مقایسه کارایی نشانگرهای RAPD وSCoT در تعیین تنوع ژنتیکی ارقام آنتوریوم (Anthurium andreanum) و تعیین روابط ژنتیکی بین آنها
Authors
Abstract:
Survey of genetic diversity is essential for breeding program. The genetic diversity of A. andreanum, 10 cultivars were analyzed using seven Start Codon Targeted (SCoT) and 40 RAPD markers in which 22 RAPD markers and all of SCoT marker produced polymorphic bands. Matrix genetic distance ranged from 0.01 to 0.37 for RAPD and from 0.02 to 0.52 for SCoT marker analysis. Polymorphism percentage generated by SCoT markers (100%) was similar to RAPD markers. In order to determine genetic relationships, cluster analysis was performed using Neighbor-joining with Splits tree software. Cluster analysis for RAPD and SCoT markers revealed that cultivars were grouped in three clusters. Results from the present study revealed the superiority of SCoT over RAPD markers due to their high resolution and high variability in detection of genomic information. This is the first report of using SCoT marker for genetic diversity analysis in anthorium. Overall, results showed that these markers provide useful information to protect A. andreanum germplasm resources and also useful for breeding programs.
similar resources
مقایسه کارایی نشانگر RAPD و Modified RAPD در تعیین تنوع ژنتیکی و فیتوشیمیایی بین جمعیت‌های مختلف گیاه رازیانه (Foeniculum vulgar)
مقدمه: گیاه دارویی رازیانه (Foeniculum vulgar) متعلق به خانواده چتریان است که دارای کاربردهای فراوانی در صنایع دارویی و غذایی می‌باشد. هدف: در این مطالعه، تأثیر هضم آنزیمی محصول RAPD - PCR به منظور افزایش کارایی نشانگر RAPD در ارزیابی تنوعات ژنومی مورد بررسی قرار گرفت. روش بررسی: پس از تکثیر DNA ژنومی 15 جمعیت رازیانه با استفاده از 9 آغازگر RAPD، بخشی از محصول PCR توسط دو آنزیم برشی MseI و Ec...
full textبررسی روابط ژنتیکی ارقام کلزا با استفاده از نشانگرهای RAPD
Limited geographic area and focused modification of rapeseed during of its breeding cases have been led to the limited genetic basis. So, the evaluation of genetic diversity in modern cultivars of canola to estimating and maintain of genetic resources is essential. In this study, the genetic diversity of 45 genotypes of rapeseed was investigated using 12 RAPD markers .Cluster analysis by Dice c...
full textمطالعه روابط خویشاوندی و تنوع ژنتیکی ارقام و لاینهای گندم (Triticum aestivum) با نشانگرهای RAPD
full text
بررسی تنوع و روابط ژنتیکی بین تعدادی از ارقام برنج با استفاده از صفات زراعی و نشانگرهای مولکولی RAPD
Identification of rice germplasm is necessary for aplication of genetic resources for rice breeding. In this purpose 30 rice genotypes evaluated based on important agronomic traits and RAPD markers. The maximum variation coefficient belonged to unfilled grain (76.6%) and minimum to panicle iength (18.46%). results of Euclidean similarity coefficient and UPGMA algorithm indicated 3 distanced gro...
full textمقایسه کارایی نشانگرهای ssr و est-ssr در تعیین روابط ژنتیکی ارقام بومی جو ایران
برآورد سطح تنوع ژنتیکی درون و بین جمعیت های جو گامی ضروری جهت نگه داری منابع ژنتیکی و توسعه استراتژی-های آتی جهت اصلاح آن محسوب می شود. در پژوهش حاضر تنوع و روابط ژنتیکی 119 ژنوتیپ بومی و 25 لاین پیشرفته و تجاری با استفاده از نشانگرهای ssr و est-ssr بررسی شد. از 38 جفت آغازگر ssr مورد استفاده، 32 آغازگر چندشکلی نشان داد
کارایی نشانگرهای EST-SSR در تعیین تنوع و ساختار ژنتیکی توده های بومی جو
تودههای بومی از ذخایر ژنتیکی با ارزش در برنامههای اصلاحی گیاهان زراعی میباشند. تعیین سطح تنوع و روابط ژنتیکی بین تودههای بومی، لازمه حفاظت و بهرهبرداری بهینه از این منابع با ارزش است. در پژوهش حاضر، تنوع و روابط ژنتیکی 119 توده بومی و 25 لاین پیشرفته و تجاری جو از کشورهای ایران، چین، مصر، روسیه، پاکستان و اسپانیا با استفاده از 22 جفت آغازگرEST-SSR بررسی شد. در مجموع، 87 آلل در 21 جایگاه E...
full textMy Resources
Journal title
volume 10 issue 28
pages 101- 109
publication date 2018-12
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
No Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023