ارزیابی ویژگی‌های ساختاری وعملکردی مجموعه پروتئینی Xpt به منظور توسعه‌ روش‌های مولکولی در طراحی نسل جدید آفت کش ها

Authors

  • علی اکبر حداد مشهدریزه - گروه سلولی و مولکولی، پژوهشکده فناوری زیستی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران 3- گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران
  • علی مخدومی گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران
  • مهسا جلیلی منش گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران
Abstract:

در خصوص ویژگی‌های ساختاری و عملکردی مجموعه سموم آفت کش Xpt اطلاعات کمی موجود است. آگاهی از دمین‌های عملکردی و اتصالی در جهت ایجاد سازه‌های ژنی جدید با حذف نواحی غیر‌ضروری یا قرار دادن دمین‌های عملکردی در مجاورت پروتئین‌های دیگر و تولید سموم چند‌‌توان حائز اهمیت است. در پژوهش حاضر محاسبات زیستی این مجموعه جهت آگاهی از ویژگی‌های نواحی مختلف آن انجام گردید. توالی ژنی و پروتئینی این مجموعه شامل زیر واحد‌های XptA1 ، XptA2 ، XptB1 و XptC1 از پایگاه‌های داده استحصال و بررسی ساختاری و عملکردی شامل خصوصیات فیزیکوشیمیایی، توپولوژی، دامنه میزبانی، ساختارهای ثانویه و سه‌بعدی توسط برنامه‌های رایج محاسباتی صورت پذیرفت. قابلیت ترشح مستقل از سیگنال پپتید، دمین‌های مرتبط با خاصیت حشره‌کشی و عملکرد سایر ‌دومین ها آشکار گردید. همگون‌یابی توالی نواحی عملکردی منجر به ردیابی آن ها در طیف وسیع از باکتری‌های گرم منفی شد. ساختار ثانویه نشان‌ دهنده ماهیت هلیکسی ناحیه عملکردی XptA1 و XptA2 و صفحه‌ای XptC1 است. قابلیت عملکردی مطلوب XptC1 نسبت به سایر اجزا در اتصال به اکتین نشان داده شد. نتایج حاصل از این تحقیق با آشکار‌سازی اطلاعات پایه‌ای نواحی مختلف مجموعه سموم Xpt امکان طراحی سازه‌های ژنی جدید مبتنی بر زیست شناسی سنتزی را فراهم می‌آورد

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

طراحی و توسعه یک حسگر الکتروشیمیایی اصلاح شده با پلیمر قالب مولکولی و نانولوله های کربنی به منظور ارزیابی مواجهات محیطی و شغلی با آفت کش دی‌کلران

Background and aims: Dicloran pesticide is used to inhibit the fungal spore germination for different crops. Due to the increasing application of pesticides, evaluating the occupational and environmental exposures by reliable and accurate analytical methods is necessary. This work was aimed to design the high selective sensor to determine the dicloran in biological and environmental samples. ...

full text

ارزیابی اثرات تنفسی مواجهه شغلی با سموم آفت کش

Background: Pesticides are chemical compounds used against vectors of human and animal diseases as well as plant pests. This study was undertaken to assess pulmonary reactions, if any, associated with occupational exposure to pesticides. Methods: This was a cross sectional analytical study in which a group of 86 exposed (employees of a pesticide producing company) and 75 unexposed referent sub...

full text

توسعه روشی جدید به منظور طراحی لنگه های زغالی در معادن اتاق و پایه

طراحی لنگه در معادن زغال سنگ زیرزمینی یکی از گسترده ترین موضوعات تحقیقاتی در کشورهای تولید کننده زغال سنگ است. لنگه های به جا مانده با ابعاد نامناسب منجر به شکست لنگه در زمان عملیات بازیابی لنگه می شوند. زیرا بارهای پایه ای ناشی از عملیات بازیابی لنگه موجب افزایش بار وارد بر لنگه های مجاور خط تخریب می شوند. شکست لنگه از مهمترین ریسکهای ژئوتکنیکی است که می تواند موجب صدمه دیدن معدنکاران، تخریب ت...

full text

باکتریوسین ها: نسل جدید پپتیدهای ضدمیکروبی

     از زمان کشف آنتی­ بیوتیک ­ها در اوایل قرن نوزدهم این ترکیبات ضدمیکروبی همچنان جایگاه خود را در کنترل رشد میکروارگانیسم ­ها حفظ کرده­ اند. امروزه استفاده گسترده از آنتی­ بیوتیک­ ها سبب ایجاد سویه­ های مقاوم شده و یکی از چالش­ های قرن جدید است. نگرانی در مورد مقاومت ­های آنتی­ بیوتیکی به قدری جدی است که در بسیاری از کشورها بودجه ­های هنگفتی برای کشف جایگزین­ های دارویی اختصاص داده ­اند. باکت...

full text

ارزیابی توان اکولوژیکی به منظور تعیین عرصه‌های مناسب توسعه در محدوده‌ی شهر جدید سهند

امروزه بسیاری از شهرهای کشور ما با توجه به گسترش نامحدود و بدون برنامه­ی خود سبب دست­اندازی به محیط­های طبیعی و از بین بردن آن­ها شده­اند. اما افزایش روزافزون جمعیّت شهرنشین و در پی آن رشد شهرها، توجه به چگونگی کنترل توسعه­ی شهرها و گام­برداری در راستای اصول توسعه­ی پایدار را الزامی می­نماید. شهر جدید سهند که در حدود دو دهه پیش و به منظور جذب سرریز جمعیّت کلانشهر تبریز ایجاد گردیده است، نیز از ای...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 32  issue 2

pages  216- 224

publication date 2019-07-23

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023