Parinaz Ghadam
Department of Biotechnology, Faculty of Biological Sciences, Alzahra University, Tehran, Iran
[ 1 ] - One-step purification and characterization of alginate lyase from a clinical Pseudomonas aeruginosa with destructive activity on bacterial biofilm
Objective(s): Pseudomonas aeruginosais a Gram-negative and aerobic rod bacterium that displays mucoid and non-mucoid phenotype. Mucoid strains secrete alginate, which is the main agent of biofilms in chronic P. aeruginosa infections, show high resistance to antibiotics; consequently, the biological disruption of mucoid P. aeruginosa biofilms is an attractive area of study for researchers. Algin...
[ 2 ] - Rapid purification of HU protein from Halobacillus karajensis
The histone-like protein HU is the most-abundant DNA-binding protein in bacteria. The HU protein non-specifically binds and bends DNA as a hetero- or homodimer, and can participate in DNA supercoiling and DNA condensation. It also takes part in DNA functions such as replication, recombination, and repair. HU does not recognize any specific sequences but shows a certain degree of specificity to ...
[ 3 ] - Purification and Characterization of Alginate Lyase from Mucoid Pseudomonas aeruginosa Strain 214
Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen that causes a variety of infections in compromised patients. The ability of Pseudomonas aeruginosa to produce chronic infection is based in part on its ability to biosynthesis of biofilm, and alginate is the major polysaccharide in the synthesized biofilm. So alginate degradation is very essential in the dispersion of Pseudomonas aeruginosa bi...
[ 4 ] - جداسازی و تخلیص آلژینات لیاز پایدار حرارتی موثر بر آلژینات Pseudomonas aeruginosa بیمارستانی
آلژینات لیازباکتریایی آنزیمی پری پلاسمی است که در تولید و تخریب آلژینات اهمیت دارد. خصوصیات این آنزیم اعم از وزن مولکولی، pI، مقاومت حرارتی، pH و دمای بهینه و تاثیر بر آلژینات باکتریایی در سویه های یک باکتری هم متفاوت می باشد. در این مطالعه، به منظور دسترسی به آلژینات لیازی با خصوصیات ویژه و کار آمد در تخریب آلژینات باکتریایی، ازجدایه موکوئیدی Pseudomonas aeruginosa به دست آمده از خلط بیمار...
[ 5 ] - Production of Xanthanases by Paenibacillus spp.: Complete Xanthan Degradation and Possible Applications
Background: A number of microorganisms and their enzymes have been reported as xanthan depolymerizers. Paenibacillus species are well-known polysaccharide hydrolyzing bacteria. However, Paenibacillus alginolyticus and Paenibacillus sp.XD are the only species in the genus which are now known to degrade xanthan.Objectives: Complete biodegradation of the xan...
[ 6 ] - The Fluorescence Behavior and Stability of AgNPs Synthesized by Juglans Regia Green Husk Aqueous Extract
Particles with the size of 1-100 nm are known as nanoparticles (NPs). The widespread use of silver NPs (AgNPs) makes it familiar in different industries. They have unique properties as a result of their high surface to volume ratio, although aggregation of NPs interferes with their functions. This phenomenon has several side effects on the environment, the amount of which may depend on t...
[ 7 ] - ارزیابی اثر هم افزایی آنزیم آلژینات لیاز نوترکیب باکتریایی و آنتی بیوتیک های رایج درمانی بر رشد سلول های پلانکتونی سودوموناس آئروجینوسا
سابقه و هدف: باکتری سودوموناس آئروجینوسا پاتوژن فرصت طلبی است که آلژینات، یکی از مهمترین فاکتور های بیماری زایی این باکتری محسوب می شود. این مطالعه با هدف سنجش اثر هم افزایی آلژینات لیاز نوترکیب باکتریایی و آنتی بیوتیک های رایج در درمان عفونت های سودوموناسی بر رشدسلول های پلانکتونی سودوموناس آئروجینوساانجام شد. مواد و روش ها: در مط...
[ 8 ] - Biochemical and computational study of an alginate lyase produced by Pseudomonas aeruginosa strain S21
Objective(s): Alginates play a key role in mucoid Pseudomonas aeruginosa colonization, biofilm formation, and driving out of cationic antibiotics. P. aeruginosa alginate lyase (AlgL) is a periplasmic enzyme that is necessary for alginate synthesis and secretion. It also has a role in depolymerization of alginates. Using AlgLs in cystic fibrosis patients along with anti...
[ 9 ] - بررسی خصوصیات آنزیم پراکسیداز و تهیه نانوذره پروتئینی از آن با روش محاسباتی و آزمایشگاهی
ساختارهای نانوپروتئینی میتوانند توسط توانایی ذاتی خودتجمعی مولکولها تشکیل شوند که این توانایی می تواند بهوسیله حدواسطها اصلاح گردد. در میان عوامل خودتجمعی ذاتی پروتئین ها، هیدروفوبیسیته مهمترین عامل است. مولکولهایحدواسطی مانند گلوتارآلدئید می تواند باعث تجمع پروتئینی و تشکیل نانوذره گردند. در این پژوهش از نرم افزار Aggrescan 3D برای بررسی پروتئینهایی که خاصیت خودتجمعی دارند استفاده شد و ...
Co-Authors