A. Akhavan Sepahy
Department of Microbiology, Faculty of Biological Science, North Tehran Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
[ 1 ] - Bacterial diversity determination using culture-dependent and culture-independent methods
Mud volcanoes are taken into consideration by geologists and oil industry experts have given their association with oil and gas reserves and methane greenhouse gas production in hydrosphere and atmosphere. Gomishan mud volcano phenomenon in the southeastern edge of the Caspian Sea, given its oil and gas resources, has been studied by some geologists in terms of geology and tectonics but not in ...
[ 2 ] - Cytotoxic effect of pyocyanin on human pancreatic cancer cell line (Panc-1)
Objective(s): Pyocyanin, a blue-green pigment produced by Pseudomonas aeruginosa, interferes with host redox cycles, which can lead to generation of reactive oxygen species and progressive cellular oxidative damage. The aim of this study was to assess the influence of pyocyanin on human pancreatic cancer cell line.Materials and Methods: Polymerase Chain Reaction (PCR) was applied to confirm the...
[ 3 ] - Isolation and identification of halophilicbacteria from Urmia Lake in Iran
Halophiles are in all three domains of life: Archaea, Bacteria and Eucarya. Halophilic microorganisms in addition to form major part of life biodiversity can have many biotechnological applications. The objective of this research is isolation and identification of halophilic bacteria from Urmia Lake in Iran and the study of its bacterial biodiversity. After sampling of brines from Urmia Lake fr...
[ 4 ] - ارزیابی اثر عصاره الکلی آرتمیزیا اولیوریانا بر بیان ژنهای icaA، icaD وebps در استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متیسیلین: یک گزارش کوتاه
Background and Objectives: Expression of genes related to biofilm formation in methicillin-resistant staphylococcus aureus (MRSA) can play an effective role in biofilm formation and pathogenicity. Due to the significance of antimicrobial activity of Artemisia species against biofilm producer genes, this study aimed to evaluate the effect of ethanolic extract of Artemisia oliveriana on the...
[ 5 ] - مقایسه سویههای بومی باسیلوس سوبتیلیس و باسیلوس مگاتریوم جداشده از خاک در تولید ویتامین ریبوفلاوین
زمینه و هدف: ویتامین B2 (ریبوفلاوین) یک ویتامین زردرنگ و محلول در آب میباشد. هدف از انجام این مطالعه شناسایی سویههای باسیلوس جداشده از خاک با توانایی در تولید ریبوفلاوین با روش PCR میباشد. روش بررسی: نمونهبرداری از خاک بهصورت تصادفی طی 2 روز متمادی در هوایی معتدل صورت گرفت. نمونهبرداری از مناطق دور از آفتاب و از عمق 3 تا 10 سانتیمتری سطح خاک انجام شد. سپس جنس باسیلوس با استفاده از روش...
[ 6 ] - In vitro Assessment of Antiviral Activity of Cold Atmospheric Pressure Plasma Jet against the Human Immunodeficiency Virus (HIV)
Introduction: The human immunodeficiency virus (HIV) is a threat to global health and the need for finding new methods of antivirus research, in particular against HIV has increased in recent years. In this study, we investigated the ability of the cold atmospheric pressure plasma jet (CAPPJ) using helium to inhibit the replication of HIV virions. Methods: Single cycle replicable HIV (SCR-HIV) ...
[ 7 ] - جداسازی و شناسایی مولکولی آنتروکوکوس ها و بررسی حضور ژن بیماریزای سایتولیزین (cyl) از نمونه های ادراری
چکیده: زمینه و هدف: انتروکوکوس ها یکی از عوامل مهم عفونت های بیمارستانی می باشند. جنس انتروکوکوس 38 گونه دارد، که مهمترین آنها انتروکوکوس فکالیس و انتروکوکوس فاسیوم می باشند. انتروکوکوس ها، به دلیل ایجاد باکتریمی، عفونت دستگاه ادراری، اندوکاردیت، مننژیت و عفونت زخم اهمیت به سزایی پیدا کرده اند. روش بررسی: 280 نمونه ادرای جمع آوری شده از آزمایشگاه های تشخیص طبی در تهران مورد استفاده قرار گرفت. ...
[ 8 ] - جداسازی باکتریهای تجزیهکننده نشاسته موجود در سیال حفاری چاه 32 فتح واقع در منطقه نفتی آزادگان جنوبی
تجزیه زیستی نشاسته مورد استفاده در سیال حفاری توسط میکرو ارگانیسمها، باعث کاهش غلظت این ماده در ترکیب و در نتیجه کاهش کارایی سیال میشود. پژوهش حاضر با هدف شناسایی باکتریهای عمده تجزیه کننده نشاسته در سیال حفاری، جهت تعیین رشد و فعالیت این ارگانیسمها انجام شده است. برای این منظور باکتریهای موجود در سیال برگشتی از چاه جداسازی و فعالیت آمیلازی آنها با استفاده از تست هیدرولیز نشاسته بررسی گردی...
