Jafar Amani

[ 1 ] - Immunogenicity of chimeric MUC1-HER2 vaccine against breast cancer in mice

Objective(s): Breast cancer is one of the most common cancers in the world and is on the increase. MUC1 and HER2 as tumor-associated antigens (TAAs) are abnormally expressed to some extent in 75–80% of breast cancers. In our present research, a novel chimeric MUC1-HER2 (HM) protein was designed and used to study whether an immune response can be generated against these TAAs. In vitro analysis ...

[ 2 ] - In silico analysis of chimeric TF, Omp31 and BP26 fragments of Brucella melitensis for development of a multi subunit vaccine candidate

Objective(s):Brucellosis, especially caused by Brucella melitensis, remains one of the most common zoonotic diseases worldwide with more than 500,000 human cases reported annually. The commonly used live attenuated vaccine in ovine brucellosis prophylaxis is B. melitensis Rev1. But due to different problems caused by the administration of this vaccine, a protective subunit vaccine against B. me...

[ 3 ] - Comparing Rapid and Specific Detection of Brucella in Clinical Samples by PCR-ELISA and Multiplex-PCR Method

Background: Rapid diagnosis and differentiation of Brucella is of high importance due to the side effects of antibiotics for the treatment of brucellosis. This study aimed to identify and compare PCR-ELISA as a more accurate diagnositc test with other common molecular and serological tests. Methods: ...

[ 4 ] - Immunogenic evaluation of chimeric recombinant protein against ETEC, EHEC and Shigella

Diarrheal diseases still remain health problem worldwide and out of many bacteria responsible for, Shigella and pathogenic Escherichia cause the most diarrheas in the world. Shigellacause bacterial dysenteries and shigellosis through invasion where the most effective proteins for pathogenesis is Ipac. Critical virulence protein for ETEC infection is CFA/I with two subunits called cfab and cfae....

[ 5 ] - Designing and analyzing the structure of Tat-BoNT/A(1-448) fusion protein: An in silico approach

Clostridium botulinum type A (BoNT/A) produces a neurotoxin recently found to be useful as an injectable drug for the treatment of abnormal muscle contractions. The catalytic domain of this toxin which is responsible for the main toxin activity is a zinc metalloprotease that inhibits the release of neurotransmitter mediators in neuromuscular junctions. A cell penetrating cationic peptide, Tat, ...

[ 6 ] - ارزیابی گیاه تراریخت کلزای بیان‌کننده پروتئین نوترکیب از زیر واحد B سم‌های STX2 و CTX باکتری‌های اشریشیا کلای و ویبریوکلرا

بیماری‌های اسهالی یکی از مهمترین معضلات بهداشت جهانی، در تمامی رده‎های سنی مطرح می‌باشند. از میان عوامل ایجاد کننده این بیماری‌ها می-توان به Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) وVibrio cholerae اشاره کرد. در گروه EHEC سروتایپ O157:H7، شایع‌ترین عامل ایجاد اسهال، از طریق سم STX2 ایجاد بیماری می‌کند. در ویبریوکلرا نیز توکسین CTX منجر به بروز بیماری می‌گردد. هر دوی این سموم دارای ساختار AB5...

[ 7 ] - تولید پروتئین دوگانه EspA- Tir از باکتری اشریشیا کلی O157:H7 در گیاه توتون (Nicotiana tobbacum)

باکتری E.coli O157:H7 یک پاتوژن مهم انسان و حیوان است که در انسان موجب بروز اسهال خونریزی دهنده و سندرم اورمی همولتیک (HUS) میشود. اتصال به سلولهای میزبان اولین گام در تثبیت این باکتری است که به‌واسطه سیستم ترشحی نوع III (T3SS) و از طریق میانکش بین پروتئینهای ترشحی صورت میگیرد. در این میان EspA به‌عنوان جزء اصلی تشکیل‌دهنده سیستم ترشحی است و ارتباط تنگاتنگی با اتصال اولیه باکتری به سلول می...

[ 8 ] - کلونینگ و بیان ژن muc1 در میزبان پروکاریوتی به منظور بکار گیری در تشخیص زود هنگام سرطان سینه

زمینه و هدف: سرطان سینه دومین و شایع‌ترین علت مرگ در میان زنان جهان می‌باشد. غدد پستانی طبیعی و کارسینوماهای پستانی باید تحت کنترل عوامل نظارتی، فعال‌کننده‌ها و مهارکننده‌ها در داخل بافت سینه و همچنین یک سری فاکتورهای رشد، گیرنده‌ها و پروتئین‌ها در خارج از بافت سینه باشند. سطوح آنتی ژن‌های مرتبط با تومور می‌توانند به عنوان شاخص پیش‌بینی در درمان این بیماری استفاده شوند. از روش های نوین درمانی ا...

