استفاده از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی برای شناسایی اهداف بالقوه پروتئینی در پاتوژن Pseudomonas syringae به‌منظور کنترل این پاتوژن

سابقه و هدف: شناسایی اهداف اختصاصی در هر پاتوژن برای جلوگیری از اثرهای سوء­مصرف سموم شیمیایی ضروری است. در مطالعه حاضر، با استفاده از یک روش‌ بیوانفورماتیکی مبتنی بر همولوژی، پروتئوم پاتوژن P. syringae با پروتئوم گیاه گوجه‌فرنگی و دیگر محصول­های کشاورزی میزبان آن مقایسه و تعدادی پروتئین به­عنوان اهداف بالقوه برای مبارزه در پاتوژن انتخاب شدند. مواد و روش‌ها: پروتئوم پاتوژن با گیاهان میزبان مقایسه و پروتئین‌های غیرمشابه انتخاب شدند. این پروتئین‌ها با پروتئوم انسان و سایر موجودات غیرهدف مقایسه و پروتئین‌های غیرمشابه انتخاب و اهداف بالقوه تحت آنالیزهای کیفی مختلفی قرار گرفتند. یافته‌ها: نتایج آنالیزها، 95 پروتئین‌ را به­عنوان اهداف منحصر بفرد مشخص کرد. از مجموع پروتئین‌ها،‌ 59 پروتئین در سیتوپلاسم، 15 پروتئین در غشاء داخلی، 17 پروتئین در فضای پری­پلاسمیک، 3 پروتئین در غشاء خارجی و 1 پروتئین در خارج از سلول پاتوژن P.syringae تجمع پیدا می‌کردند. نتیجه‌گیری: پروتئین‌های مشخص شده در این مطالعه، اهدافی بسیار مؤثر برای مبارزه بوده و هدف قرار دادن چنین پروتئین‌هایی می‌تواند به­طور مؤثری باعث کنترل پاتوژن P.syringae شود. هم­چنین طراحی و تولید مواد شیمیایی علیه این پروتئین‌های هدف، در کنار کنترل مؤثر این پاتوژن، می‌تواند طیف وسیعی از پاتوژن‌ها را کنترل کرده و از اثرهای مضر بر انسان، موجودات غیرهدف و محیط زیست جلوگیری کند.