[ 9 ] - تکنیک زیست فزونی در حذف زیستی گازوییل از خاک
روشهای فیزیکی و شیمیایی مورد استفاده برای پاکسازی آلایندههای نفتی، روشهایی بسیار دشوار، خطرناک و پرهزینه هستند. ولی بیوتکنولوژی، بسیاری از اوقات راهکارهای موثرتری را برای آلودگی زدایی از محلهای آلوده فراهم میآورد. هدف از این پژوهش، ارزیابی تکنیک زیست فزونی در حذف آلایندههای نفتی میباشد. در این پژوهش خاکهای آلوده به گازوییل به مدت 100 روز در ستونهای مکعب مستطیل به ابعاد m 1×1×1 در دمای...
[ 10 ] - معرفی سویه های جدیدی از باکتری نمک دوست Salinivibrio sp. از دریاچه ی ارومیه
در این پژوهش برای اولین بار شناسایی میکروارگانیسم نمک دوست نسبی جنس Salinivibrio از دریاچه ی شور ارومیه مورد مطالعه قرار گرفت که منجر به شناسایی سویه های جدیدی از این جنس گردید. دریاچه ی ارومیه دریاچه ی پرشوری است که در شمال غربی ایران واقع شده و شورترین دریاچه ی دائمی ایران و از معدود دریاچه های فوق اشباع دائمی در جهان می باشد. ابتدا نمونه ها از مناطق مختلف دریاچه ، جمع آوری و در شرایط استریل ...
[ 11 ] - بررسی میزان مقاومت کلی فرم های روده ای جدا شده از پساب های صنعتی، خانگی و بخش هایی از تصفیه خانه شهر اراک به فلزات سنگین
فلزات سنگین نظیر کادمیوم، جیوه، نیکل و اکسی آنیون های تلوریت و کرومات از عناصر سمی هستند که به طرق مختلف وارد محیط زیست شده و برای سیستم¬های بیولوژیکی، بالاخص انسان، حیوانات و گیاهان زیان آور می باشند، لذا حذف آن ها از محیط زیست ضروری است. میکروارگانیسم ها و به ویژه باکتری ها نقش بسیار مهمی در حذف زیستی فلزات سنگین داشته و در بیوتکنولوژی کاربرد دارند. در این پژوهش شمارش کلی فرم های روده ای و ...
[ 12 ] - بررسی فنوتیپی و ژنوتیپی انواع باکتریهای Halomonas sp. دریاچه ارومیه
دریاچهارومیهبهعنواندومیندریاچهشوردنیاویکیازمعدوددریاچههایفوقاشباعدائمیدرجهان،دارایتنوعزیستیوسیعیازانواعمیکروارگانیسمهایهالوفیلوهالوتولرنتاست. دراینپژوهشاعضاییازجنسHalomonasکهشاملباکتریهایهالوفیلنسبیمیباشند،ازدریاچهارومیه پس از جداسازیموردبررسیهایفنوتیپیوژنوتیپیقرارگرفتند.نمونههاازمناطقمختلفدریاچهارومیهجمعآوریودرشرایطاستریلبهآزمایشگاهمنتقلشدند. سپسبرایجداسازیازمحیطهایAlkaline Peptone Water (APW)...
[ 13 ] - ارزیابی فعالیت ضد قارچی جدایه های باسیلوس سوبتیلیس تولید کننده ایتورین
سابقه و هدف: باسیلوس سوبتیلیس با توانایی تولید طیف وسیعی از ترکیبات ضد میکروبی مانند لیپوپپتیدهای خانواده ایتورین در کنترل بیولوژیک تعداد زیادی از قارچ های بیماریزای گیاهی مؤثر می باشد. این مطالعه با هدف بررسی فعالیت ضد قارچی جدایه های بومی باسیلوس سوبتیلیس علیه فوزاریوم مونیلیفورم و ورتیسیلیوم داهلیا انجام شد. مواد و روش ها: به منظور جداسازی باسیلوس سوبتیلیس ...
