Mostafa Rezaei-Tavirani

[ 1 ] - Metabolomics diagnostic approach to mustard airway diseases: a preliminary study

Objective(s): This study aims to evaluate combined proton nuclear magnetic resonance (1H NMR) spectroscopy and gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) metabolic profiling approaches, for discriminating between mustard airway diseases (MADs) and healthy controls and for providing biochemical information on this disease. Materials and Methods: In the present study, analysis of serum samples ...

[ 2 ] - Introducing Potential Key Proteins and Pathways in Human Laryngeal Cancer: A System Biology Approach

The most common malignant neoplasm of the head and neck region is laryngeal cancerwhich presents a significant international health problem. The present study aims to screenpotential proteins related to laryngeal cancer by network analysis to further understandingdisease pathogenesis and biomarker discovery. Differentially expressed proteins were extractedfrom literatures of laryngeal cancer th...

[ 3 ] - Ethanol and Cancer Induce Similar Changes on Protein Expression Pattern of Human Fibroblast Cell

Abstract Ethanol has a vast consumption around the world. Many researches confirmed some adverse effect of this component on human health. In addition, recent studies showed significant alteration in both cellular population, and protein profile of human foreskin fibroblast cell line (HFFF2) in the specific dosage of ethanol. Here, the role and interaction of some proteins (characterized by sig...

[ 4 ] - Introducing Potential Key Proteins and Pathways in Human Laryngeal Cancer: A System Biology Approach

The most common malignant neoplasm of the head and neck region is laryngeal cancerwhich presents a significant international health problem. The present study aims to screenpotential proteins related to laryngeal cancer by network analysis to further understandingdisease pathogenesis and biomarker discovery. Differentially expressed proteins were extractedfrom literatures of laryngeal cancer th...

[ 5 ] - Ethanol and Cancer Induce Similar Changes on Protein Expression Pattern of Human Fibroblast Cell

Abstract Ethanol has a vast consumption around the world. Many researches confirmed some adverse effect of this component on human health. In addition, recent studies showed significant alteration in both cellular population, and protein profile of human foreskin fibroblast cell line (HFFF2) in the specific dosage of ethanol. Here, the role and interaction of some proteins (characterized by sig...

[ 6 ] - جداسازی سلول‌های بنیادی مزانشیمال بافت اندومتریال و بررسی بیان مارکرهای اختصاصی سلول‌های بنیادی در قیاس با سلول‌های بنیادی مزانشیمی مغز استخوان

چکید ه سابقه و هدف سلول‌های بنیادی انسانی در بالغین، فاقد خصوصیات اختصاصی بافت هستند و در سلول درمانی و مهندسی بافت از جایگاه ویژه‌ای برخوردار می‌باشند. در تحقیق حاضر، سلول‌های بنیادی از بافت اندومتر تخلیص و به منظور تعیین ماهیت با سلول‌های بنیادی مزانشیمی مغز استخوان مورد مقایسه قرار گرفت. مواد و روش‌ها در یک مطالعه تجربی 5 نمونه بافت اندومتر و آسپیره خون مغز استخوان از اهداکنندگان س...

[ 7 ] - اثر تضعیف کننده عصاره آبی اسطوخودوس بر یادگیری فضایی موش های صحرایی آلزایمریک

سابقه و هدف: آلزایمر نوعی بیماری پیش رونده مغزی است که در آن نورون ها تخریب شده و فرد دچار نقصان حافظه می شود. تحقیقات زیادی به یافتن درمان مناسب و مؤثر برای آلزایمر اختصاص داده شده است. در این مطالعه اثر عصاره گیاه اسطوخودوس بر یادگیری موش های صحرایی آلزایمری در ماز آبی موریس بررسی شد. روش بررسی: در این مطالعه تجربی، 40 سر موش صحرایی نر بالغ به صورت تصادفی در 4 گروه قرار گرفتند: گروه سالم دری...

