بررسی خصوصیات فیلوژنتیکی باکتری اندوفیت سودوموناس پروتجنس با توانایی تولید ترکیبات آنتاگونیستی جدا شده از گیاه برگ نو

مقدمه: باکتری‌ های اندوفیت با توانائی تولید ترکیبات آنتاگونیست، قادر به کنترل بیمارگرهای گیاهی هستند. این مطالعه به منظور بررسی توانایی تولید ترکیبات آنتاگونیستی در باکتری ‌های اندوفیت برگ نو انجام پذیرفته است. مواد و روش ها: در این پژوهش باکتری ‌های اندوفیت از برگ و شاخه برگ نو، جداسازی گردید، پس از استخراج DNA ژنومی، از روش PCR به منظور تکثیر ژن 16S rDNA استفاده گردید. به منظور شناسایی دقیق باکتری جداسازی شده، محــــصول PCR، تعیـــین توالی و تـــرادف بازی 16S rDNA BLAST گردید. جدایه ‌ها از نظر تولید سیدروفور، هیدروژن سیانید و آنزیم پروتئاز مورد بررسی قرار گرفتند. یافته ‌های پژوهش: تمام باکتری‌ های جداسازی شده در این پژوهش قادر به تولید آنزیم پروتئاز بودند. تنها یک سویه‌ قادر به تولید هیدروژن سیانید بود(BN3). نتایج آزمون سیدروفور برای یک سویه‌ مثبت بود(BN2). نتایج تعیین توالی نشان داد که باکتری ‌های جداسازی شده متعلق به سودوموناس پروتوجنس  Pseudomonas protegens است که با سویه تیپ شباهت 100 درصدی دارد. بحث و نتیجه گیری: سویه‌ های جدا شده در این پژوهش، می ‌توانند در افزایش رشد گیاه به‌کار روند. از آن ‌جا که کشاورزی پایدار به توانائی حفظ تولید، همراه با استمرار نگه ‌داشت منابع و حفظ محیط زیست تاکید دارد، لذا کاربرد باکتری ‌های اندوفیت در راستای اهداف کشاورزی پایدار است و بی شک با شناخت و کشف مکانیزم‌ های دخیل می ‌توان به این مهم دست یافت.