تعیین ویژگی‌های فتوتیپی و ژنوتیپی باکتری عامل بیماری خوشه صمغی گندم در جنوب استان کرمان

بیست‌و‌یک جدایه باکتری از توده‌های گندم محلی جنوب استان کرمان دارای نشانه‌های بیماری خوشه‌صمغی، جداسازی شد. ویژگی‌های فنوتیپی و افتراقی جدایه‌ها مطابق روش‌های متداول باکتری‌شناسی انجام شد. شناسایی مولکولی و تنوع ژنتیکی جدایه‌ها با تکثیر و تعیین توالی نوکلئوتیدی قطعه‌هایی از ژن‌های 16S rRNA، gyrB و recA بررسی شد. با استفاده از واکنش زنجیره‌ای پلیمراز قطعه‌هایی به‌طول 700 و 558 جفت‌باز به‌ترتیب مربوط به ژن‌های 16S rRNA و gyrB از تمام جدایه‌ها تکثیر شد. در واکنش زنجیره‌ای پلیمراز با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژن recA، هیچ قطعه‌ای در نمونه‌های مورد بررسی و جدایه شاهد Rathayibacter tritici تکثیر نشد، در حالی‌که در جدایه شاهد R. iranicus قطعه‌ای به‌طول 600 جفت‌باز تکثیر گردید. توالی نوکلئوتیدی نواحی ژنی تکثیر شده با یکدیگر، با جدایه R. tritici و با استرین‌های این باکتری موجود در بانک ژن یکسان بود. نتایج آزمون‌های فنوتیپی و بررسی داده‌های حاصل از تکثیر و تعیین توالی جایگاه‌های ژنی یاد شده نشان داد که باکتری R. tritici عامل بیماری خوشه‌صمغی گندم در جنوب استان کرمان است. این اولین گزارش از وجود این گونه باکتری در استان کرمان است.