تشخیص مقاومت به افلوکساسین با روش مولکولی سریع Allele Specific PCR ‏در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس

Authors

  • اعظم احمدی دانشجوی دکتری تخصصی ژنتیک مولکولی، دانشگاه تربیت مدرس و مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان، علوم پزشکی اراک،ایران
  • سید رضا مودب استادیار ‏مرکز تحقیقات سل و ریه، دانشگاه علوم پزشکی تبریز، ایران
  • مانا شجاع پور دانشجوی دکتری تخصصی پزشکی مولکولی، مرکز تحقیقات پزشکی و مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، ایران
  • محمد ارجمندزادگان استادیار باکتری شناسی پزشکی، مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان، دانشگاه علوم پزشکی اراک، ایران
  • محمدرضا ذوالفقاری استادیار میکروبیولوژی، ‏‏دانشگاه آزاد اسلامی، واحد قم، گروه میکروبیولوژی، قم، ‏ایران
  • وحیده وحیدی دانشجوی کارشناسی ارشد میکروبیولوژی، ‏‏‏‏دانشگاه آزاد اسلامی، واحد قم، گروه میکروبیولوژی، قم، ‏ایران
Abstract:

  مقدمه : مقاومت به فلوروکینولون‏ها در بیماری سل رو به گسترش است. ‏تشخیص مقاومت به روش کشت خلط دو ماه به طول می‏انجامد. ‏مطالعه حاضر، به منظور طراحی روشی برای تشخیص سریع مقاومت سویه ‏ها ی کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به افلوکساسین انجام شد.   مواد و روش‏‏ها: در این مطالعه، ‏ DNA ‏های استخراج شده از 41 سویه کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ‏حساس و مقاوم ‏به افلوکساسین موجود در بانک DNA مرکز تحقیقات سل و بیماری‏های عفونی با دو روش مولکولیآلل اسپسیفیک پی سی آر ( AS-PCR ) و تعیین ترادف (سکوئنس)، برای تعیین موتاسیون در منطقه مرتبط با مقاومت ژن gyrA با هم مقایسه شدند. ‏پرایمرهای داخلی برای تشخیص موتاسیون‏های مرتبط با مقاومت طراحی و شرایط ‏ PCR ‏تعیین شد‏. ‏قطعه مورد نظر درتعدادی از نمونه‏ها تعیین ترادف شده و به‏عنوان استاندارد طلایی با روش‏های ارائه شده مقایسه شد.   نتایج: روش AS-PCR ‏به خوبی قادر به تشخیص موتاسیون با تشکیل یا عدم تشکیل باند داخلی شد‏ که نشان دهنده طراحی صحیح پرایمرها بود. ‏روش AS-PCR اجرا و با توجه به نتایج بسیار خوب به عنوان روش عادی استفاده شد. ‏در مجموع، ‏از 41 سویه کلونیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مطالعه شده، ‏37 سویه از نظر فنوتیپی (‏به روش کشت proportion ) مقاوم به افلوکساسین و 4 سویه حساس به این دارو بودند. ‏از 37 سویه مقاوم از نظر فنوتیپی، 32سویه با روش AS-PCR مقاوم به افلوکساسین و 5 نمونه حساس تعیین شدند. ‏نتایج تعیین ترادف، ‏با نتایج روش‏های استفاده شده انطباق داشت. ‏حساسیت و ویژگی روش به ترتیب ‏معادل ‏11/86 درصد و 100 درصد به دست آمد.   بحث و نتیجه‏گیری: نتایج مطالعه حاضر نشان می‏دهد که روش AS-PCR طراحی شده می‏تواند به عنوان یک روش ساده و سریع برای تعیین حساسیت و مقاومت به افلوکساسین در سویه‏های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس استفاده شود. ‏این روش تا کنون در منابع علمی گزارش نشده است.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

تشخیص مقاومت به افلوکساسین با روش مولکولی سریع allele specific pcr ‏در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس

مقدمه : مقاومت به فلوروکینولون‏ها در بیماری سل رو به گسترش است. ‏تشخیص مقاومت به روش کشت خلط دو ماه به طول می‏انجامد. ‏مطالعه حاضر، به منظور طراحی روشی برای تشخیص سریع مقاومت سویه ‏ها ی کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به افلوکساسین انجام شد.   مواد و روش‏‏ها: در این مطالعه، ‏ dna ‏های استخراج شده از 41 سویه کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ‏حساس و مقاوم ‏به افلوکساسین موجود در بانک dna مرکز تح...

full text

تشخیص سریع موتاسیون در ژن عامل مقاومت به ریفابوتین در سویه های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به روش Allele Specific PCR

Background and purpose: Molecular detection of antibiotic resistance in clinical strains of M.tuberculosis is of great importance. In this study, we developed a method for rapid detection of mutations resistant to the rifabutin antibiotic resistant gene. Material and methods: In this study 40 clinical isolates of M.tuberculosis including 12 resistant and 28 susceptible isolates to rifabutin we...

full text

تشخیص سریع موتاسیون در ژن عامل مقاومت به ریفابوتین در سویه های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به روش allele specific pcr

سابقه و هدف: تشخیص مولکولی مقاومت در آنتی بیوتیک های موثر روی سویه های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس از اهمیت ویژه ای برخوردار است. در این مطالعه طراحی روشی جهت تشخیص سریع موتاسیون های مرتبط به مقاومت در ژن عامل مقاومت به آنتی بیوتیک ریفابوتین مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روش ها: 40 سویه کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس شامل 12 سویه مقاوم به ریفابوتین و28سویه حساس به این آنتی بیوتیک مورد است...

full text

تشخیص سریع حساسیت به اتامبوتول در سویه‌های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ایزوله شده از بیماران مسلول با روش مولکولی PCR-RFLP

    Background & Aims : Eethambutol is a key drug to treatment of tuberculosis and resistance against it has been increasingly reported. In this study, Polymerase Chain Reaction -Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) method in rapid detection of tuberculoses mycobacterium strains against the ethambutol has been investigated.   Materials & Methods : This study was conducted on 60 s...

full text

تشخیص سریع کمپلکس مایکوباکتریوم توبرکلوزیس: روش PCR با استفاده از قطعه الحاقی 6110

Normal 0 false false false EN-GB X-NONE AR-SA MicrosoftInternetExplorer4 /* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:"Table Normal" mso-tstyle-rowband-size:0 mso-tstyle-colband-size:0 mso-style-noshow:yes mso-style-priority:99 mso-style-qformat:yes m...

full text

شناسایی مقاومت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به ریفامپین توسط روش PCR

زمینه و هدف: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس همچنان به‌عنوان شایع‌ترین علت مرگ‌های مرتبط با عوامل بیماریزای عفونی در جهان مطرح است. ریفامپین نیز از مهم‌ترین داروهای خط اول درمان بیماری سل می‌باشد. شایع‌ترین موتاسیون‌های مرتبط با مقاومت به داروی ریفامپین در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بر اثر جابه‌جایی در کدون‌های 531، 526 و 516 در ژن rpoB اتفاق می‌افتد. این مطالعه با هدف معرفی روش (Multiplex Allele Specif...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 3  issue 9

pages  21- 34

publication date 2014-05-22

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023