[ 9 ] - تشخیص توکسین حساس به حرارت باکتری اشریشیاکلی انتروتوکسیژنیک با استفاده از تکنیک PCR-ELISA

زمینه و هدف : اشریشیاکلی انتروتوکسیژنیک (ETEC) شایع‌ترین عامل اسهال باکتریایی در سراسر دنیا است. باکتری ETEC در سطح سلول‌های اپی‌تلیالی روده کوچک کلنیزه شده و بعد انتروتوکسین مقاوم به حرارت (ST) و یا حساس به حرارت (LT) را ترشح می‌کند که با ورود به سلول‌ها باعث خروج آب و الکترولیت از سلول‌های اپی‌تلیالی روده شده و نهایتاً موجب اسهال می‌گردد. این مطالعه به منظور تشخیص توکسین LT باکتری اشریشیاکلی ا...

[ 10 ] - شناسایی و بررسی سروتیپ های سالمونلا تیفی موریوم، اینفنتیس و انتریتیدیس در نمونه‌های بالینی از مراکز درمانی سطح استان کرمان

زمینه و اهداف: سالمونلوزیس یکی از بیماری‌های مهم عفونی و به‌عنوان یک بیماری مشترک در انسان و حیوانات می‌باشد که اهمیت شناخت و کنترل این‌گونه را ضروری‌تر می‌کند. ژن‌های خانه‌دار، ژن‌هایی هستند که به‌طورمعمول برای حفظ و بقای عملکرد سلول‌ها ضروری می‌باشند و می‌توانند به‌عنوان ژن‌های تشخیصی در غربالگری عوامل باکتریایی مدنظر قرار گیرند. هدف از این مطالعه بررسی ژن‌های خانه‌دار fliC sdf1, و fljB برای...

[ 11 ] - تشخیص ژن Stx1 درشیگلا دیسانتریه جدا شده از نمونه های بالینی در استان مازندران با استفاده ازتکنیک PCR-ELISA

هدف: در میان باکتریهای خانواده آنتروباکتریاسه، شیگلا دیسانتریه بدلیل تولید توکسین پروتئینی تحت عنوان شیگاتوکسین با داشتن فعالیت سیتوتوکسینی و نوروتوکسینی موجب بیماریهایی اسهال، گاستروانتریت و اختلال ا نعقاد داخل عروقی می شود که امروزه به عنوان مهمترین چالش برای سلامتی انسانها مطرح می باشند. هر چند روشهای کلاسیک ومتداول میکروبیولوژی برای تشخیص حساس واختصاصی می باشند اما محدودیت های خاص خود را ...

[ 12 ] - تشخیص ژن های Stx با استفاده از Multiplex PCR در نمونه های بالینی

زمینه و اهداف: تاکنون روش های مختلف تشخیصی از جمله کشت سلولی، الایزا، RFLP برای شناسایی شیگاتوکسین ها بکار رفته ولی باتوجه به داشتن هزینه زیاد، صرف زمان زیاد وداشتن حساسیت پائین کمتر مورد توجه واقع شده اند دراین تحقیق برای شناسایی ژن stx و از روش Multiplex PCR استفاده شد. مواد و روش کار: تاکنون روش های مختلف تشخیصی از جمله کشت سلولی، الایزا، RFLP برای شناسایی شیگاتوکسین ها بکار رفته ولی باتوجه...

[ 13 ] - کاربرد بیوانفورماتیک در مطالعات ایمنی‌شناسی

سیستم ایمنی انسان شامل انواع متنوعی از سلول¬ها و مولکول¬ها می¬باشد که در ارتباط تنگاتنگ با سایر سیستم¬های بدن می¬باشند. مقادیر افزاینده¬ی داده¬های تولید شده در دوره¬ی پساژنومیک بررسی این سیستم را پیچیده¬تر گردانده است. بنابراین نیاز به استفاده از رویکردهای محاسباتی و کامپیوتری جهت پردازش و تفسیر داده¬ها محسوس¬تر می¬باشد. ایمونوانفورماتیک به عنوان زیرمجموعه¬ای از بیوانفورماتیک رویکردی جدید با ا...

[ 14 ] - ارزیابی گیاه تراریخت کلزای بیان‌کننده پروتئین نوترکیب از زیر واحد B سم‌های STX2 و CTX باکتری‌های اشریشیا کلای و ویبریوکلرا

بیماری‌های اسهالی یکی از مهمترین معضلات بهداشت جهانی، در تمامی رده‎های سنی مطرح می‌باشند. از میان عوامل ایجاد کننده این بیماری‌ها می-توان به Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) وVibrio cholerae اشاره کرد. در گروه EHEC سروتایپ O157:H7، شایع‌ترین عامل ایجاد اسهال، از طریق سم STX2 ایجاد بیماری می‌کند. در ویبریوکلرا نیز توکسین CTX منجر به بروز بیماری می‌گردد. هر دوی این سموم دارای ساختار AB5...

