آنالیز نواحی تکراری چند ناحیه ای (MLVA) به منظور تیپ بندی سویه های سودوموناس آئروژینوزای عامل عفونت ادراری

Authors

  • استاجی, محمد 3- گروه پزشکی مولکولی، پژوهشکده پزشکی، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، تهران، ایران
  • راهب, جمشید 3- گروه پزشکی مولکولی، پژوهشکده پزشکی، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، تهران، ایران
  • غلامی, مریم 4- گروه میکروبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد خرم آباد، خرم آباد، ایران
  • مرزبان, عبدالرزاق 2- مرکز تحقیقات داروهای گیاهی رازی، دانشگاه علوم پزشکی لرستان، خرم آباد، ایران
Abstract:

سابقه و هدف: سودوموناس آئروژینوزا یکی از شایع ترین عوامل عفونت­های ادراری در بیمارستان­ها می باشد. هدف از این مطالعه تعیین تیپ تعدادی از جدایه های بدست آمده از بیماران به روش MLVA به منظور رسیدن به یک الگوی ژنتیکی مشخص برای دسته بندی آنها می­باشد. مواد و روش ­ها: در این مطالعه 70 سویه سودموناس آئروژینوزا از نمونه ادراری بیماران در بیمارستان های تهران جمع آوری شد. برای بررسی ژنوتیپی بر اساس روش MLVA، ابتدا از نمونه ها استخراجDNA ژنومی انجام شد. سپس توالی های تکراری پشت سرهم (VNTR) موجود در ژنوم باکتری ها که درون نواحی ژنی MS-213، MS-214، MS-215، MS-217، MS-222، MS-223، MS-142 و MS-173 قرار داشتند، توسط پرایمرهای اختصاصی به روش PCR تکثیر شدند. پس از اطمینان از تکثیر ژن­های مورد نظر با استفاده از ژل الکتروفورز، ارتباط تکاملی و تیپ بندی آنها با روش MLVA بررسی شد. یافته ها: بعد از الکتروفورز محصول PCR و تعیین تعداد VNTRها، 70 سویه بدست آمده در 39 تیپ دسته بندی شده و نمودار درخت تکاملی ژنی رسم گردید. بر اساس الگوی MST، 70 سویه بالینی به 11 کمپلکس کلونال (clonal complex) تقسیم شدند که این معیار نشان دهنده فاصله ژنتیکی بر اساس اختلاف در تعداد VNTR در هر یک از گروه ها بود. نتیجه گیری: مطالعه حاضر نشان داد که MLVA یک روش موثر برای تیپ بندی سویه های بالینی سودوموناس آئروژینوزا می باشد. نتایج بدست آمده نشان دهنده پتانسیل بالای این روش در تمایز بین سویه هایی که از نظر فنوتیپی بسیار شبیه به یکدیگر بود، می باشد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

تعیین و تجزیه و تحلیل تعداد توالی های متغیر تکراری پشت سرهم چند لوکوس"Multiple-Locus Variable Number Tandem Repeat Analysis" جهت تیپ بندی سویه های پسودوموناس آئروژینوزای عامل عفونت بیمارستانی

مقدمه: شناسایی منبع پسودوموناس آئروژینوزای عامل عفونت بیمارستانی عامل مهم در کنترل عفونت است. هدف از این مطالعه بررسی و تجزیه‌وتحلیل تعداد توالی‌های متغیر تکراری پشت سرهم چند لوکوسی جهت تیپ بندی سویه های پسودوموناس آئروژینوزای عامل عفونت بیمارستانی است. روش کار: مطالعه توصیفی-تحلیلی حاضر طی آذر 1394 الی اسفند 1396 در شهر سنندج روی 134 نمونه بالینی پسودوموناس آئروژینوزا انجام شد. آزمایش های فنوت...

full text

بررسی میزان فراوانی ژن متالوبتالاکتامازVIM1 در سویه های سودوموناس آئروژینوزای بیمارستانی با مقاومت چند گانه

 مقدمه و هدف: هدف از این مطالعه، شناسایی و بررسی میزان فراوانی ژن متالوبتالاکتامازVIM1 در سویه های سودوموناس آئروژینوزای بیمارستانی با مقاومت چند گانه بود. متالوبتالاکتامازها قادر به هیدرولیز طیف وسیعی از بتالاکتام ها از جمله پنی سیلین ها، سفالوسپورین ها و کارباپنم ها هستند، اما توانایی هیدرولیز مونوباکتام ها (آزترونام) را ندارند. متالوبتالاکتاماز بر اساس ساختار مولکولی به شش نوع تقسیم می ...

full text

تعیین گروه های فیلوژنتیک سویه های اشریشیا کلی عامل عفونت دستگاه ادراری درجنوب ایران

سابقه و هدف: اشریشیا کلی عامل بیش از 80%  از عفونت های ادراری در تمام گروه‌های سنی جامعه است. سویه های اشریشیاکلی به چهار گروه فیلوژنتیک تقسیم می شوند. اغلب جدایه های های بیماریزای خارج روده ای متعلق به گروه B2 وD هستند. هدف از این پژوهش، تعیین گروه های فیلوژنتیک اشریشیاکلی جدا شده از بیماران با عفونت ادراری در جنوب ایران بود. مواد و روش‌ها: این پژو...

full text

تعیین گروه های فیلوژنتیک سویه های اشریشیا کلی عامل عفونت دستگاه ادراری درجنوب ایران

سابقه و هدف: اشریشیا کلی عامل بیش از 80%  از عفونت های ادراری در تمام گروه‌های سنی جامعه است. سویه های اشریشیاکلی به چهار گروه فیلوژنتیک تقسیم می شوند. اغلب جدایه های های بیماریزای خارج روده ای متعلق به گروه B2 وD هستند. هدف از این پژوهش، تعیین گروه های فیلوژنتیک اشریشیاکلی جدا شده از بیماران با عفونت ادراری در جنوب ایران بود. مواد و روش‌ها: این پژو...

full text

الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی سویه های سودوموناس آئروجینوزا جداشده از عفونت های بیماران مبتلا به سوختگی

زمینه: سودوموناس آئروجینوزا یکی از مهم ترین پاتوژن های فرصت طلب به ویژه در میزبان های با ضعف ایمنی است که تبدیل به یکی از برجسته ترین باکتری های گرم منفی عامل عفونت های بیمارستانی شده است. هدف از این مطالعه بررسی حساسیت ایزوله های بالینی سودوموناس آئروجینوزا نسبت به آنتی بیوتیک های متداول و دسته بندی این سویه ها براساس الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی می باشد.روش کار: در این تحقیق 110 سودوموناس آئروجی...

full text

بررسی و تعیین الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی سویه های سودوموناس آئروژینوزای جدا شده اززخم بیماران سوختگی

  زمینه و هدف : عفونت زخم علت اصلی مرگ و میر در بیماران سوختگی می باشد. بیماران مبتلا به سوختگی به وضوح در معرض خطر بالای عفونت بیمارستانی قرار دارند. سودوموناس آئروژینوزا از شایع ‌ترین عوامل عفونت زخم های سوختگی است و با توجه به مقاومت زیادآن به آنتی‌بیوتیک‌ها، درمان مشکلی دارد. هدف از این مطالعه، جداسازی، شناسایی دقیق و بررسی الگوی مقاومت آنتی‌بیوتیکی سویه‌های سودوموناس آئروژینوزای جدا شده از...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 20  issue 2

pages  56- 63

publication date 2018-02

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023