[ 14 ] - کنترل زیستی قارچهای پیتیوم اولتیموم و فوزاریوم سولانی توسط سویههای بومی باسیلوس سوبتیلیس
مقدمه: سویههای باسیلوسسوبتیلیس بهجهت داشتن قابلیت کنترل بیماریهای گیاهی ازطریق تولید متابولیتهای ثانویه بهویژه لیپوپپتیدهای گروه ایتورین، مهماند. هدف از این پژوهش، بررسی فعالیت ضدقارچی سویههای بومی باسیلوسسوبتیلیس علیه قارچهای بیماریزای گیاهی پیتیوماولتیموم و فوزاریومسولانی است. مواد و روشها: سویههای باسیلوسسوبتیلیس از 7 نمونه خاک پارکهای جنگلی تهران جداسازی و فعالیت ضدقارچی...
[ 15 ] - بررسی تنوع باکتریایی غالب در فلور باکتریهای هوازی و بیهوازی گلفشانهای جنوب شرقی دریای خزر
مقدمه: گِلفشانها حاوی مواد خاکی عمق زمین مخلوط با آب هستند که بهشکل خمیر شل و یا غلیظ به سطح زمین میرسند. گلفشانهای حاشیۀ جنوب شرقی دریای خزر و شمال شرقی استان گلستان از مهمترین گلفشانهای ایران هستند و در این پژوهش بررسی شدند. مواد و روشها: بهمنظور بررسی حضور باکتریها در گلفشان، نمونهها در محیطهای هوازی و بیهوازی کشت داده شدهاند. برای کشت انواع هوازی از محیطهای رایج برای باکتری...
[ 16 ] - غربالگری و خالصسازی اختصاصی باکتریهای تالاسواسپیرا و کروموهالوباکتر از لجنهای نفتی از طریق کموتاکسی به نفت
مقدار زیادی ضایعات در حین جابجایی و پالایش نفت خام برجا میماند که این ضایعات یک لجن نفتی غلیظ ایجاد میکنند که حاوی مقدار زیادی هیدروکربنهای مشتق شده از نفت هستند. پاکسازی زیستی مواد نفتی فرآیندی است که در طی آن میکروارگانیسمها قادرند مواد نفتی را به عنوان تنها منبع کربن و انرژی استفاده کنند و آن را به موادی با سمیت کمتر و یا غیرسمی و بیخطر تبدیل کنند. در این مطالعه لجن نفتی از مناطق آلود...
[ 17 ] - استخراج سلولز از ضایعات جلبک اسپیرولینا (Spirulina platensis) و جداسازی نانو الیاف سلولزی از آن
هدف از این مطالعه استخراج سلولزخالص از ضایعات جلبک اسپیرولینا(Spirulina platensis) به روش تیمارشیمیایی و جداسازی نانو الیاف سلولزی از آن با استفاده از تیمار مکانیکی بود. بدین منظور خالص سازی جلبک اسپیرولینا (جدا سازی چربی و پروتئین موجود در آن) طی سه مرحله تیمار شیمیایی با استفاده از محلول 2% سود و پس از آن محلول 3% کلریت سدیم که توسط اسیداستیک بافر شده بود انجام شد. سپس الیاف سلولزی استخراج شد...
[ 18 ] - Isolation and identification of halophilicbacteria from Urmia Lake in Iran
Halophiles are in all three domains of life: Archaea, Bacteria and Eucarya. Halophilic microorganisms in addition to form major part of life biodiversity can have many biotechnological applications. The objective of this research is isolation and identification of halophilic bacteria from Urmia Lake in Iran and the study of its bacterial biodiversity. After sampling of brines from Urmia Lake fr...
[ 19 ] - پاتوتایپینگ و بررسی شیوع اشریشیاکلیهای بیماریزای رودهای در نمونههای آب ورودی به تصفیهخانههای شهر تهران
آبهای آلوده و نقش آنها در انتقال پاتوژنها که باعث عفونتهای رودهای در انسان میشوند، حائز اهمیت بسیاری است. استفاده از روشهای سنتی از جمله محیط کشت در تشخیص اشریشیاکلی علاوه بر اینکه به زمان زیادی نیاز دارد، قابلیت شناسایی برخی پاتوتایپهای آن را نیز فراهم نمیکند. این پژوهش با هدف ارائه راهکارهای مولکولی در شناسایی سریع و اختصاصی پاتوتایپهای اشریشیاکلی انجام شد...
[ 20 ] - بررسی وجود باند ژن rsbA و تاثیر اسید میریستیک در بیماری زایی پروتئوس میرابیلیس جدا شده از عفونت های ادراری
Abstract Introduction: Bacteria communicate with each other by using molecular chemical signal, which are called autoinducer. By the increase of concentration of these signals, which is the result of increase cellular density, they coordinate gene expression in a microbial community. This process is called Quorum sensing. Considering the importance of urine tract infections prominent role of Qu...