[ 8 ] - آنالیز شبکه برهمکنش پروتئین - پروتئین بر اساس ژن‌های تغییر بیان یافته در مایع مغزی نخاعی برای بیماری مالتیپل اسکلروزیس

هدف: ام.اس شایع‌ترین بیماری تخریب میلین سیستم عصبی مرکزی است. روش‌های جدید، برای فهم بهتر بیماری‌زایی و معرفی اهداف دارویی جدید ضروری می‌باشند. هدف این مطالعه، استفاده از روش شبکه زیستی به منظور شناسایی نشانگرهای کلیدی جدید درگیر در بیماری‌زایی ام.اس بود. مواد و روش‌ها: در این مطالعه، پروفایل بیان ژن مایع مغزی نخاعی مربوط به 26 بیمار تازه مبتلا شده به ام.اس و 18 فرد کنترل از پایگاه داده Array E...

[ 9 ] - بررسی شبکه پروتئینی پروتئین‌‌های دخیل در بیماری قلبی-عروقی

هدف: بیماری قلبی- عروقی (Cardiovascular disease) که قلب و رگ‌های قلبی را شامل می‌شود، جزء شایع‌ترین علل مرگ‌ها در جهان است و متاسفانه محدودیت در تشخیص زودرس بیماری وجود دارد. در این مطالعه، شبکه پروتئینی به منظورکشف بیومارکرهای اختصاصی برای تشخیص زودرس بیماری و معالجه به موقع بررسی گردید. مواد و روش‌ها: در این مطالعه، پروتئین‌های دخیل در بیماری قلبی-عروقی با استفاده از پایگاه‌های داده Polys...

[ 10 ] - آنالیز شبکه برهم کنش پروتئین - پروتئین سلول‌های فیبروبلاست انسانی تیمار شده با الکل اتانول

سابقه و هدف: مطالعات انجام شده نشان می‌دهد که اتانول بیان پروتئین‌ها متعددی را در سلول‌های فیبروبلاست تغییر می‌دهد. تعدادی از این پروتئین‌ها از فاکتورهای مهم در سرطان‌زایی هستند. بنابراین، آنالیز نقش عمل‌کردی و برهم‌کنش این دسته از پروتئین‌ها به منظور شناسایی مکانیسم‌های عمل‌کردی و سرطان‌زایی الکل دارای اهمیت است. مواد و روش‌ها: در این تحقیق با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape و الگوریتم‌های وا...

[ 11 ] - بررسی ویژگی‌های توپولوژیکی ژن‌های تغییر بیان یافته خون در شبکه برهم کنش پروتئین- پروتئین برای بیماری دیابت نوع 1

سابقه و هدف: بیماری دیابت نوع 1 در نتیجه تخریب خودایمنی سلول‌های بتا تولید‌کننده انسولین در پانکراس ایجاد می‌شود. برای گسترش درمان بیماری، شناسایی نشانگرهای درمانی کارآمد مورد نیاز است. روش‌های سیستم بیولوژی سبب فهم بهتری از عوامل عملکردی در بیماری می‌گردند. هدف این مطالعه، جستجوی نشانگرهای کاندید در این بیماری با بررسی ویژگی‌های توپولوژیکی زیرشبکه حاصل از تلفیق داده‌های بیان ژن و برهمکنش پروت...

[ 12 ] - آنالیز متابولومیکس بر اساس رزونانس مغناطیس هسته در بیماران در معرض قرار گرفته با گاز خردل با استفاده از روش رندوم فارست

سابقه و هدف: متابولومیک تکنیکی توانمند برای تعیین بیومارکرهاست. در این تحقیق، پروفایل متابولومیکی متمایز بین سطوح مختلف بیماران در معرض قرار گرفته با گاز خردل گوگردی تعیین شد. مواد و روش‌ها: از اسپکتروسکپی رزونانس مغناطیس هسته به‌منظور آنالیز نمونه‌های سرم از 17 بیمار نرمال شیمیایی و 17 بیمار با آسیب ریوی شدید استفاده شد. سپس، آنالیز آماری چند‌متغیره با استفاده از رندوم فارست بر روی گروه آموزش...

