طراحی، ساخت، آنالیز تعیین توالی و بررسی بیوانفورماتیکی کاست ژنیRTB-ipaD: راهی نوین در جهت تولید واکسن شیگلوزیس

Authors

  • اسماعیلی, عقیل مرکز تحقیقات زیست شناسی، دانشگاه جامع امام حسین (ع)، تهران، ایران
  • رستمی, حسین مرکز تحقیقات زیست شناسی، دانشگاه جامع امام حسین (ع)، تهران، ایران
  • غفرانی, مهدی مرکز تحقیقات زیست شناسی، دانشگاه جامع امام حسین (ع)، تهران، ایران
  • املشی, ایمان مرکز تحقیقات زیست شناسی، دانشگاه جامع امام حسین (ع)، تهران، ایران
  • صفایی, صادق مرکز تحقیقات زیست شناسی، دانشگاه جامع امام حسین (ع)، تهران، ایران
  • هنری, حسین مرکز تحقیقات زیست شناسی، دانشگاه جامع امام حسین (ع)، تهران، ایران
Abstract:

زمینه و هدف: شیگلا شایع ترین عامل اسهال می‌باشد. آنتی‌ژن پلاسمیدی IpaD برای تهاجم باکتری به درون سلول میزبان ضروری می‌باشد. یکی از چالش‌ها در باره واکسن مخاطی علیه شیگلا بر پایه پروتئین IpaD قدرت پایین آن می‌باشد. به نظر می‌رسد که با متصل کردن IpaD به یک ناقل و ادجوانت مناسب همچون زیر واحد B سم ریسین، می‌توان پروتئین IpaD را بسیار ایمنوژنیک نمود. این مطالعه به منظور تولید وکتور بیانی نوترکیب دارای کاست ژنی RTB-ipaD، آنالیز تعیین توالی و بررسی بیوانفورماتیکی آن انجام گرفته است. روش بررسی: در این مطالعه ژن های RTB و (163-483) ipaD در وکتور pGEM-T همسانه‌سازی شدند. ژن ipaD به روش برش آنزیمی با ژن RTB به همراه لینکر کد کننده GPGP در وکتور pGEM متصل شد. سپس قطعه کایمریک RTB-ipaD در وکتور بیانی pET28a(+) زیر همسانه‌سازی گردید. در پایان آنالیز تعیین توالی و بررسی بیوانفورماتیکی کاست ژنی انجام گرفت. یافته‌ها: صحت ساخت کاست ژنی RTB-ipaD در وکتور بیانی pET28a(+) با واکنش PCR و هضم آنزیمی مورد تایید قرار گرفت. نتایج حاصل از تعیین توالی کاست ژنی مطابق با توالی ذخیره شده در بانک ژنی بود. مطالعات بیوانفورماتیکی بر مبنای شاخص سازگاری کدون نشان داد این کاست قابلیت بیان در گیاه ترانس ژن و برخی سویه های باکتری اشرشیاکلی را دارد. نتیجه‌گیری: اتصال RTB به عنوان ناقل و ادجوانت به آنتی‌ژن IpaD رویکردی نوین و مطلوب در جهت تولید واکسن مخاطی شیگلوزیس می‌باشد

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

طراحی، ساخت، آنالیز تعیین توالی و بررسی بیوانفورماتیکی کاست ژنیrtb-ipad: راهی نوین در جهت تولید واکسن شیگلوزیس

زمینه و هدف: شیگلا شایع ترین عامل اسهال می باشد. آنتی ژن پلاسمیدی ipad برای تهاجم باکتری به درون سلول میزبان ضروری می باشد. یکی از چالش ها در باره واکسن مخاطی علیه شیگلا بر پایه پروتئین ipad قدرت پایین آن می باشد. به نظر می رسد که با متصل کردن ipad به یک ناقل و ادجوانت مناسب همچون زیر واحد b سم ریسین، می توان پروتئین ipad را بسیار ایمنوژنیک نمود. این مطالعه به منظور تولید وکتور بیانی نوترکیب دا...

