M. R. Zamani

National Institute of Genetic Engineering and Biotechnology (NIGEB), Tehran, Iran

[ 1 ] - Overexpression of chimeric chitinase42 enhanced antifungal activity of Trichoderma harzianum against Fusarium graminearum

Evidence for the role of chitinases in biocontrol by Trichoderma species has been well documented.Chit42 lacks a chitin–binding domain (ChBD) which is involved in its binding activity to insoluble chitin. The objective of the present study was to enhance antifungal activity of T. harzianum by overexpression of wild type and hybrid forms of Chit42 containing chitin binding domain. To produce chi...

[ 2 ] - Antifungal activity of recombinant rice LTP2 on some phytopathogenic fungi

Plant lipid transfer proteins (LTPs) are members of the pathogenesis-related proteins (PR-14) and some of them exhibit activity against phytopathogenic fungi. To investigate whether rice LTP2 plays a role in antifungal activity, the coding region of an Iranian rice Ltp2 gene was cloned into expression vector pET24-d(+) and then expressed in Escherichia coli Rosetta strain (DE3). The potential a...

[ 3 ] - بهینه‌سازی شرایط کشت آنزیم خارج سلولی تجزیه‌کننده سیانید باکتری انتروباکتر ZS به روش سطح پاسخ

سیانید ترکیبی بسیار سمی و کشنده است که علیرغم این سمیت در بسیاری از صنایع استفاده می‌شود. فاضلاب صنایع در مقیاس وسیعی حاوی غلظت‌های بالایی از سیانید هستند؛ که به‌منظور تجزیه آن از روش‌های مختلف شیمیایی و فیزیکی استفاده می‌شود. این روش‌ها علاوه بر اینکه پرهزینه هستند؛ در صورت اختلاط با سایر مواد، ترکیبات خطرناک‌تری را نیز تولید می‌کنند. در مقابل استفاده از روش‌ تجزیه زیستی، علاوه بر کاهش هزینه‌ه...

[ 4 ] - انتقال ژن کیتیناز کایمری به کلزا و بیان القائی تراژن، تحت پیشبر ساختگی القاء پذیر با بیمارگر SP-FF

گیاهان به صورت دائمی، در محیط زیست شان، در معرض بیمارگرهای مختلف قرار دارند. بیان ژن های مقاومت توسط پیشبرهایی که صرفا در زمان حمله بیمارگرها فعال می شوند راهبردی بسیار کارآمد در تولید گیاهان تجاری مقاوم به بیماری می باشد. در این مطالعه، ژن مقاومت کیتیناز کایمری تحت کنترل پیشبر ساختگی القاء پذیر با بیمارگر SP-FF، به گیاه کلزا منتقل شده و پتانسیل این سازه، در مهار رشد بیمارگرهای قارچی مورد ارزی...

[ 5 ] - بیان هترولوگ آنزیم کیتیناز 36 کیلو دالتونی از قارچ Trichoderma atroviride در میزبان پروکاریوتی

آنزیم‌های کیتینولیتیک در تجزیه پسماندهای کیتینی نظیر پوسته سخت‌پوستان و دیواره سلولی قارچ‌ها و تولید الیگوساکاریدها از کیتین نقش دارند. خصوصیات کاتالیتیک آنها، این آنزیم‌ها را هدف مناسبی جهت استفاده درصنعت یا به عنوان بیوکنترل قرار داده‌ است. در این مطالعه جهت تکثیر و همسانه‌سازی ژن chit36 از جدایه بومی ایران Trichoderma atroviride PTCC5220، آغازگرهای اختصاصی (chit36pf/chi36r) طراحی و پس از تکث...

[ 6 ] - بهینه سازی شرایط بیان آنزیم کیتیناز42 کایمری در میزبان پروکاریوتی و مقایسه فعالیت آن با آنزیم کیتیناز42

آنزیم¬های کایمری از جمله پروتئین¬های مهندسی شده می¬باشند که از تغییر در ساختار آنزیم¬ها بدست می¬آیند. آنزیم¬های کیتینازی بدلیل توانایی در تجزیه ترکیبات کیتینی، در تولید پروتوپلاست قارچی، تبدیل زیستی shellfish waste به بخش‌های تک جزئی، تولید الیگوساکاریدها و کنترل قارچ¬های بیماریزا حائز اهمیت می-باشند. در این تحقیق پس از تکثیر ناحیه (chitin binding domain) ChBD کیتینازB باکتری Serratia marcesce...

[ 7 ] - ساخت ناقل بیانی pGCGi حاوی ژن GUS اینترون‌دار و تأیید آن با روش‌های ریزپرتابی و تزریق اگروباکتریوم

بیان موقت یک روش سریع و آسان در آنالیز بیان پروموتر است. این روش تحت تأثیر موقعیت ورود تراژن در ژنوم واقع نمی‌شود، زیرا این نکته می‌تواند بیان تراژن را در روش انتقال دایمی تحت تأثیر قرار دهد. بیان موقت از راه‌های مختلف نظیر: اگرواینفیلتراسیون، ریزپرتابی و وکتورهای ویروسی قابل انجام است. بیان موقت مبتنی بر اگروباکتریوم کارآیی بالا و قابل قبول در آنالیز بیان تراژن، خاموشی ژن، برهمکنش پاتوژن-میزبا...