[ 13 ] - پاتوفیزیولوژی، ژنتیک و روش‌های درمانی اختلال وسواس- اجباری

سابقه و هدف: اختلال وسواس- اجباری ( OCD ) چهارمین اختلال شایع روانی است که هم‌راه با افکار یا انجام اعمال تکراری و آزار‌دهنده یا هر دو حالت با هم می‌باشد که موجبات بروز مشکلات جدی در روابط فردی و اجتماعی شخص می‌گردد. در گذشته شناخت پاتوفیزیولوژی دقیقی از بیماری‌های روانی وجود نداشت تا این‌که در سال‌های اخیر با استفاده از تکنیک‌های مولکولی پیشرفته نظیر ژنومیکس، پروتئومیکس و متابولومیکس تحول زی...

[ 14 ] - نقش امیکس ها در تحقیقات بالینی- دارویی

Completion of the human genome project revealed that the molecular mechanisms of cellular responses to different situations cannot be predicted from the sequence of their genes. Hence, most biological researches are focused on the roles of proteins which are much more challenging tasks. Omics technologies, instead of analyzing individual components of an organism by conventional biochemical met...

[ 15 ] - بررسی تاثیر تمرینات ورزش هوازی بر افراد دارای اضافه وزن نوجوان با مطالعه‌ی شبکه‌ی بر هم کنش پروتئین- پروتئین

مقدمه: با افزایش وزن احتمال ابتلا به بیماری‌های قلبی مختلف افزایش می‌یابد. ورزش در مهار چاقی موثر است، اما مکانیسم مولکولی این اثر به خوبی شناخته نشده است. در این مطالعه، تغییر بیان پروتئین‌های کلیدی در افراد دارای اضافه وزن بعد از انجام تمرینات ورزشی هوازی، شناسایی و رتبه‌بندی و تحلیل ‌شد. مواد و روش‌ها: پروتئین‌های تغییر بیان یافته در عضله اسکلتی نوجوانان دارای اضافه وزن (گزارش شده در سال 2...

[ 16 ] - Introducing Transthyretin as a Differentially Expressed Protein in Washing Subtype of Obsessive-Compulsive Disorder

Introduction: Obsessive-Compulsive Disorder (OCD) as one of the important mental problems is valuable topic for proteomic research studies to better understand the underlying mechanisms of this disorder.  Methods: In this paper, gel-based proteomic was used to investigate the proteome profile of 16 female patients with OCD, washing subtype before and after treatment with fluoxetine and co...

[ 17 ] - Serum Proteomic Profiling of Obsessive-Compulsive Disorder, Washing Subtype: A Preliminary Study

Introduction: Obsessive-Compulsive Disorder (OCD) is a disabling mental condition that its proteomic profiling is not yet investigated. Proteomics is a valuable tool to discover biomarker approaches. It can be helpful to detect protein expression changes in complex disorders such as OCD. Methods: Here, by the application of 2D gel electrophoresis (2DE), a pilot study of serum proteome profile ...

[ 18 ] - Assessment of Correlation Between miR-210 Expression and Pre-Eclampsia Risk: A Meta-Analysis

Background: Pre-eclampsia (PE) is a pregnancy disorder characterized by hypertension and proteinuria. The evidence has suggested that microRNAs (miRs) are associated with pre-eclampsia pathogenesis; however, these results are inconsistent. The aim of this study was to assess the association between miR-210 expression and PE risk. Methods: Previous studies were selected using PubMed, Scopus, ...

[ 19 ] - Serum-based metabolic alterations in patients with papillary thyroid carcinoma unveiled by non-targeted 1H-NMR metabolomics approach

Objective(s): As the most prevalent endocrine system malignancy, papillary thyroid carcinoma had a very fast rising incidence in recent years for unknown reasons besides the fact that the current methods in thyroid cancer diagnosis still hold some limitations. Therefore, the aim of this study was to improve the potential molecular markers for diagnosis of benign and malignant thyroid nodules to...