[ 21 ] - تایپینگ E. coli های جدا شده از نمونههای آب سطحی ورودی به تصفیهخانههای شهر تهران به روش ERIC-PCR
چکیده سابقه و هدف: تایپینگ سویههای باکتریایی، یکی از روشهای مطالعهی اپیدمیولوژیک است. بدین منظور در این تحقیق از تکنیک ERIC-PCR جهت بررسی تنوع ژنتیکی سویههای E. coli جدا شده از آب ورودی به تصفیهخانههای شهر تهران استفاده شد . مواد و روشها: تعداد 106 ایزوله E. coli طی دورهی یک ساله، از بین 1939 نمونه ورودی تصفیهخانههای آب شهر تهران مطابق با روشهای استاندارد جداسازی شد و با روش E...
[ 22 ] - تجزیه ی زیستی نفتالین در خاک های آلوده به نفت خام توسط کنسرسیوم باسیلوسها
Background and Aim: The petroleum contamination is one of the inevitable consequences of population increase and energy consumption. In this study, the method of Bioremediation and Bacillus bacteria have been used in order to remove the petroleum contamination. Material and Methods: The samples of soil were collected and the bacteria were isolated and identified.Then, the production of Biosu...
[ 23 ] - ارزیابی فعالیت ضد قارچی جدایه های باسیلوس سوبتیلیس تولید کننده ایتورین
سابقه و هدف: باسیلوس سوبتیلیس با توانایی تولید طیف وسیعی از ترکیبات ضد میکروبی مانند لیپوپپتیدهای خانواده ایتورین در کنترل بیولوژیک تعداد زیادی از قارچ های بیماریزای گیاهی مؤثر می باشد. این مطالعه با هدف بررسی فعالیت ضد قارچی جدایه های بومی باسیلوس سوبتیلیس علیه فوزاریوم مونیلیفورم و ورتیسیلیوم داهلیا انجام شد. مواد و روش ها: به منظور جداسازی باسیلوس سوبتیلیس ...
[ 24 ] - کشف مهارکننده علیه بتا لاکتاماز CTX-M-9 باکتری E.coli با استفاده از مطالعات داکینگ ملکولی، MM/PBSA و دینامیک ملکولی
امروزه، مقاومت آنتی بیوتیکی در باکتری ها به یک چالش عمده برای سلامت بشر تبدیل شده است ظهور مقاومت آنتی بیوتکی، منجر به ناکارآمدی آنتی بیوتیک ها ، عدم درمان مناسب بیماری های عفونی و افزایش هزینه های درمانی شده است. یکی از فراوانترین انواع مقاومتهای انتی بیوتیکی مقاومت به آنتی بیوتیکهای بتالاکتام بخصوص پنی سیلین و سفالوسپورین میباشد که در بیشتر موارد با یک مکانیسم آنزیم تغییر دهنده به نام بتالاکت...
[ 25 ] - Evaluation of antimicrobial role of nanocapsules containing Cornus mass extract synthesized by emulsion method on antibiotic resistant bacteria
Background: Due to the increase in the strains of antibiotic-resistant bacteria, it is necessary to obtain effective herbal compounds and nanocapsules synthesized from plant extracts to eliminate these strains. Objective: The present research study was conducted to examine the antibacterial effects of Cornus mass extract and its synthesized nano-capsules on the bacterial strains resistant to an...
[ 26 ] - Identification of extended-spectrum β-lactamase genes in Escherichia coli isolated from patients with urinary tract infection
Introduction: Recentlly, resistance to antibiotics has increased and antibiotic-resistant strains producing extended-spectrum beta-lactamases (ESBLs) have emerged among Enterobacteriaceae, mainly in Escherichia coli (E. coli). In this study we aimed to determine phenotypic and genotypic ESBL production in isolated E. coli from women with urinary tract infection (UTI). Materials and Methods: In...
[ 27 ] - Molecular Investigation of Diversity Normal Yeast Flora in Cow Raw Milk Industrial Farms of Tehran Province and Alborz
Background and Objective: Milk is a completely rich and complex environment suitable for different microorganisms including bacteria and Fungi. The majority of studies were conducted on milk-bacterial flora and aflatoxin-contaminations in dairy products; however, despite the importance of yeasts in usage as starter in the dairy industries and their effect on the taste of dairy products as well ...
[ 28 ] - A Comparative Study on Level of erg11 Gene Expression in Non-albicans Candida Strains Isolated from Patients and Raw Milk
Nowadays, non-albicans Candida are common in human pathogens, and some of these cases were found in milk in the present study. Thanks to its various minerals and vitamins, milk is a good food source for humans and an ideal environment for the growth of microorganisms, including bacteria and fungi. Also, it is an important product in the agricultural sector. Materials and Methods: In the presen...
Co-Authors