بررسی میزان کارآیی روش Real-Time PCR با استفاده از دو راهکار رسم منحنی استاندارد و رگرسیون خطی

Authors

  • جواد محمدی‌اصل استادیار گروه ژنتیک پزشکی.گروه ژنتیک پزشکی و مرکز تحقیقات سلولی و مولکولی، دانشکدة پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی جندی‌شاپور اهواز، ایران.
  • علی خدادادی استادیار گروه ایمونولوژی.گروه ایمونولوژی و مرکز تحقیقات سلولی و مولکولی، دانشکدة پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی جندی‌شاپور اهواز، ایران.
  • مریم حمیدی‌نیا دانشجوی کارشناس ارشد گروه ایمونولوژی.گروه ایمونولوژی، دانشکدة پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی جندی‌شاپور اهواز، ایران.
  • مهری غفوریان دانشیار گروه ایمونولوژی.گروه ایمونولوژی، دانشکدة پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی جندی‌شاپور اهواز، ایران.
Abstract:

زمینه و هدف: آنالیز کمّیmRNA  با استفاده از Real-Time PCR  به­وسیله روش سایبرگرین به­طور وسیعی در مطالعات بیولوژیک کاربرد  بسیاری پیدا کرده است. هدف این تحقیق مقایسة کارآییPCR  محاسبه شده با استفاده از دو روش شیب خط نمودار استاندارد و نرم­افزارLinRegPCR  جهت تعیین استراتژی بهتر برای محاسبة کارآیی PCR می­باشد. روش بررسی: در این پژوهش پس از خون­گیری و استخراج RNA و سنتز cDNAفرآیند  qRT-PCR انجام شد.سپس محاسبة PCR Efficiency به دو روش رسم منحنی استاندارد و همچنین با استفاده از نرم­افزارLinReg PCR انجام گرفت و در نهایت این دو روش آنالیز با هم مقایسه شدند. یافته­ها: میزان کارآیی PCR محاسبه شده برای سه ژنGAPDH، TGF βو IL-10 با روش منحنی استاندارد به­ترتیب 99/1، 81/1 و 87/1 و همچنین با روش استفاده از نرم­افزار رایانه­ای LinReg PCR کارآیی این سه ژن به­ترتیب 98/1، 82/1 و82/1 به­دست آمد. نتیجه­گیری: نتایج این تحقیق نشان می­دهد که در آنالیز داده­های حاصل از تکثیر cDNA میزان کارآییPCR  به­دست آمده برای سه ژن GAPDH، TGF β و  IL-10با دو روش مختلف منحنی استاندارد و LineRegPCR نتایج تقریباً یکسانی حاصل می­شود. بنابراین، توصیه می­شود که به­جای روش پرهزینه منحنی استاندارد از نرم­افزار LinReg PCR استفاده گردد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

تشخیص میکرومتاستاز کارسینومای سلول کلیوی توسط مارکر CA9 با استفاده از روش Real-Time RT PCR

  چکید ه   سابقه و هدف   حدود 40 درصد از مبتلایان به سرطان کلیه حتی پس از خارج نمودن کامل کلیه(رادیکال نفرکتومی) دچار متاستاز می‌شوند. بنابراین یافتن راهی برای تشخیص شروع متاستاز بسیار ارزشمند می‌باشد. در تحقیق حاضر، امکان تشخیص میکرومتاستاز سرطان کلیه با استفاده از نشانگر( (CA9 مورد بررسی قرار گرفته است.   مواد و روش‌ها   در یک مطالعه تجربی، از 30 بیمار مبتلا به سرطان کلیه که به بیمارستان دکتر...

full text

مقایسه حساسیت دو روش real-time pcr و rt-pcr برای تشخیص ویروس بیماری زای طیور

بیماری نیوکاسل یکی از مخرب ترین بیماری های ویروسی طیور در سرتاسر جهان است. با توجه به اینکه روش های سنتی قابلیت محدودی در کنترل این بیماری دارند، هدف از انجام این مطالعه استفاده از تکنولوژی های نوین برای تشخیص به موقع بیماری جهت کاهش خسارت پیش روی صنعت طیور می باشد. استخراج rna از واکسن نیوکاسل سویه b1 و با استفاده از کیت rnease mini (شرکت کیاژن، آمریکا) و بر اساس دستورالعمل شرکت سازنده انجام ش...

15 صفحه اول

مقایسه روش Real-time PCR با استفاده از پرایمر همگانی 23s rRNA و روش کشت خون در تشخیص سپتی‌سمی

Background: Bloodstream infections (BSI) have a high incidence and high mortality in the worldwide. The mortality rate is variable between 20-70%. Therefore, early and timely detection of BSI agent in clinical laboratories is necessary. The aim of this study was to determine an efficient diagnostic tool to septicemia in accompany of blood culture method by Real-time PCR (using panbacterial 23S ...

full text

بررسی آدنوکارسینوم ریوی در گوسفندان مبتلا به بیماری های تنفسی مزمن با استفاده از روش Real-time PCR

    آدنوکارسینوم ریوی گوسفند بیماری تنفسی مزمن با دوره‌ی کمون طولانی است که در اثر رتروویروس جاگزیکت ایجاد می‌شود.  در پژوهش حاضر Real-time PCR به عنوان یک روش اختصاصی فوق‌العاده حساس برای شناسایی DNA پروویروسی این رتروویروس در نمونه‌های خون کامل گوسفندان به ظاهر سالم و مبتلا به بیماری‌های تنفسی مزمن در یک بررسی کشتارگاهی ارزیابی شد.  هشتاد رأس گوسفند مبتلا به پنومونی مزمن و بیست رأس گوسفند سال...

full text

بررسی بیان ژن CYP1A1 در بیماران مبتلا به سرطان مری با استفاده از روش Real-time PCR

زمینه و هدف: سرطان مری توزیع و شیوع جغرافیایی بسیار متغیری نسبت به سایر انواع سرطان های شایع دارد. شیوع سرطان مری در ایران بسیار بالا می باشد. عوامل ژنتیکی مخصوصاً انکوژن‌ها از جمله عواملی است که در ایجاد و پیشرفت سرطان در بافت‌ها موثر هستند. در این میان ژن CYP1A1 (سیتوکروم P450، خانواده ١، زیر خانواده A، پلی پپتید ١) یکی از زیر خانواده های سیتوکروم P450 است که در سرطان مری نقش دارد، لذا هدف این...

full text

مطالعه الگوی بیان ژن های مرتبط با سرما در دو ژنوتیپ برنج با استفاده از روش real time pcr

اکثر رقم¬های برنج در برابر دماهای سرمازدگی، مخصوصا در مراحل اولیه¬ی رشد گیاهچه¬ای آسیب¬پذیر هستند. در این پژوهش الگوی بیان دو ژن واکنش دهنده به تنش سرمایی در دو رقم pr (رقم مقاوم) و هاشمی (رقم حساس) برنج (oryza sativa)با استفاده از تکنیک real time pcr مورد مطالعه قرار گرفت. پروفایل بیان دو ژن osnac6 و oscdpk13 در گیاهان شاهد و تیمارهای 3، 6، 9، 12و 24 ساعت سرما (5 درجه¬ی سانتی گراد) در گیاهچه¬ه...

15 صفحه اول

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 11  issue 1

pages  85- 95

publication date 2012-03-20

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023