[ 20 ] - Protein-Protein Interaction Analysis of Common Top Genes in Obsessive-Compulsive disorder (OCD) and Schizophrenia: Towards New Drug Approach

Comorbidty is common among psychiatric disorders including obsessive-compulsive disorder and schizophrenia with a high rate. Many studies suggested that the disorders may have same etiological bases. In this regard, shared pathways of glutamate, dopaminergic, and serotonin are the known ones. Here, the common significant genes are examined to understand the possible molecular origin of the diso...

[ 21 ] - Proteomics Applications in Health: Biomarker and Drug Discovery and Food Industry

Advancing in genome sequencing has greatly propelled the understanding of the living world, however, it is insufficient for full description of a biological system. Focusing on, proteomics has emerged as another large-scale platform for improving the understanding of biology. Proteomic experiments can be used for different aspects of clinical and health sciences such as food technology, biomark...

[ 22 ] - Protein-Protein Interaction Analysis of Common Top Genes in Obsessive-Compulsive disorder (OCD) and Schizophrenia: Towards New Drug Approach

Comorbidty is common among psychiatric disorders including obsessive-compulsive disorder and schizophrenia with a high rate. Many studies suggested that the disorders may have same etiological bases. In this regard, shared pathways of glutamate, dopaminergic, and serotonin are the known ones. Here, the common significant genes are examined to understand the possible molecular origin of the diso...

[ 23 ] - Proteomics Applications in Health: Biomarker and Drug Discovery and Food Industry

Advancing in genome sequencing has greatly propelled the understanding of the living world, however, it is insufficient for full description of a biological system. Focusing on, proteomics has emerged as another large-scale platform for improving the understanding of biology. Proteomic experiments can be used for different aspects of clinical and health sciences such as food technology, biomark...

[ 24 ] - بررسی ارتباط بین شدت بیماریزایی با میزان اتصال و حضور ژن های توکسین در هلیکوباکتر پیلوری

مقدمه: شدت عوارض بالینی ایجاد شده در بیماران آلوده به هلیکوباکتر پیلوری بسته به تنوع ژنتیکی سویه های باکتری متفاوت می باشد. کلونیزاسیون و اتصال باکتری به میزبان به عنوان اولین مرحله بیماریزایی مطرح می باشد. این مطالعه با هدف بررسی فاکتورهای بیماریزا در سویه های هلیکوباکتر و قدرت چسبندگی آن ها به رده سلولی AGS و ارتباط این چسبندگی با شدت عوارض بالینی در بیماران آلوده به این سویه ها انجام شده است...

[ 25 ] - اثر عصاره آبی اسطوخدوس بر پاک سازی پلاک های آمیلوئیدی

مقدمه: یکی از عوامل دخیل در ایجاد بیماری آلزایمر تجمع پپتیدهای آمیلوئید بتا و تشکیل پلاک های آمیلوئیدی در مغز می باشد. کاهش میزان این پلاک ها سبب بهبود بیماری آلزایمر می شود. عوامل مختلفی از جمله فاگوسیتوز توسط سلول های سیستم ایمنی، آنزیم های پروتئولیتیک و کبد در پاک سازی مغز از پلاک های آمیلوئیدی نقش دارند. در مطالعات قبلی نشان دادیم که عصاره آبی اسطوخدوس سبب بهبود حافظه موش های صحرایی آلزایمر...

[ 26 ] - تاثیر تب بر نقش آلبومین سرم انسانی در تامین فشار اسمزی خون

این مقاله فاقد چکیده میباشد.

[ 27 ] - بررسی بیومارکرهای کارسینومای سلول‌های بازال با استفاده از آنالیزهای پروتئومیکی

سابقه و هدف: کارسینومای سلول‌های بازال، یکی از شایع‌ترین نوع سرطان‌های پوست غیر ملانومایی انسانی محسوب می‌شود. با مطالعه فاکتورهای پروتئینی آن و شناسایی بیشتر تغییراتی که در روند سرطانی‌شدن پوست رخ می‌دهند، می‌توان در روند پیشگیری و درمان، به بیماران کمک مؤثری نمود. هدف از انجام این پژوهش، دستیابی به بیومارکرهای پروتئینی است که در تشخیص و درمان کارسینومای سلول‌های بازال مؤثر باشند. مواد و روش‌ه...

