تبارزایی مولکولی ژنگان A در برخی از گونه‌ های Triticum L. با استفاده از توالی‌ های بین رونوشت‌های ریبوزومی (ITS)

Authors

  • زینب صفری دانشجوی دکتری، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران
  • علی اشرف مهرابی دانشیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران
Abstract:

درگیاهان خانوادۀ غلات (Poaceae) جنسTriticum L.  شامل گندم نان و دیگر گونه­های مهم زراعی است که اهمیت اقتصادی بسیار بالایی در تغذیۀ انسان دارند. در این پژوهش، تبارزایی مولکولی گونه­های جنس Triticum L. دارای ژنگان (ژنوم) A (T. aestivum، T. turgidum، T. urartu و T. boeticum) بررسی شد. برای این منظور توالی­های بین رونوشت­های ریبوزومی (ITS) با استفاده از دو جفت آغازگر اختصاصی از روی DNAی ژنگانی استخراج‌شده از 26 ژنوتیپ از گونه­های بالا، افزایش و توالی­یابی شد. توالی­ها با استفاده از نرم­افزار MEGA 5.0 و با الگوریتم ClustalW هم‌ردیف شدند. ماتریس فاصله­ها محاسبه و درخت­وارۀ ژنی ترسیم شد. نتایج نشان داد، طول توالی­های ITS1 و ITS2 به ترتیب 650 جفت باز و 700 جفت باز و محتوای G+C به ترتیب 25/60 و 50/60 بود. حفاظت‌شدگی بالایی در نواحی ITS جمعیت­ها مشاهده شد (63 و 88 درصد، به ترتیب). تحلیل تبارزایی (فیلوژنتیکی) انجام‌شده با استفاده از توالی­های افزایش شده، به‌خوبی گندم­های دیپلوئید و پلی­پلوئید را در دو گروه جداگانه قرار داد. نتایج نشان داد، رابطه‌های نزدیکی بین T. aestivum و T. turgidum و همچنین بین T.urartu و T.boeticum وجود دارد. به‌طورکلی، این بررسی نشان داد، نشانگرهای مولکولی ITS برای بررسی‌های تبارزایی بسیار مناسب هستند.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

مطالعه گونه های یونجه (medicago l.) براساس توالی یابی dna ریبوزومی هسته ناحیه its

بررسی روابط تکاملی و فیلوژنی در گیاهان، از طریق صفات مورفولوژیکی همواره متداول بوده است. گیاهان براساس ویژگی های موفولوژیک متمایزکننده شناسایی می شوند (du1 et al., 2006). در بعضی موارد شناسایی گونه های گیاهی براساس صفات موفولوژیک مشکل و دارای محدودیت است. در مواردی نشانگرها و صفات مورفولوژیک به علت تاثیرپذیری از محیط کارایی کمی در شناسایی و رده بندی گونه ها دارند (shen et al., 1998). در سال ها...

15 صفحه اول

بررسی فیلوژنتیکی گونه های a. raphani ،alternaria arborescens، a. brassisicola و a. alternata با استفاده از توالی its

جنس alternaria یکی از فراوان ترین جنس های قارچی است که در مکان های متنوعی در سراسر دنیا یافت می شود و شامل گونه های بیماری زای گیاهی و پوده زی است که باعث وارد شدن خسارت به بسیاری از گیاهان و یا موجب فساد محصولات کشاورزی پس از برداشت می گردند. میزان خسارت در گونه های بیماریزای گیاهی متغیر است. تعدادی از گونه های این جنس بیماریزای گیاهان بوده و بیماریهای مهم و اقتصادی را در تعدادی ازگیاهان ایجاد...

15 صفحه اول

شناسایی مولکولی cochliobolus sativusعامل بیماری لکه سوختگی گندم با استفاده از توالی یابی its ریبوزومی و بررسی روابط فیلوژنتیکی گونه های موجود در جنس cochliobolus

عامل بیماری لکه سوختگی گندم قارچcochliobolus sativus است که در بسیاری از مناطق جهان به عنوان یکی از مهم ترین بیماری های گندم مطرح است. از مناطق آلوده شمال کشور نمونه های مشکوک به این بیماری جمع آوری و از میان آن ها هشت جدایه عامل بیماری به عنوان نماینده انتخاب و مورد بررسی مورفولوژیکی، اثبات بیماریزایی و مولکولی قرار گرفتند. مشخصات مورفولوژیکی جدایه ها با استفاده از کلیدهای معتبر نشان داد که عل...

full text

شناسایی برخی گونه های کاردامینه در ایران با استفاده از نشانگر ملکولی ITS

جنسCardamine L. از خانواده Brassicaceaeبا بیش از 200 گونه در جهان و 7 گونه در ایران با توجه به تنوع کاریولوژی و مورفولوژی بالا، گیاه مناسبی برای بررسی های فیلوژنتیکی و تکامل می باشد. گونه کاردامینه هیرسوتا از این جنس بتازگی بعنوان گیاهی مدل در مطالعات مقایسه ای تکاملی معرفی شده است. این گیاه از هفت منطقه مختلف ایران جمع آوری و پس از استخراج DNA ی برگی، ناحیه ITS آنها با استفاده از پرایمر های IT...

full text

ارزیابی تنوع ژنتیکی صفات مورفولوژیک برخی از ژنوتیپ های گندم (Triticum aestivum L.) با استفاده از روش های چند متغیره

Appropriate selection of donor parent for breeding purposes needs sufficient knowledge about genetic diversity and germplasm classification. In order to investigation and classification of genetic diversity in 35 wheat (Triticum aestivum L.) genotypes, an experiment was conducted in University of Shahed based on randomized complete block design with 2 replications in 2009. In persent study 15 m...

full text

ارزیابی مولکولی رابطه فیلوژنتیک جمعیت‌هایی از لاله واژگون ایران با استفاده از توالی ناحیه ITS

   جنس لاله واژگون (Fritillaria) دربردارنده بیش از 140 گونه در خانواده سوسنیان می­باشد که از میان آنها گونه F. imperialis از نظر زینتی و دارویی از ارزش و اهمیت بالایی برخوردار است. تعداد 19 جمعیت از لاله واژگون از رویشگاه­های طبیعی خود واقع در 6 استان کشور جمع­آوری شدند. ارزیابی­های فیلوژنتیک بر اساس توالی ناحیه ITS در سطح DNA هسته­ای و با استفاده از روش‌های «نیبرجوینینگ» و «ماکسیمم لایکلی­هود»...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 48  issue 2

pages  483- 491

publication date 2017-08-23

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023