[ 15 ] - تولید پروتئین دوگانه EspA- Tir از باکتری اشریشیا کلی O157:H7 در گیاه توتون (Nicotiana tobbacum)

باکتری E.coli O157:H7 یک پاتوژن مهم انسان و حیوان است که در انسان موجب بروز اسهال خونریزی دهنده و سندرم اورمی همولتیک (HUS) میشود. اتصال به سلولهای میزبان اولین گام در تثبیت این باکتری است که به‌واسطه سیستم ترشحی نوع III (T3SS) و از طریق میانکش بین پروتئینهای ترشحی صورت میگیرد. در این میان EspA به‌عنوان جزء اصلی تشکیل‌دهنده سیستم ترشحی است و ارتباط تنگاتنگی با اتصال اولیه باکتری به سلول می...

[ 16 ] - Designing and Expression of Recombinant Chimeric Protein Containing CtxB and OmpW from Vibrio Cholerae and Evaluation of Its Immunogenicity

Background: Cholera disease caused by Vibrio cholerae remains a major cause of morbidity and mortality throughout the world. Various strategies with different proteins as immunogens have been tried for vaccine development, none of which have been sufficiently effective to preclude cholera. Chimeric proteins, with their ability to present multiple antigens at the same time, can play important ro...

[ 17 ] - Immunogenicity of the Multi-Epitopic Recombinant Glycoproteins of Newcastle Disease Virus: Implications for the Serodiagnosis Applications

Background: Newcastle disease virus (NDV) is a dangerous viral disease, infecting a broad range of birds, and has a fatal effect on the poultry industries. The attachment and consequently fusion of the virus to the host cell membrane is directed by the two superficial glycoproteins, the hemagglutinin-neuraminidase (HN) and the fusion (F) which is considered as the important tar...

[ 18 ] - تولید پروتئین نوترکیب سیالیداز-کمپ و تهیه نانوذرات کایتوزان حامل آن به منظور استفاده بعنوان کاندیدای واکسن پروپیونی باکتریوم آکنه

سابقه و هدف: آکنه ولگاریس یکی از شایعترین بیماریهای پوستی است که فشار روحی زیاد و هزینه بالایی برای بیماران دارد. درمانهای موجود کارایی پایینی داشته و شامل آنتی بیوتیک ها و داروهای ضدالتهابی هستند که با توجه به ماهیت مزمن بیماری بویژه در سنین جوانی، عوارض زیادی از جمله مقاومت آنتیبیوتیکی و واکنشهای آلرژیک دارند. به همین دلیل یکی از رویکردهای جدید درمانی، استفاده از واکسن درمانی با کمک خود...

[ 19 ] - بیماری زائی و واکسن ها علیه اشرشیاکلی انتروتوکسیژنیک

سابقه و هدف: باکتری اشرشیاکلی انتروتوکسیژنیک(ETEC: Enterotoxigenic Escherichia coli)، یکی از عوامل شایع اسهال بوده و تلفات انسانی ناشی از آن حدود 157000 نفر در سال برآورد شده که معادل 9 درصد از مرگ و میرهای ناشی از اسهال می باشد. توسعه واکسن علیهETEC به عنوان سازوکار اولیه ایجاد مقاومت در برابر باکتری محسوب می شود. مطالعه حاضر با هدف بررسی اهمیت و بیماری زایی باکتری ETEC و تحقیقات در زمینه واک...

[ 20 ] - تشخیص اسینتوباکتر بائومانی با استفاده از روش PCR-ELISA

زمینه و هدف: اسینتوباکتر بومانی عامل عفونت های دستگاه تنفسی، دستگاه ادراری، خون و زخم ها به خصوص در بخش مراقبت های ویژه می باشد و توانایی کسب مقاومت دارا می باشد. به منظور تشخیص به موقع و پیگیری فرایند درمان این عفونت ها، لازم است که تکنیک ها به طور مستمر اصلاح شوند. با توجه به اینکه تاکنون مطالعه ای در زمینه شناسایی و جداسازی این باکتری در نمونه های بالینی در ایران با روش PCR-ELISA انجام نشده...