[ 28 ] - بررسی بیومارکرهای کارسینومای سلول‌های بازال با استفاده از آنالیزهای پروتئومیکی

سابقه و هدف: کارسینومای سلول‌های بازال، یکی از شایع‌ترین نوع سرطان‌های پوست غیر ملانومایی انسانی محسوب می‌شود. با مطالعه فاکتورهای پروتئینی آن و شناسایی بیشتر تغییراتی که در روند سرطانی‌شدن پوست رخ می‌دهند، می‌توان در روند پیشگیری و درمان، به بیماران کمک مؤثری نمود. هدف از انجام این پژوهش، دستیابی به بیومارکرهای پروتئینی است که در تشخیص و درمان کارسینومای سلول‌های بازال مؤثر باشند. مواد و روش‌ه...

[ 29 ] - Factor V Leiden, MTHFR C677T and Prothrombin Gene Mutation G20210A in Iranian Patients with Venous Thrombosis

Background: Factor V Leiden, Prothrombin gene (G20210A) and MTHFR (C677T) polymorphism are the main biomarkers for evaluation of tendency for venous thromboembolism. We aimed to investigate the frequency of mutations in factor V Leiden, Prothrombin G20210A and MTHFR C677T and identify the genetic status for these mutations in patients with venous thrombosis. Methods: This study was carried out...

[ 30 ] - Introducing Genes With Significant Role in Migraine: An Interactomic Approach

Introduction: Migraine is a severe kind of headache with the chance hereditary of 50%. Molecular studies can promote understanding of migraine pathophysiology. One of which is bioinformatics approach that could provide additional information related to the identified biomarkers. Methods: In this research, migraine genes are studies in terms of interaction pattern to introduce important indivi...

[ 31 ] - Introducing Critical Pain-related Genes: A System Biology Approach

Introduction: Pain is valuable in diagnosis and also warning of the patients. Many molecular reagents are introduced which are related to pain. In this research, the pain-related genes are screened to identify the critical ones. Methods: First, the pain-related genes were pulling out from the STRING database, and Cytoscape software was used to make the interactome unit. Then the central genes...

[ 32 ] - Postmortem Study of Molecular and Histological Changes in the CA1 Hippocampal Region of Chronic Methamphetamine User

Methamphetamine (Meth) is recognized as one of the most important new distributedabused drug that causes severe damage to the different parts of the brain, especiallyhippocampus. Previous studies have demonstrated that Meth can induce apoptosis and celldeath in the brain. In this study, we evaluated the long-term effects of Meth abuse in theCA1 region of postmortem hippo...

[ 33 ] - Postmortem Study of Molecular and Histological Changes in the CA1 Hippocampal Region of Chronic Methamphetamine User

Methamphetamine (Meth) is recognized as one of the most important new distributedabused drug that causes severe damage to the different parts of the brain, especiallyhippocampus. Previous studies have demonstrated that Meth can induce apoptosis and celldeath in the brain. In this study, we evaluated the long-term effects of Meth abuse in theCA1 region of postmortem hippo...

[ 34 ] - An Overview on Probiotics as an Alternative Strategy for Prevention and Treatment of Human Diseases

Aims: Probiotics are viable and useful microorganisms, which are beneficial factors for human and animal health by altering their microbial flora. Most of the probiotics belong to a large group of bacteria in the human gastrointestinal tract. There are several clinical shreds of evidence that show anti-carcinogenic effects of probiotics through altering digestive enzymes, inhibition of carcinog...

[ 35 ] - Pharmaceutical Advances and Proteomics Researches

Proteomics enables understanding the composition, structure, function and interactions of the entire protein complement of a cell, a tissue, or an organism under exactly defined conditions. Some factors such as stress or drug effects will change the protein pattern and cause the present or absence of a protein or gradual variation in abundances. Changes in the proteome provide a snapshot of the...

