بررسی تنوع ژنتیکی گرازهای وحشی ایران بر اساس توالی‌های ناحیۀ کنترل میتوکندری

author

  • محمدرضا اشرف‌زاده استادیار گروه شیلات و محیط‌زیست، دانشکدۀ منابع طبیعی و علوم زمین، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران
Abstract:

مدیریت و حفاظت از حیات وحش نیازمند داشتن تصویری جامع از تنوع و تغییرپذیری ژنتیکی در ساختارهای جغرافیایی است. هدف پژوهش حاضر، بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت‌های گراز وحشی در ایران با استفاده از یک قطعۀ 572 جفت بازی از ناحیۀ کنترل میتوکندریایی در نظر گرفته شد. به این منظور، تعداد 29 نمونه متعلق به جنوب کشور توالی‌یابی شد؛ همچنین 75 توالی دیگر که به مناطق مختلف ایران مربوط بودند از بانک ژن استخراج شدند. بر اساس تحلیل‌ها، چهار کلاد جهانی متعلق به گراز وحشی شامل کلادهای شرق نزدیک 1 (NE1)، شرق نزدیک 2 (NE2)، اروپایی و آسیایی در ایران حضور دارند و کلادهای اروپایی و NE1 به‌ترتیب کمترین و بیشترین پراکنش را به خود اختصاص می‌دهند. حضور هم‌جای کلادها در مناطق مختلف کشور از مهم‌ترین جنبه‌های درخور توجه است. شمال‌غربی کشور منطقۀ تماس کلادهای اروپایی و آسیایی در نظر گرفته می‌شود. بر اساس یافته‌ها، تعداد 20 هاپلوتایپ در 104 توالی از ایران شناسایی شد. تنوع هاپلوتایپی و تنوع نوکلئوتیدی در نمونه‌های ایران به‌ترتیب حدود 882/0 (انحراف معیار= 014/0) و 0145/0 (انحراف معیار= 00047/0) محاسبه شد. بر اساس تحلیل AMOVA، اختلاف ژنتیکی بین کلادها (84/82 درصد) بیش از اختلاف ژنتیکی داخل این کلادها بود؛ علاوه‌بر‌این، نمایۀ FST نیز وجود ساختار ژنتیکی معناداری را بین کلادها تأیید کرد. هیچ‌یک از نمایه‌های Fu’s FS و Tajima’s D، نشانه‌های مشخصی از وجود گسترش جمعیت‌شناختی ناگهانی در کلادهای گراز وحشی متعلق به ایران را تأیید نکردند.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

جایگاه تبارشناختی و تنوع ژنتیکی خرس های قهوه ای ایران (Ursus arctos) براساس ناحیه کنترل میتوکندری

خرس­های قهوه­ای، برخلاف سایر گوشت­خواران پرتحرک، ساختار ژنتیکی کاملاً مشخصی را در سطح جهان نشان می­دهند که دربرگیرنده چندین کلاد میتوکندریایی است. علاوه بر این، جمعیت­های خرس قهوه­ای در خاورمیانه از جمله ایران در تهدید قرار دارند. با این وجود، هنوز جایگاه تبارشناختی و تنوع ژنتیکی این خرس­ها در مقایسه با تبارهای جهانی خرس قهوه­ای در ابهام قرار دارد. در پژوهش حاضر، 50 نمونه (عضله، پوست و م...

full text

فیلوژئوگرافی گونه بز وحشی (Capra aegagrus Erxleben, 1777) در ایران بر اساس DNA میتوکندری

کل و بز از مهم‌ترین پستانداران ایران است و به دلیل پراکنش وسیع و وجود جمعیت‌های مختلف در کشور، بررسی فاصله ژنتیکی و فاصله جغرافیایی بین جمعیت‌های مختلف و ارتباط بین این دو، می‌تواند نقش مهمی در حفاظت از جمعیت‌های باقی‌مانده ایفا کند؛ در مطالعه حاضر، 481 جفت باز از ناحیه کنترل DNA میتوکندری در 343 نمونه کل و بز در ایران به منظور بررسی وضعیت فیلوژئوگرافی این گونه مورد بررسی قرار گرفت. نتایج درخت ...

full text

ساختار ژنتیکی میتوکندری جمعیتهای آنوفلس سوپرپیکتوس ایران

Background: Malaria is still one of the main health problems in south and southeast provinces of Iran and recently on average 10,000-30,000 malaria cases were reported annually. Mosquitoes of Anopheles superpictus are one of the main malaria vectors in Iran and have been reported from all areas of the country including central plateau and plains of Alborz and Zagrous Mountains chains, and with ...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی برخی ارقام انگور بر اساس صفات مورفولوژیک

این پژوهش به منظور مطالعه خصوصیات مورفولوژیکی و بررسی تنوع ژنتیکی 15 رقم انگور در محل کلکسیون مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی خراسان رضوی، در قالب طرح کاملا تصادفی با 4 تکرار به اجرا درآمد. در برخی صفات کلیدی دستورالعمل آزمون‌های تمایز، یکنواختی و پایداری، از جمله تراکم کرک‌های خوابیده بین رگبرگ-های اصلی در سطح زیرین پهنک، تراکم کرک‌های ایستاده روی رگبرگ‌های اصلی در سطح زیرین پهنک، تاولی شدن...

full text

شناسایی گوشت خواران بزرگ جثه بر اساس پلی مورفیسم طول ناحیه کنترل DNA میتوکندری در ایران

مطالعه روی گوشت خواران به دلیل جمعیت محدودشان و ویژگی های رفتاری خاص این گونه ها بیشتر به صورت غیرمستقیم و به کمک نمایه ها صورت می گیرد که همواره با اشتباهاتی نیز همراه است. با توجه به کاهش شدید گوشت خواران در اکثر زیستگاه های طبیعی در سطح کشور، شناسایی دقیق این گونه ها جهت اجرای برنامه های حفاظتی ضروری است. استفاده از ژنوم میتوکندری به دلیل نرخ جهش پذیری بالا، یک روش استاندارد جهت شناسایی پستا...

full text

بررسی ساختار جغرافیایی و تاریخچه جمعیت‌شناختی خرس قهوه‌ای بر اساس توالی ناحیه کنترل میتوکندری

در سال‌های اخیر، گستره پراکنش خرس قهوه‌ای با کاهش شدیدی روبرو بوده است و در این میان، احتمال انقراض برخی جمعیت‌های ناشناخته وجود دارد. بنابراین، داشتن یک تصویر جامع از تنوع ژنتیکی و ساختار جغرافیایی جمعیت‌ها و گونه‌های مختلف در راستای توسعه راهکارهای حفاظتی مؤثر ضروری است. در پژوهش حاضر، یک قطعه 271 نوکلئوتیدی ناحیه کنترل میتوکندری مربوط به تعداد هفت نمونه خرس قهوه‌ای از ایران و 460 توالی از خر...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 10  issue 35

pages  85- 96

publication date 2018-08-23

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023