روش‌شناسی مطالعات فیلوژنی صوتی و مولکولی در پرندگان آوازه‌خوان مطالعه موردی: خانواده مگس‌گیرها Muscicapidae
Authors
Abstract:
پرندگان ازجمله مهره‌دارانی می‌باشند که از اصوات متنوع برخوردارند و این ویژگی به خاطر وجود اندام تخصصی تولید صدا یا همان جعبه صوت (syrinx)می‌باشد. خانواده مگس‌گیرها (Muscicapidea) گروهی از پرندگان آوازخوان و خانواده‌ای از راسته گنجشک‌سانان می‌باشند که در زیستگاه‌های متنوعی دیده می‌شوند و قادر به یادگیری و تقلید صدا هستند. هم چنین این خانواده در رده بندی در سطح جنس و گونه براساس مطالعات مولکولی از ابهامات بسیاری برخوردار می باشد که انجام مطالعات اصوات این گروه و ترسیم فیلوژنی صوتی و مقایسه آن با فیلوژنی مولکولی احتمالاً می‌تواند به بعضی از این مسائل پاسخ دهد. در این راستا آوازهای مربوط به تعدادی از گونه‌های جنس‌های مختلف این خانواده مورد تجزیه و تحلیل توسط نرم افزار 1.5 Pro version Raven قرارگرفت و هفت ویژگی آوایی کد گذاری گردید و در نهایت فیلوژنی صوتی با دو الگوریتم نزدیک‌ترین همسایه (NJ) و روش جفت گروه بدون وزن با میانگین حسابی(UPGMA) توسط نرم افزارهای3.60 Phylip و 4.0 PAUP ترسیم شد. نتایج حاکی از عدم انطباق نسبی بین درخت حاصل از فیلوژنی صوتی با آخرین فیلوژنی پذیرفته شده مولکولی این خانواده بود.موارد عدم انطباق می‌تواند به میزان یادگیری و تقلید صدا در این خانواده مربوط باشد. درمجموع درخت فیلوژنی ترسیم شده به روش NJ با62 درصد انطباق در مقابل درخت فیلوژنی به روشUPGMA با 45 درصدانطباق با درخت مولکولی،از ارزش تاکسونومیکی بالاتری در فیلوژنی صوتی برخوردارمی‌باشد.
similar resources
تحلیل ابردرخت ها (Supertrees) در خانواده مگس گیریان (Aves, Muscicapidae)
آرایه شناسان به منظور حل ابهامات آرایه شناختی در سطح فراگونه ای از روش ترسیم ابردرخت ها استفاده نموده تا با ادغام کردن درخت ها در مقیاسی بزرگ به بازسازی روابط تبارزادی بپردازند. در این مطالعه به منظور ادغام تمامی درخت های مولکولی موجود و ارائه روابط کامل تبارشناختی بین افراد خانواده مگس گیریان بر روی یک درخت واحد تبارشناختی، تمامی داده های موجود برای ژن های مختلف میتوکندریایی و هسته ای در بانک ...
full text(مقاله کوتاه) تجزیه فیلوژنی و تکامل مولکولی لپتین
In the current study, phylogenetic analysis and molecular evolution of the mammalian’s Leptin was investigated. Data was achieved and aligned by searching its genome database, while all examined mammals contained only a single copy of the Leptin. The nucleotide substitution rate of the sequences and molecular evolution of the Leptin were calculated by maximum likelihood and neighbor-joinin...
full textفیلوژنی مولکولی خانواده گل شیپوری بر اساس داده های ناحیه its ریبوزومی هسته
منطقه its از dna ریبوزومی هسته ای به طور گسترده برای استنباط روابط فیلوژنتیکی در گیاهان مورد استفاده قرار می گیرد. در مطالعه حاضر، توالی sti بیست و چهار نمونه از ایران در کنار سایر توالی های این جنس در بانک ژن از .araceae l در ایران از جنس های .arum l، .schott biarum و .blume) schott) eminium مشخص گردید. آنالیز فیلوژنتیکی با روش های بایسین و maximum parsimony انجام گرفت. تحلیل کلادیستی روابط فی...
full textپایش مولکولی تحت تیپ‌های ویروس آنفلوانزای پرندگان در اردک‌های بومی: یک مطالعه استانی
زمینه مطالعه :آلودگی به ویروس آنفلوانزای پرندگان در صنعت طیور ایران نخستین بار توسط تحت تیپ 2N9H در سال 1377 در استان قزوین تشخیص داده شد و از آن زمان به بعد در کشور به شکل اندمیک در آمده است. پرندگان آبزی مانند اردک‌های اهلی می‌توانند به عنوان مخزن تحت تیپ‌های موجود ویروس‌های آنفلوانزای پرندگان محسوب شوند و در گردش این ویروس‌ها در طبیعت و جمعیت‌های طیور اهلی نقش ایفا نمایند. گزارش منتشر شده از...
full textردیابی مولکولی گاماکروناویروس پرندگان در کبوترسانان استان تهران ، سال 1394
زمینه مطالعه: کروناویروس‌ها طیف گسترده‌ای از بیماری‌های تنفسی، روده‌ای، کبدی، عصبی با حدت‌های مختلف در گربه، سگ، خوک، جوندگان،گاو، پرندگان و انسان ایجاد می‌کنند. توانایی بالای کروناویروس‌ها در جهش و نوترکیبی به آن‌ها این امکان را می‌دهد که در میزبان‌های مختلف و شرایط اقلیمی متفاوت، فعال باشند. با توجه به احتمال وجود گاماکروناویروس در جمعیت پرندگان کشور از جمله کبوتران و همچنین عدم وجود اطلاعات...
full text(مقاله کوتاه) تجزیه فیلوژنی و تکامل مولکولی لپتین
در بررسی حاضر بهمنظور آگاهی از روند تکاملی و مولکولی ژن لپتین در پستانداران، آنالیز فیلوژنی و روند انتخاب طبیعی در طی تکامل انجام گرفت. توالی ژنی لپتین در پستانداران و سایر موجودات از جمله مرغ که هر کدام یک نسخه از توالی ژن را دارا بودند بر اساس جستجو در بانک اطلاعاتی ژنوم (ncbi) بهدست آمده و همتراز شدند. درصد جانشینی و جایگزینی نوکلئوتیدها با استفاده از روش حداکثر درستنمایی و نیز ترسیم درخ...
full textMy Resources
Journal title
volume 9 issue 3
pages 135- 140
publication date 2017-09-23
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023