طراحی و بهینه‌سازی تست PCR برای تشخیص سریع پاتوتایپ‌های انترواگریگیتیو و انتروتوکسی‌ژنیک اشرشیاکلی

Authors

Abstract:

زمینه و هدف: اشرشیاکلی به‌عنوان یکی از مهم‌ترین عوامل ایجادکننده بیماری اسهالی حاد در دنیا مطرح است. بیماری‌های اسهالی یکی از علل اصلی مرگ و میر در میان کودکان کشورهای درحال توسعه می‌باشند. این مطالعه با هدف توسعه تکنیک PCR برای تشخیص اختصاصی ژن‌های ویرولانس پاتوتایپ‌های انترتوکسی‌ژنیک اشرشیاکلی (ETEC) و انترواگریگیتیو و اشرشیاکلی (EAEC) انجام شد. روش بررسی: در این مطالعه برای تشخیص پاتوتایپ‌ها ETEC-EAEC، از ژن‌های اختصاصی st و lt (برای تشخیص پاتوتایپ ETEC) و از ژن اختصاصی aafII (برای شناسایی پاتوتایپ EAEC) استفاده شد. این تکنیک PCR برای این سه ژن طراحی و بهینه گردید. محصولات واکنش برای هریک از این ژن‌ها، در وکتور pTZ57R/T به‌عنوان کنترل مثبت، کلون و مورد استفاده قرار گرفت. میزان حساسیت پرایمر‌ها با محاسبه کمترین میزان تشخیص (Limit of Detection) و استفاده از ژنوم سایر باکتری‌ها به‌عنوان بررسی اختصاصیت پرایمر‌ها ارزیابی شد. یافته‌ها: با توجه به نتایج آنالیز محصولات PCR بر روی ژل الکتروفورز باند‌های مورد نظر برای ژن aafII، lt و st به ترتیب 384 ، 459 و 150 جفت باز به دست آمد. همچنین واکنش ژنوم باکتری‌های کنترل با پرایمر‌های طراحی‌شده، منفی بود. حد تشخیص براساس تعداد کپی برای ژن‌های st، lt و aafII به ترتیب برابر 390 ، 1500 و 2500 کپی به دست آمد. نتیجه‌گیری: با توجه به نتایج این مطالعه، طراحی این گونه تست‌ها در ایران به‌عنوان یک پیشرفت در زمینه بهبود تشخیص سریع و دقیق پاتوژن‌ها و تفکیک در نوع پاتوتایپ‌های اشرشیاکلی می‌باشد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

طراحی و بهینه سازی تست pcr برای تشخیص سریع پاتوتایپ های انترواگریگیتیو و انتروتوکسی ژنیک اشرشیاکلی

زمینه و هدف: اشرشیاکلی به عنوان یکی از مهم ترین عوامل ایجادکننده بیماری اسهالی حاد در دنیا مطرح است. بیماری های اسهالی یکی از علل اصلی مرگ و میر در میان کودکان کشورهای درحال توسعه می باشند. این مطالعه با هدف توسعه تکنیک pcr برای تشخیص اختصاصی ژن های ویرولانس پاتوتایپ های انترتوکسی ژنیک اشرشیاکلی (etec) و انترواگریگیتیو و اشرشیاکلی (eaec) انجام شد. روش بررسی: در این مطالعه برای تشخیص پاتوتایپ ها...

full text

طراحی یک روش سریع برای تشخیص کیست هیداتیک در گوسفند

زمینه مطالعه: استفاده از یک آزمون سریع و مقرون بصرفه برای تشخیص هیداتیدوز بعنوان بیماری مشترک بین انسان و حیوان می‌تواند بسیار مفید باشد. هدف: هدف از بررسی حاضر طراحی و بکارگیری نوعی روش سریع در تشخیص هداتیدوز بوده است. روش کار: ‌دو نوع آنتی‌ژن مایع خام و آنتـی‌ژن همـوژنیـزه پـروتـواسکـولکس تهیه و الگوی الکتروفورتیک آنها توسط الکتروفورز با سدیم دودسیل سولفات تعیین شد. برای تهیه سرم هیپرایمیون ا...

full text

بیماری زائی و واکسن ها علیه اشرشیاکلی انتروتوکسیژنیک

سابقه و هدف: باکتری اشرشیاکلی انتروتوکسیژنیک(ETEC: Enterotoxigenic Escherichia coli)، یکی از عوامل شایع اسهال بوده و تلفات انسانی ناشی از آن حدود 157000 نفر در سال برآورد شده که معادل 9 درصد از مرگ و میرهای ناشی از اسهال می باشد. توسعه واکسن علیهETEC  به عنوان سازوکار اولیه ایجاد مقاومت در برابر باکتری محسوب می شود. مطالعه حاضر با هدف بررسی اهمیت و بیماری زایی باکتری ETEC و تحقیقات در زمینه واک...

full text

طراحی و سنتز حس‌گر رنگ‌سنجی جدید برپایه کینازولینون برای تشخیص سریع و انتخابی یون مس (II)

در این مطالعه، یک حس‌گر شیمیایی رنگ‌سنجی جدید برپایه کینازولینون برای تشخیص یون‌های مس (II) طراحی و سنتز شد. ساختار حس‌گر سنتز شده (C) بوسیله روش‌های طیف‌سنجی زیرقرمز تبدیل فوریه (FT-IR)، رزونانس مغناطیسی هسته هیدروژن ( 1H NMR) و رزونانس مغناطیسی هسته کربن (13C NMR) بررسی و تایید شد. حس‌گر شیمیایی C حساسیت و گزینش‌پذیری عالی برای تشخیص یون مس (II) در میان تمام کاتیون‌ها و آنیون‌های بررسی شده در...

full text

شناسایی سریع هلیکوباکترپیلوری توسط روش ملکولی PCR در مقایسه با تست اوره آز سریع (RUT)

سابقه و هدف: هلیکوباکترپیلـوری (H.pylori) به عنوان یک عامل عمده خطـر زخم‌های معده و دوازدهه و سرطان معده شناخته شده است . روش های مختلفی برای تشخیص این میکروارگانیسم شناخته شده که متداول ترین آن ها به خصوص در بیمارانی که تحت آندوسکوپی قرار می گیرند، تست اوره آز سریع (RUT) می باشد ، اما این تست برای ایجاد نتایج مثبت و منفی کاذب بالقوه می باشد . لذا بکارگیری روشی سریع ، ساده و آسان اما با دقت ب...

full text

طراحی آزمون زنجیرهای پلی مراز (PCR) جهت تشخیص مولکولی سریع Neisseria meningitidis

  سابقه و هدف: نایسریا مننژیتیدیس پاتوژن اختصاصی انسان و دومین عامل شایع مننژیت در جهان است. جهت شناسایی این باکتری از آزمون ‌ های سنتی مانند کشت مایع نخاعی استفاده می ‌ شود ولی از معایب این روش ‌ ها وقت گیر بودن است. هدف این مطالعه، تشخیص سریع این باکتری به روش واکنش زنجیره ‌ ای پلی مراز (PCR) با استفاده از ژن CrgA است.   مواد و روش ‌ ها: ژن اختصاصی، حفاظت شده و دارای ارزش تشخیصی CrgA جهت طراح...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 10  issue 10

pages  25- 33

publication date 2017-01

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023