full text

جداسازی، همسانه سازی و امتزاج ناحیه n-ترمینال ژن ipad شیگلا دیسانتریه و زیرواحد b سم ریسین

شیگلا دیسانتریه پاتوژن مهمی است که باعث ایجاد عفونت در روده انسان می شود. آنتی ژنipad نقش مهمی در بیماری زایی و ایجاد عفونت توسط شیگلا دارد. چالش استفاده از پروتئین ipad در طراحی واکسن مخاطی، قدرت پایین و عدم انتقال آن به بافتهای مخاطی روده می باشد. با اتصال ناقل و ادجوانت گیاهی rtb به آنتی ژن ipad، می توان به رفع چالش تولید واکسن مخاطی علیه شیگلوزیس پرداخت. این تحقیق با هدف ساخت یک کاست ژنی شا...

full text

طراحی و ساخت واکسن فاژی مهارکننده جهت سرطان پروستات

Abstract Background: Removal of prostate and radiotherapy are used routinely for treatment of prostate cancer however in advanced stages of the disease these treatments are ineffective. Researchers are exploring strategies for preventing this malignancy. This study aims to design and develop a phage based vaccine for preventing prostate cancer. Materials and methods: After conducting bioinforma...

full text

بررسی پایگاه های توالی آلرژن ها و تعیین پایگاه داده مناسب برای آنالیز بیوانفورماتیکی آلرژنیسیته پروتئین های نوترکیب

  براساس اعلام سازمان جهانی آلرژی؛ حدود یک سوم جمعیت جهان متاثر از آلرژی‌اند. مطابق با ضوابط سازمان جهانی سلامت ارزیابی آلرژنیسیته پروتئین‌های نوترکیب ضروری است. ارزیابی آلرژنیسیته با پیشرفت‌های بدست آمده در آنالیزهای بیوانفورماتیکی و تعیین ساختار سه بعدی آلرژن‌ها تسهیل شده است. آنالیز بیوانفورماتیکی مرحله مقدماتی در ارزیابی آلرژنیسیته پروتئین‌های نوترکیب است که نتایج آن در سنگینی مستندات و قضا...

full text

طراحی و ساخت واکسن فاژی مهارکننده جهت سرطان پروستات

چکیده سابقه و هدف: از درمان های رایج جهت سرطان پروستات می توان برداشت پروستات و رادیوتراپی را نام برد، اما زمانی که بیماری توسعه یابد، روش های درمانی موجود کارآیی لازم را نخواهند داشت. با توجه به شیوع بالای سرطان پروستات، عوارض شناخته شده آن و اهمیت مهار و کنترل بیماری، مطالعه پیش رو جهت بررسی امکان طراحی و ساخت واکسن فاژی مهار کننده انجام گردید. روش بررسی: تحقیق جهت ساخت و بررسی اثر واکسن فاژی...

full text

آنالیز بیوانفورماتیکی پروتئین مایکوباکتریایی Rv1733c بعنوان کاندیدای واکسن، همسانه سازی و بیان آن در Escherichia coli

از آنجا که تعداد زیادی از جمعیت جهان به صورت نهفته با باسیل سل (Mycobacterium tuberculosis) آلوده هستند، واکسن هایی که سل نهفته را مورد هدف قرار بدهند تاثیر قابل توجهی در کنترل شیوع جهانی سل خواهند داشت. در این پژوهش ابتدا آنالیزهای بیوانفورماتیک روی یک پروتئین مایکوباکتریایی مربوط به فاز نهفته عفونت به نام Rv1733c انجام شد و پیش بینی شد که Rv1733c یک پروتئین غشایی با تعداد زیادی اپیتوپ های سلو...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 14  issue 6

pages  48- 59

publication date 2013-01

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023