[ 21 ] - مقایسه اثر ایمنی زایی پروتئین های نوترکیبEIT و Stx2B متصل به نانو ذرات بر پایه کیتوزان در مدل حیوانی به عنوان کاندیدای نانوواکسن بر علیه E. coli O157:H7

Introdution: E. coli O157:H7 with its ability of quick implantation inside gastrointestinal tract that causes hemolytic uremic and bloody diarrhea in humans is an important subject to investigate. One of the effective ways to prevent these infections is using nanovaccines prepared from immunogenic recombinant protein from bacterial virulence factors. In this research, the chitosan encapsulated ...

[ 22 ] - تشخیص ژن اختصاصی eae باکتری انتروپاتوژنیک اشرشیاکلی با استفاده از روش نوین PCR-ELISA

Background and purpose: Enteropathogenic Escherichia coli from Enterobacteriaceae family is one of the most common causes of chronic diarrhea in children and infants. Polymerase Chain Reaction (PCR) method is commonly used for detection of enteropathogenic Escherichia coli species, but there are some disadvantages with this method due to the use of gel electrophoresis and staining with ethidium...

[ 23 ] - Immunogenic Evaluation of Bivalent Vaccine Candidate against Enterohemorrhagic and Enterotoxigenic Escherichia coli

Background: Caused by bacterial, viral, and parasitic pathogens, diarrhea is the second leading cause of death among children under five. Two strains of E. coli, namely Enterotoxigenic, ETEC and Enterohemorrhagic EHEC are the most important causes of this disease in developing countries. EHEC is a major causative agent of bloody diarrhea and hemorrhag...

[ 24 ] - Designing and Analyzing the Structure of DT-STXB Fusion Protein as an Anti-tumor Agent: An in Silico Approach

Background & Objective: A main contest in chemotherapy is to obtain regulator above the biodistribution of cytotoxic drugs. The utmost promising strategy comprises of drugs coupled with a tumor-targeting bearer that results in wide cytotoxic activity and particular delivery. The B-subunit of Shiga toxin (STxB) is nontoxic and possesses low immunogenicity that exactly binds to t...

[ 25 ] - Cloning and evaluation of gene expression and purification of gene encoding recombinant protein containing binding subunit of coli surface antigens CS1 and CS2 from Enterotoxigenic Escherichia coli

Background & Objective: Enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) is a major causative agent of diarrhea. Enterotoxins and the colonization factors (CFs) are major virulence factors in ETEC infections. The bacterium binds to the intestinal epithelial cell surface through colonization factors and produces enterotoxins that cause excessive fluid and electrolyte secretion in the lumen of the intesti...

[ 26 ] - Effect of recombinant Herceptin on the growth of breast cancer cells

Background and Objective: Breast cancer is one of the most common types of cancer among women. HER-2 molecule as the receptor of tyrosine kinase from the family of epithermal growth factor is a major cause of cancer. The Herceptin protein molecule, which is an anti-HER-2 antibody, can play an important role in the diagnosis and treatment of breast cancer. This study was done to subcloning of He...

[ 27 ] - Determination of PCR-ELISA Diagnostic Value in Comparison With Classical Methods and PCR to Detect Resistance to Methacillin

Background and Aims: High prevalence of Methicillin Resistant Staphylococcus Aureus isolates (MRSA) as well as the multi-drug resistance in this bacterium causes difficulties in the treatment of infections due to these bacteria. Hence, detection of MRSA isolates by rapid and accurate methods is necessary. PCR-ELISA is an accurate and molecular technique that is used for the detection of several...

[ 28 ] - The detection of Klebsiella pneumoniae 16srRNA specific gene by PCR-ELISA technique

Objective: Klebsiella Pneumoniae is one of the most important infection bacteria of the Enterobacteriaceae family. It is also the second factor of hospital bacteremia due to the gram negative bacteria after Escherichia coli. In this research, this bacteria with the private 16SrDNA gene, was identified through PCR-ELISA technique. Materials and Methods: In this method the dNTP labeled with Digox...

[ 29 ] - Design and Production of Recombinant TAT Protein Structure, Catalytic Domain of Diphtheria Toxin, and Evaluation of Its Effect on Cell Line

Background and Objectives: Cancer is one of the most deadly diseases in the present age and its conventional therapies have had low success. Toxin therapy of cancer is a new therapeutic approach, which has attracted the attention of pharmaceutical specialists. Diphtheria toxin consists of three functional, transducing, and binding domains, that the functional part inhibits protein synthesis and...

[ 30 ] - Evaluation of expression and titration of recombinant nucleocapsid protein as an immunogenic candidate against SARS-CoV2

Introduction: Covid-19 epidemic results from an infection caused by SARS-CoV2. Evolution-based analyses on the nucleotide sequences show that SARS-CoV2 is a member of the genus Beta-coronaviruses and its genome consists of a single-stranded RNA, encoding 16 proteins. Among the structural proteins, the nucleocapsid is the most abundant protein in virus structure, highly immunogenic, with sequenc...