[ 8 ] - بهینه‌سازی شرایط باززایی و تراریختی گیاه کلزا، رقم‌های Hyola 308 و RGS003

هدف از این تحقیق، بررسی غلظت مناسب BAP برای باززایی دو رقم مهم گیاه کلزا و همچنین مطالعۀ تأثیر زمان‌های پیش‌کشت، هم‌کشت و نیز غلظت‌های متفاوت استوسیرینگون (acetosyringon) بر تراریختی آنهاست. بدین منظور از دو رقم مهم کلزا Hyola 308) و (RGS003 که در تولید بذرهای مورد نیاز کشور استفاده می‌شود برای انتقال ژن گزارشگر GUS با واسطه آگروباکتریوم، استفاده شد. آزمایش‌ها در قالب طرح بلوک‌های کامل تصادفی ب...

[ 9 ] - Agrobacterium-Mediated Transformation of the Oryza sativa Thaumatin-Like Protein to Canola (R Line Hyola308) for Enhancing Resistance to Sclerotinia sclerotiorum

Background: Canola is an agro-economically oilseed crop. Yield loss due to fungal disease of stem rot caused by Sclerotinia sclerotiorum is a serious problem in canola cultivation. Thaumatin-like proteins are large groups of the pathogenesis-related proteins which provide resistance to the fungal infection in response to invading pathogens and play a key role in plant defense s...

[ 10 ] - Cloning, Overexpression and in vitro Antifungal Activity of Zea Mays PR10 Protein

Background: Plants have various defense mechanisms such as production of antimicrobial peptides, particularly pathogenesis related proteins (PR proteins). PR10 family is an essential member of this group, with antifungal, antibacterial and antiviral activities.Objective: The goal of this study is to assess the antifungal activity of maize PR10 against some of fungal phytopathogens.M...

[ 11 ] - Selectable Marker Gene Removal and Expression of Transgene by Inducible Promoter Containing FFDD Cis-Acting elements in Transgenic plants

Abstract Background: Selectable marker gene (SMG) systems are critical for generation of transgenic crops. Transgenic crop production Background: Selectable marker gene (SMG) systems are critical for generation of transgenic crops. Transgenic crop production without using SMG is not economically feasible. However, SMGs are non-essential once an intact transgenic plant has been established. Eli...

[ 12 ] - Enhancement of Trichoderma Harzianum Activity Against Sclerotinia sclerotiorum by Overexpression of Chit42

Backgoround: Plant diseases, caused by a wide range of phytopathogenic fungi, could be managed using of Trichoderma sp, as a biocontrol agent. Cell wall degrading enzymes like chitinase from T. harzianum are important means for fungal pathogen inhibition. Overexpression of these chitinase enzymes can i...

[ 13 ] - Transformation of Potato (Solanum tuberosumcv.Savalan) by Chitinase and Î²-1,3-Glucanase Genes of Myco-Parasitic Fungi Towards Improving Resistance to Rhizoctonia solani AG-3

Potato (Solanum tuberosum L.) an agro-economically important food crop in the world, is sensitive to many fungal pathogens including Rhizoctonia solani (AG-3), the causal agent of stem and root rot diseases. Chitinase and glucanase are cell wall degrading enzymes which have been shown to have high antifungal activity against a wide range of phytopathogenic fungi. In the present study, plasmid p...

[ 14 ] - جداسازی، شناسایی و بررسی ساختار ژن دفنسین (Def1) تربچه خوراکی (Raphanus sativus)

امروزه مطالعات نشان داده است که گیاهان، با تولید پپتیدهای ضدقارچی به نام دفنسین ها، سبب ایجاد منافذی درغشاء سلولی قارچ مهاجم و در نتیجه خروج ترکیبات سلولی به بیرون ازغشاء، تغییر در پتانسیل غشاء و نهایتاً مرگ سلولی را منجر می شوند. هدف این تحقیق جداسازی، شناسایی و بررسی ساختار ژن Def1 تربچه خوراکی (Raphanus sativus) با کلون کردن و تعیین توالی آن است. برای این منظور پس از استخراج DNA ژنومی به روش ...

[ 15 ] - In Silico Activity of AS1411 Aptamer Against Nucleolin of Cancer Cells

Background: It has been expected that AS1411 aptamer could work against the cancer cells. Although the general information is available, there is still lack of details for the purpose. Therefore, activity of AS1411 aptamer against the nucleolin (NCL) target of cancer cells has been investigated in current work at the molecular scale. In addition, the same features have been also investigated fo...

[ 16 ] - Investigation of Network of Proteins Effective in Esophageal, Gastric and Colon Cancers and Determination of Key Common Proteins Using In Silico Method

Introduction: The prevalence of gastrointestinal cancers, especially gastric and colorectal cancers, is increasing. Gastric cancer is the most common gastrointestinal cancer in Iran and the age of esophageal and colon cancers onset has decreased in Iran. Therefore, it is important to study the factors and proteins involved in these cancers. Use of computational tools is an effective way to stud...

[ 17 ] - Investigation of Network of Proteins Effective in Esophageal, Gastric and Colon Cancers and Determination of Key Common Proteins Using In Silico Method

[ 18 ] - Optimization of gene transfer with Agrobacterium to Bonab tomato cultivar using chitinase gene

Tomato is an important economic crop with nutritional and scientific value for study. Due to its agronomic importance and sensitivity to biotic and abiotic stresses, using new methods in breeding this crop is necessary. In this study, the effects of some factors, such as pre-cultivation time (1, 2, 3 and 4 days), Agrobacterium concentration (OD600nm = 0.4, 0.6, 0.8, and 1), inoculation time (5,...