[ 36 ] - An Overview on Probiotics as an Alternative Strategy for Prevention and Treatment of Human Diseases

Aims: Probiotics are viable and useful microorganisms, which are beneficial factors for human and animal health by altering their microbial flora. Most of the probiotics belong to a large group of bacteria in the human gastrointestinal tract. There are several clinical shreds of evidence that show anti-carcinogenic effects of probiotics through altering digestive enzymes, inhibition of carcinog...

[ 37 ] - Pharmaceutical Advances and Proteomics Researches

Proteomics enables understanding the composition, structure, function and interactions of the entire protein complement of a cell, a tissue, or an organism under exactly defined conditions. Some factors such as stress or drug effects will change the protein pattern and cause the present or absence of a protein or gradual variation in abundances. Changes in the proteome provide a snapshot of the...

[ 38 ] - Assessment of Saffron Neuroprotective Properties in Rat Retina versus Light Damage

Background and objectives: Crocus sativus L. (Iridaceae) commonly known as saffron, is a popular spice which is used for its pleasant aroma and favored color. Regarding the previous reports about the neuroprotective be...

[ 39 ] - Evaluation of Anticancer and Neuroprotective Properties of Curcumin: a Network Analysis

Background and objectives: Curcumin as a medicinal substance has shown effective in different kinds of diseases especially cancer. To understand its underlying mechanism, molecular complementary study of differentially expressed microRNAs (DEMs) could assist. In this view, regulatory network analysis of DEMs of melanoma cancer treated with curcumin versus the untreated male <em...

[ 40 ] - Investigating the effects of ibuprofen on the gene expression profile in Hippocampus of mice model of Alzheimer’s disease through bioinformatics analysis

Non-steroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs) identified effective in many diseases. One of which is neurodegenerative diseases including Alzheimer disease (AD). In this study gross alteration of gene expression in AD mice by ibuprofen treatment is investigated via Protein-protein interaction network (PPI) analysis. Expression profiling of microarray dataset GSE67306 was retrieved from GEO dat...

[ 41 ] - Investigating the effects of ibuprofen on the gene expression profile in Hippocampus of mice model of Alzheimer’s disease through bioinformatics analysis

Non-steroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs) identified effective in many diseases. One of which is neurodegenerative diseases including Alzheimer disease (AD). In this study gross alteration of gene expression in AD mice by ibuprofen treatment is investigated via Protein-protein interaction network (PPI) analysis. Expression profiling of microarray dataset GSE67306 was retrieved from GEO dat...

[ 42 ] - Bioinformatics Investigation and Contribution of Other Chromosomes Besides Chromosome 21 in the Risk of Down Syndrome Development

Introduction: Down syndrome as a genetic disorder is a popular research topic in molecular studies. One way to study Down syndrome is via bioinformatics. Methods: In this study, a gene expression profile from a microarray study was selected for more investigation. Results: The study of Down syndrome patients shows specific genes with differential expression and network centrality properties....

[ 43 ] - Obsessive-Compulsive Disorder Interactome Profile Analysis: A Perspective From Molecular Mechanism

Introduction: Obsessive-Compulsive Disorder (OCD) is one of the complex neuropsychiatric conditions. This disorder disables individuals in many different aspects of their personal and social life. Interactome analysis may provide a better understanding of this disorder’s molecular origin and its underlying mechanisms. Methods: In this study, the OCD-associated genes were extracted from the lit...

[ 44 ] - Introducing Albumin and Interleukin 6 As Common Critical Dysregulated Protein Between Migraine and Gliosarcoma

Introduction: It is reported that migraine may be risk factor of brain cancers. Since the one of the best ways to assess this possible relationship is molecular mechanism study, here the common central dysregulated proteins between these diseases are investigated via network analysis. Methods: The dysregulated proteins of migraine and gliosarcoma are extracted from STRING database and interact...