تعیین ترادف ژن پروتئین پوششی دو جدایه ایرانی ویروس موزائیک هندوانه و بررسی جایگاه فیلوژنتیکی آنها
Authors
Abstract:
چکیده ویروس موزاییک هندوانه (WMV) Watermelon mosaic virusمتعلق به جنس Potyvirus و خانواده Potyviridae از ویروسهای مهم آلوده کننده کدوئیان در دنیا محسوب میشود. دو جدایه این ویروس به نامهای YAZ.WMV.41 و YAZ.WMV.55 از مزارع خیار و طالبی استان یزد جمعآوری گردید. آلودگی نمونهها با آزمون سرولوژیکی الایزای مستقیم و غیرمستقیم و آنتی بادی پلیکلونال این ویروس بررسی شد. این دو جدایه در مقابل آنتیبادی واکنش نشان ندادند. در بررسی علائم این جدایهها برروی گیاهان آزمون کدوی مراغه، لوبیا چیتی و لوبیا چشم بلبلی، علائم متفاوتی با آنچه تا کنون در مورد جدایههای این ویروس گزارش شده، مشاهده گردید. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی قطعهای به طول 809 جفت باز از ژن پروتئین پوششی تکثیر و تعیین ترادف شد. مقایسهی ترادفهای بدست آمده در این تحقیق با ترادفهای موجود در بانک جهانی ژن نشان داد که جدایههای مورد مطالعه به همراه یک جدایهی ایرانی (رس شمار EU667627) با دامنهی میزبانی متفاوت، در زیر گروه IIB قرار میگیرند. سایر جدایههای ایرانی گزارش شده قبلی در گروههای I و AII قرار گرفتند. مقایسهی میزان تشابه اسید نوکلئیک این جدایهها با یکدیگر نشان داد که جدایههای ایرانی مربوط به این مطالعه بیشترین و کمترین میزان شباهت را با جدایههای کشورهای اسپانیا (رس شمار AJ579518) و ایران (رس شمار GQ421161) به ترتیب به میزان 5/99 و 2/92 درصد دارا میباشند. نتایج حاصل از این تحقیق بیانگر این است که کدوئیاندر مزارع وگلخانههای ایران بوسیله جدایههای متعدد این ویروس آلوده می شوند.
similar resources
تعیین ترادف شش جدایه ایرانی ویروس موزائیک هندوانه و مقایسه فیلوژنتیکی جدایه های ایران با سایر جدایه های دنیا
ویروس موزائیک هندوانه(Watermelon mosaic virus, WMV) یکی از پوتی ویروس های مهم و گسترده در دنیا است که به کدوئیان خسارت وارد می کند. به منظور ردیابی وتعیین پراکنش این ویروس در مزارع استان گلستان179 نمونه از گیاهان دارای علائم موزائیک کدو، هندوانه، خربزه و خیار از شش منطقه از استان گلستان جمع آوری و با آنتی سرم WMV</stro...
full textآنالیز ترادف نوکلئوتیدی جدایه ایرانی ویروس موزائیک کوتولگی ذرت و بررسی منشاء و تکامل آن
ترادف کاملنوکلئوتیدی جدایه ایرانی ویروس موزائیک کوتولگی ذرت (Maize dwarf mosaic virus MDMV-Ir) تعیین گردید. ژنوم ویروس بجز دنباله Poly A انتهایی ʹ3، 9499 نوکلئوتید بود که شامل 139 نوکلئوتید ناحیه خوانده نشدنی ʹ 5 و 234 نوکلئوتید ناحیه خوانده نشدنی ʹ 3 و یک چارچوب باز خواندنی که یک پلی پروتئین با 3042 اسید آمینه را کد می کند را شامل می شد. MDMV-Ir با سایر جدایه های ویروس4/86 تا 9/91 درصد شباهت...
full textدامنه میزبانی و برخی مشخصات مولکولی تعدادی از جدایه های ویروس موزائیک یونجه در استان کرمان
ویروس موزائیک یونجه (Alfalfa mosaic virus, AlMV) یکی از مهم ترین ویروس های یونجه در سرتاسر دنیاست. به منظور مطالعه جدایه های این ویروس در استان کرمان، در طی سالهای 1386 تا 1387 از 514 بوته یونجه با علائم موزائیک، زردی، تاولی شدن سطوح برگ ها، بدشکلی و پیچیدگی و 66 بوته سیب زمینی با علائم زرد ابلقی (Calico)، در شهرستان های مختلف استان کرمان نمونه برداری به عمل آمد. آلودگی نمونه های فوق به AlMV با...
full textخالصسازی و تعیین ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل ویروس موزائیک زرد کدو- جدایه فارس
ویروس موزائیک زرد کدو (Zucchini yellow mosaic virus) ازنمونههای کدوی دارای علایم موزائیک، تاولی شدن و بدشکلی برگ و میوه و کاهش رشد از مزارع منطقه کفترک شیراز به کمک آزمون الیزا، جداسازی و یک نمونه بهعنوان جدایه فارس این ویروس ((ZYMV-F به منظور انجام مراحل بعدی تحقیق بررسی شد. ZYMV-F در شرایط گلخانه در کدو تکثیر و از بافتهای آلوده برای خالصسازی فیزیکی ویروس استفاده شد. از آنتیسرمب...
full textردیابی و تعیین خصوصیات مولکولی ژن پروتئین پوششی سه جدایه ایرانی ویروس آبله آلو (Plum pox virus)
ویروس آبله آلو (Plum pox virus, PPV) یکی از خسارتزاترین ویروسهای درختان میوه هستهدار در دنیا می باشد. به منظور ردیابی و بررسی خصوصیات مولکولی جدایههایایرانی PPV، طی سالهای زراعی 93-91، تعداد 130 نمونه برگی درختان هسته دار با علایم ویروسی از باغات درختان هسته دار استانهای اردبیل ، مازندران و تهران جمعآوری شدند. ردیابی ویروس با روشهای ELISA DAS-، ایمونوبلات و همچنین RT-PCR با آغازگرهای ا...
full textبررسی تنوع ژنتیکی جدایه های ویروس موزائیک زرد کدو بر اساس قسمتی از ژن پروتئین پوششی
پروتئین پوششی نقش های متعددی را در مراحل سیکل آلودگی به عهده دارد و گزینه مناسبی برای مطالعات تبارزایی و تنوع ژنتیکی به حساب می آید. به منظور بررسی آنالیز تبارزایی، تنوع ژنتیکی و فشار انتخاب بر ژن پروتئین پوششی جدایه های ویروس موزاییک زرد کدو (zymv)، هفت جدایه b10، b21، b22، h7، w5، z3 و z14 از غرب کشور و از میزبان های متفاوت تعیین توالی و با 65 جدایه قابل دسترس در پایگاه داده های نوکلئوتیدی مو...
full textMy Resources
Journal title
volume 6 issue 1
pages 27- 40
publication date 2017-03-21
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023