تنوع ژنی و رابطه فیلوژنی دو گونه از جنس Rutilus در سواحل جنوبی دریای خزر بر اساس توالی یابی ژن سیتوکروم b میتوکندریایی
Authors
Abstract:
رابطه فیلوژنی دو زیر گونه مهم و اقتصادی از جنس Rutilus متعلق به خانواده کپورماهیان شامل ماهی کلمه (Rutilus rutilus caspicus) و ماهی سفید (Rutilus frisii kutum) سواحل جنوبی دریای خزر به‌منظور وجود رابطه خواهری با بخشی از ژن سیتوکروم b میتوکندریایی و روش توالی یابی DNA مورد بررسی قرار گرفت. روش کار شامل نمونه‌برداری از باله دمی، استخراج DNA، PCR و توالی‌یابی بود. جهت تجزیه و تحلیل، از تعدادی از شاخص‌های تنوع مولکولی و ترسیم درخت‌های فیلوژنی neighbor-joining مدل maximum-likelihood وmaximum-parsimony با 1000 تکرار استفاده شد. 14 هاپلوتایپ محاسبه شد، تنوع هاپلوتایپی (hd) بین دو گونه 761/0 بود، 114 مکان مختلف در کل توالی‌‌ها بهدست آمد. میانگین فاصله ژنتیکی بین دو گونه 09/0 بود. همچنین درخت‌های فیلوژنی ترسیم شده هر دو گونه در دو شاخه مجزا از هم قرار گرفتند. در مجموع نتایج این بررسی نشان داد که: تنوع ژنتیکی در هر یک از این دو گونه بالا بوده و با توجه به درخت‌های تکاملی رسم شده ارتباط نزدیک یا رابطه خواهری بین این دو گونه وجود ندارد.
similar resources
بررسی تنوع ژنتیکی ماهی سفید (Rutilus kutum (Kamensky, 1901 برخی از رودخانه های حوضه جنوبی دریای خزر با استفاده از توالی یابی ژن سیتوکروم b ژنوم میتوکندریایی (mtDNACytb)
در این بررسی 15 نمونه ماهی سفید (Rutilus kutum) از رودخانه های قره سو، گرگان رود (استان گلستان)، گهرباران، تجن و سفیدرود (استان مازندران) صید شدند. استخراج DNA با روش فنل-کلروفرم از بافت باله ماهیان انجام شد. به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی ماهی سفید از ژن سیتوکروم b استفاده شد. تکثیر ژن سیتوکروم b با استفاده از پرایمرهای اختصاصی طراحی شده بر اساس توالی های موجود در بانک ژن صورت گرفت. طول 785 جفت ...
full textبررسی تنوع ژنتیکی ماهی سفید (rutilus kutum (kamensky, ۱۹۰۱ برخی از رودخانه های حوضه جنوبی دریای خزر با استفاده از توالی یابی ژن سیتوکروم b ژنوم میتوکندریایی (mtdnacytb)
در این بررسی 15 نمونه ماهی سفید (rutilus kutum) از رودخانه های قره سو، گرگان رود (استان گلستان)، گهرباران، تجن و سفیدرود (استان مازندران) صید شدند. استخراج dna با روش فنل-کلروفرم از بافت باله ماهیان انجام شد. به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی ماهی سفید از ژن سیتوکروم b استفاده شد. تکثیر ژن سیتوکروم b با استفاده از پرایمرهای اختصاصی طراحی شده بر اساس توالی های موجود در بانک ژن صورت گرفت. طول 785 جفت ...
full textاولین بررسی ریخت شناسی و فیلوژنی سه گونه نادر از ماهیان خانواده Blenniidae در سواحل دریای مکران بر اساس توالی ژنی سیتوکروم اکسیداز 1
این مطالعه به منظور بررسی روابط فیلوژنی سه گونه نادر از ماهیان خانوادهBlenniidae در سواحل دریای عمان که متعلق به قبیله Parablenniini هستند انجام گرفت. بر اساس نوع زیستگاه این ماهیان نمونه برداری از سه ایستگاه در نواحی بین جزر و مدی با استفاده از ساچوک دستی در زمان حد اکثر جزر و از زیر جزر و مدی توسط غواصی (Diving (Scuba از اعماق 3، 6، 9 و 12 متری طی مهر تا اسفند ماه سال 1392 انجام شد. در مج...
full textخالص سازی و بررسی فیلوژنی گونه Amphora cf. coffeaeformis جدا شده ازآب‌های سواحل چابهار بر اساس توالی ژنی LSU-rDNA
جداسازی، کشت، خالص سازی و شناسایی دقیق فیتوپلانکتون های بومی هر منطقه می تواند مبنای تحقیقات بعدی بر روی گونه ها باشد. به منظور شناسایی و بررسی فیلوژنتیکی گونه ای از جنس Amphora به صورت تک سلولی از خلیج چابهار جدا و خالص گردید و در محیط کشت F2S که حاوی سیلیس بود کشت داده شد. گونه ها تحت شرایط مناسب در ژرمیناتور انکوبه شدند. rDNA از سویه خالص استخراج گردید و توالی نوکلئوتیدها در بخشی از...
full textبررسی فیلوژنتیکی گونه Charybdis hellerii از سخت‌پوستان (سخت‌پوستان، خرچنگ‌ها) در سواحل بین جزر و مدی چابهار بر اساس توالی ژنی قطعه‌ی 1 ژن سیتوکروم اکسیداز (CO1)
سابقه و هدف : Charybdis hellerii گونه‌ی بسیار شناخته شده‌ای در اقیانوس هند است. بررسی‌های مولکولی فراوانی بر روی این‌گونه در سایر نقاط دنیا انجام شده است. در ایران مطالعات مولکولی کمی بر روی خرچنگ‌ها صورت گرفته شده است، با این حال مطالعات ریخت‌شناسی بسیار جامع و مفیدی بر روی آنها انجام گرفته شده است. در تحقیق حاضر برای اولین بار در ایران به بررسی مولکولی جنس Charybdis گونه‌ی Charybdis hellerii...
full textبررسی تنوع ژنتیکی ماهی?سفید برخی از رودخانه?های حوزه?ی جنوبی دریای خزر با استفاده از توالی?یابی ژن? میتوکندریایی b emorhcotyc
ماهی ?سفید دریای خزر یکی از ماهی?های دارای ارزش غذایی، اقتصادی و ژنتیکی فراوان دریای خزر است که به مدت طولانی مورد تکثیر حمایتی قرار گرفته است. در حال حاضر نگرانی?هایی در مورد اثرات منفی این روش تکثیر بر روی ساختار ژنتیکی این گونه وجود دارد. از بین رفتن ذخایر ژنتیکی و کاهش تدریجی بانک ژن نگرانی?های اصلی در ادامه?ی این مسیر هستند. تاکنون تحقیقی برای تفکیک نژادهای ماهی سفید دریای خزر با تکیه بر ت...
15 صفحه اولMy Resources
Journal title
volume 9 issue 3
pages 19- 28
publication date 2015-06
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
No Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023