انتساب نشانگرهای AFLP به گروه‌های پیوستگی در لاین های هاپلویید مضاعف گندم

Authors

  • رحیم ملک, مهدی
  • سیدطباطبایی, بدرالدین ابراهیم
Abstract:

Molecular mapping and construction of linkage maps in plants genome play important role in marker assisted selection and breeding programs of target traits. Eleven combinations of PstI and MseI primers were used to assign AFLP markers to the wheat (Triticum aestivum L.) linkage groups in 107 doubled haploid (DH) lines. The results of AFLP analysis indicated that amplified fragments (66 polymorphic bands) length of the primer combinations varied between 100 and 1000 base pairs (bp). Out of the 66 AFLP markers, 9.0% showed segregation distortion in the DH population that discarded from the linkage analysis. Linkage analysis for AFLP markers showed that after eliminating deviated markers from 1:1 segregation ratio, number of assigned markers to B and A genomes were respectively 21 (43%) and 20 (41 %), and a number of 6 markers were assigned to D (12%) linkage groups. A number of 12 markers were not assigned to any of wheat linkage groups. Number of assigned markers to the wheat homeologous chromosomes of 1 to 7 were 6 (12.5%), 7 (14.5%), 4 (8.7%), 5 (10.4%), 9 (18.7%) and 12 (25%), respectively. The highest number of AFLP markers were assigned to chromosomes 7A (7 markers) and 1B (5 markers). Among the mapped AFLP markers, P06m19-7-4, P01m19-8-6, P04m18-9-5, P03m22-9-6, P08m22-11-4, P03m22-8-3, P04m22-9-4, P01m24-8-2, P01m24-8-4 were located on those regions of A, B and D linkage groups that saturated the low dense intervals in previously available map and therefore, showed a better coverage on wheat genome compared with other AFLP markers.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

انتساب نشانگرهای aflp به گروه های پیوستگی در لاین های هاپلویید مضاعف گندم

تعیین جایگاه نشانگرها و تهیه نقشه پیوستگی ژنوم گیاهان نقش مهمی در انتخاب به کمک نشانگر و به نژادی صفات مورد نظر دارد. به منظور انتساب نشانگرهای aflp به نقشه پیوستگی گندم از 11 ترکیب آغازگری psti و msei در 107 لاین هاپلویید مضاعف گندم (triticum aestivum l.) استفاده شد. نتایج تجزیه aflp نشان داد که دامنه اندازه قطعات تکثیر شده (66 نشانگر چند شکل) توسط ترکیبات آغازگری بین 100 تا 1000 جفت باز (bp) ...

full text

اشباع نقشه پیوستگی ریزماهواره‌ای گندم نان درجمعیت حاصل از تلاقی Fukuho-Komugi × Oligo-Culm با استفاده از نشانگرهای AFLP

Genetic maps with high genome coverage are becoming increasingly useful in both basic and applied genetic researches. In the last decades, the advent of DNA markers has brought about a magnificent revolution in the production of genetic map, especially in wheat. In the present study, AFLP markers were used to saturate linkage map of 107 doubled haploid individuals produced through Fukuho _Komug...

full text

اشباع نقشه پیوستگی ریزماهواره‌ای گندم نان درجمعیت حاصل از تلاقی Fukuho-Komugi × Oligo-Culm با استفاده از نشانگرهای AFLP

Genetic maps with high genome coverage are becoming increasingly useful in both basic and applied genetic researches. In the last decades, the advent of DNA markers has brought about a magnificent revolution in the production of genetic map, especially in wheat. In the present study, AFLP markers were used to saturate linkage map of 107 doubled haploid individuals produced through Fukuho _Komug...

full text

ارزیابی تنوع ژنتیکی ارقام مختلف گندم با نشانگرهای AFLP

در روش AFLP ‘ به وسیله پلی مورفیمی که مبتنی بر تکثیر قطعات حاوی طولهای متفاوت است میتوان ارقام را از یکدیگر متمایز و روابط بین ژنوتیپ های کاملا نزدیک را آشکار ساخت. در این تحقیق بر اساس به کارگیری نشانگرهای AFLP میزان خویشاوندی 16 رقم گندم مورد بررسی قرار گرفت . نوارهای ظاهر شده بر روی ژل ها از نظر حضور و عدم حضور بررسی و با تشکیل ماتریس دو دویی روابط بین ارقام توسط ضرایب تطابق ساده مورد سنجش ...

full text

ارزیابی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های گندم با استفاده از نشانگرهای AFLP

Genetic diversity of 45 wheat varietions were studied using AFLP markers. From 11 primer combinations of PstI and Mse1for obtaining AFLP polymorphism, six primer combinations (P-CGA/M-CTA, P-ATG/M-CTG, P-ATG/M-CAT, P-AGT/M-CTA, P-AGT/M-CAG and P-ATG/M-CAG) produced polymorphic bands. Totally, 328 bands be produced that 207 bands (63.10%) were polymorphic, which showing high polymorphism among g...

full text

مکان‌یابی ژن‌های کمی کنترل‌‌کننده عملکرد و اجزای عملکرد کلزا درشرایط آبیاری معمول و تنش خشکی

  به منظور مکان‌یابی QTL های عملکرد و اجزای عملکرد کلزا در شرایط آبیاری معمول و تنش خشکی، 135 رگه هاپلویید مضاعف کلزا حاصل تلاقی بین یک لاین زمستانه فرانسوی (Darmo-Bzh) و یک لاین بهاره کره‌ای (Yudal) مورد ارزیابی قرار گرفتند. نقشه لینکاژی نوزده کروموزوم کلزا به کمک 459 نشانگر مولکولی شامل نشانگرهای آیزوزیم، RFLP ، RAPD ، SSR ، NSP و AFLP ترسیم شد. بر اساس روش مکان‌یابی فاصله‌ای مرکب مجموعاً تعدا...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 4  issue 11

pages  269- 284

publication date 2014-04

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023