بررسی شبکه برهم کنش پروتئینی اختلال افسردگی ماژور با استفاده از اطلاعات پروتئومیکی مایع مغزی-نخاعی
Authors
Abstract:
هدف: با توجه به این‌که اختلال افسردگی شایع‌ترین اختلال روحی- روانی در جوامع بشری است، لذا بررسی مولکولی در این زمینه می‌تواند درک بهتری از این اختلال پیچیده فراهم نماید. در این تحقیق ارتباط بین پروتئین‌های مرتبط با این بیماری بررسی تا اهمیت بیش‌تر برخی از آن‌ها در مکانیسم مولکولی بیماری آشکار شود. مواد و روش‌ها: اسامی پروتئین‌های تغییر بیان یافته مایع مغزی-نخاعی مرتبط با اختلال افسردگی ماژور استخراج و شبکه تعامل پروتئینی 39 پروتئین به کمک نرم‌افزار Cytoscape ترسیم شد. الگوریتم‌های وابسته شامل MCODE و ClueGO+CluePedia با استفاده از آنالیز هستی‌شناسی ژن، به ترتیب برای شناسایی کمپلکس‌های پروتئینی و مسیرهای زیستی به‌کار گرفته شدند. یافته‌ها: آنالیز شبکه نشان داد که تغییر بیان 15 پروتئین به عنوان پروتئین‌های کلیدی نقش مهمی در ابتلا به این اختلال ایفا می‌نماید. شبکه حاوی چهار کمپلکس پروتئینی است و هفت مسیر مهم اختلال افسردگی ماژور نیز تعیین شدند. نتیجه‌گیری: در این تحقیق پروتئین‌ها، کمپلکس‌ها و مسیرهای زیستی مهم و مرتبط با اختلال افسردگی ماژور تعیین شدند که انجام تحقیقات تکمیلی می‌توانند به معرفی اهداف دارویی احتمالی و بیومارکرهای تشخیصی منجر شوند
similar resources
مدل‌سازی عددی هیپوترمی مغزی با استفاده از سرد کردن مایع مغزی-نخاعی
Background: Brain hypothermia by reducing the temperature of the cerebrospinal fluid is done by a cooling pad in the thoracic region and protect brain from the ischemic injuries. Along with the spinal cord, the brain is an essential partner in the central nervous system, and similarly, it is surrounded and protected from the bony skull and from shock by cerebrospinal fluid. The brain analyzes i...
full textبازسازی شبکه‌های ژنی و برهم کنش پروتئینی دخیل در پاسخ به تنش خشکی در برنج
برنج یکی از ارزشمندترین محصولات کشاورزی است. یکی از تأثیرگذارترین عوامل محدود کننده این محصول استراتژیک تنش خشکی می‌باشد. نظر به چند ژنی بودن تحمل به خشکی، هدف پژوهش حاضر بازسازی شبکه ژنی درگیر و شناسایی ژن‌های کلیدی مربوطه در برنج با استفاده از تجزیه و تحلیل داده‌های ریزآرایه بوده است. به همین منظور با استفاده از نرم‌افزار تحت وب Genevestigator تمامی ژن‌های دارای تغییر بیان بالاتر و مساوی 5/2 ...
full textشبیه‌سازی تجزیه RDX از طریق برهم کنش با موج شوک با استفاده از دینامیک مولکولی
Cylotrimethylenetrinitramine (RDX), with the chemical formula C3H6N6O6, is an energetic organic molecule used widely in commodities of explosives. Its partial stimulation results in decomposition reaction at very high rate. Molecular dynamic technique and LAMMPS code with ReaxFF-lg were employed to simulate initiation of RDX. Potential energy variations of the system were calculated for five di...
full textMy Resources
Journal title
volume 19 issue 3
pages 577- 583
publication date 2017-06
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
No Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023