesian Network Exploration of Immune System in Bovine
Background: The stress is one of main factors effects on production system. Several factors (both genetic and environmental elements) regulate immune response to stress. Objectives: In order to determine the major immune system regulatory genes underlying stress responses, a learning Bayesian network approach for those regulatory genes was applied to RNA-...
[ 15 ] - Using the Protein-protein Interaction Network to Identifying the Biomarkers in Evolution of the Oocyte
Background Oocyte maturity includes nuclear and cytoplasmic maturity, both of which are important for embryo fertilization. The development of oocyte is not limited to the period of follicular growth, and starts from the embryonic period and continues throughout life. In this study, for the purpose of evaluating the effect of the FSH hormone on the expression of genes, GEO access codes for this...
[ 16 ] - تعیین غلظت برخی عناصر معدنی در خون جنسهای مختلف شترهای تک کوهانه در سن و شرایط مختلف فیزیولوژیک
زمینۀ مطالعه: عناصر معدنی برای فعالیتهای مختلف بیوشیمیایی، تولیدی و تولید مثلی حیوانات ضروری هستند و تحت تاثیر خاک و گیاهان هر منطقه غلظت آن در بدن دام متفاوت خواهد بود. هدف: هدف آزمایش حاضر تعیین غلظت عناصر معدنی کم نیاز و پر نیاز در خون شترهای چرا کننده در مراتع خوزستان بود. روشکار: تعداد ۸۸ نفر شتر در قالب ۱۱ گروه از نظر سن و شرایط مختلف فیزیولوژیک در سه ناحیه هویزه، جفیر و آبادان-خرمشهر، ...
[ 17 ] - مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با lncRNAهای شناخته شده بین ژنی در بافت شکمبه گوسالههای مبتلاء به اسیدوز
هدف این پژوهش شناسائی lncRNAهای دخیل در کنترل فعالیت مسیرهای بیولوژیکی موثر در بروز اسیدوز بود. بدین منظور دو گروه گوساله شامل گروه شاهد (3 گوساله نر سالم) و گروه بیمار (3 گوساله نر مبتلاء به اسیدوز) به صورت مقایسهای مورد مطالعه قرار گرفتند. توالی یابی جفتی با استفاده از پلاتفرم illumine Hiseq2500 انجام شد. از نرم افزار Hisat2 برای همترازی خوانشها با ژنوم مرجع گاو و بسته نرم افزاری StringTi...
[ 18 ] - Investigation of Polymorphism in Exon II of MHC-DRB1 Gene Using PCR-RFLP Technique and Its Association with Growth Traits in Adani Goat
In the present study, blood samples were collected from 97 Adani goat from Bushehr province in order to identify the polymorphism in the exon II region of MHC-DRB1 gene (Major Histocompatibility Complex) and also, its association with growth traits (birth weight and 3 months weight). Genomic DNA was extracted from blood samples. A 279-bp fragment was amplified using polymerase chain reaction (P...
Co-Authors