شناسایی مورفولوژیک و مولکولی آسپرژیلوس‌های جداشده از بیماران بر اساس تعیین توالی ژن بتا توبولین (β-tubulin)
Authors
Abstract:
Background: Aspergillus species are opportunistic pathogens among immunocompromised patients. In terms of pathogenesis and mycotoxin production, they are in great value. The aim of the this study was to evaluate of beta-tubulin gene for identification of clinical Aspergillus species by PCR-sequencing method compared to morphological features of clinical isolates (such as conidial shape in direct microscopic examination, colony shape in culture, and physiological tests). Materials and Methods: In this study, 465 patients referred to the Shefa laboratory of Isfahan were evaluated. Morphological and molecular identification of clinical samples were performed using culture on sabouraud agar, malt extract agar, czapekdox agar, direct microscopy, and PCR-sequencing of beta tubulin gene, respectively. Sequences were analyzed in comparison with gene bank data. Results: Thirty nine out of 465 suspected cases (8.4%) had aspergillosis. The most prevalent species were Aspergillus flavus (56.4%), A. oryzae (20.5%), and A. fumigatus (10.2%), respectively. Fifty nine percent of patients were females and 49% were males. Conclusion: In comparison with phenotypic tests, sequencing of beta-tubulin gene for identification of Aspergillus species is at great value. Replacement of molecular techniques with conventional tests is recommended for precise identification of microorganism for better management of infection.
similar resources
تعیین توالی و بررسی خصوصیات مولکولی ژن بتا 1 و 4 اندوگلوکاناز سویه Bacillus subtilis B5d
این پژوهش به منظور تعیین برخی ویژگی‌های کاتالیتیکی و خصوصیات مولکولی ژن کدکننده آنزیم بتا 1و4 اندوگلوکاناز در سویهBacillus subtilis B5d انجام شد. ژن کدکننده این آنزیم در سویه B5d توسط آغازگرهای اختصاصی تکثیر، تعیین توالی و در پایگاه اطلاعاتی NCBI ثبت شد. تجزیه توالی حاصله و رسم درخت فیلوژنی با استفاده از نرم‌افزار Vector NTI و Mega.4 انجام شد. براساس نتایج حاصله قطعه تعیین توالیشده شامل 794 ...
full textاولین گزارش و شناسایی مولکولی گونه (Rhadinorhynchus sp (Acanthocephala، بر اساس توالی ژن 18SrDNA
full text
تعیین توالی و بررسی خصوصیات مولکولی ژن بتا ۱ و ۴ اندوگلوکاناز سویه bacillus subtilis b۵d
این پژوهش به منظور تعیین برخی ویژگی های کاتالیتیکی و خصوصیات مولکولی ژن کدکننده آنزیم بتا 1و4 اندوگلوکاناز در سویهbacillus subtilis b5d انجام شد. ژن کدکننده این آنزیم در سویه b5d توسط آغازگرهای اختصاصی تکثیر، تعیین توالی و در پایگاه اطلاعاتی ncbi ثبت شد. تجزیه توالی حاصله و رسم درخت فیلوژنی با استفاده از نرم افزار vector nti و mega.4 انجام شد. براساس نتایج حاصله قطعه تعیین توالیشده شامل 794 ...
full textاولین گزارش و شناسایی مولکولی گونه (rhadinorhynchus sp (acanthocephala، بر اساس توالی ژن 18srdna
0
full textشناسایی مولکولی لاکتوباسیل‌های پروبیوتیک جداشده از غذای سنتی ترخینه و دوغ ترخینه بر اساس توالی16S rDNA
چکیده مقدمه: سوپ ترخینه یکی از غذاهای محلی ناحیه غرب ایران می باشد که از قدیم الایام کاربرد دارویی و درمانی داشته و در درمان سرماخوردگی مورد استفاده قرار میگرفته است. تحقیقات نشان داده است که ترخینه و دوغ ترخینه منبع غنی از باکتری‌های پروبیوتیک میباشند. لذا به دلیل ابهام آمیز بودن تست‌های بیوشیمیایی جهت شناسایی باکتری‌ها، استفاده از روش‌های مولکولی جهت شناسایی و بررسی فیلوژنتیکی باکتری‌های...
full textبررسی توالی ژن M2 ویروس‌های آنفولانزا جداشده از بیماران ایرانی در سال 1393 به‌منظور تعیین مقاومت به آدامانتان‌ها
Background and Objective: Adamantanes, amantadine, and rimantadine have been used for many years for prevention and treatment of influenza virus A infections. These drugs are influenza virus M2 protein inhibitors and some amino acids substitutions in transmembrane portion of this protein cause resistance to them. This study was done for survey of adamantane resistance related nucleotide sequenc...
full textMy Resources
Journal title
volume 19 issue None
pages 87- 97
publication date 2017-06
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
No Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023