آنالیز شبکه برهمکنش پروتئین - پروتئین بر اساس ژنهای تغییر بیان یافته در مایع مغزی نخاعی برای بیماری مالتیپل اسکلروزیس
Authors
Abstract:
هدف: ام.اس شایعترین بیماری تخریب میلین سیستم عصبی مرکزی است. روشهای جدید، برای فهم بهتر بیماریزایی و معرفی اهداف دارویی جدید ضروری میباشند. هدف این مطالعه، استفاده از روش شبکه زیستی به منظور شناسایی نشانگرهای کلیدی جدید درگیر در بیماریزایی ام.اس بود. مواد و روشها: در این مطالعه، پروفایل بیان ژن مایع مغزی نخاعی مربوط به 26 بیمار تازه مبتلا شده به ام.اس و 18 فرد کنترل از پایگاه داده Array Express گرفته و آنالیز شد. ژنهای متفاوت بیان شده با دادههای برهمکنش پروتئین-پروتئین تلفیق و زیرشبکه برهمکنش پروتئین- پروتئین ساخته شد. ویژگیهای توپولوژیکی شبکه حاصل توسط نرمافزار cytoscape مورد آنالیز قرار گرفت. یافتهها: با آنالیز پروفایل بیان ژن، 3062 ژن متفاوت بیان شده (0/05FDR<) در مایع مغزی نخاعی بیماران ام.اس در مقایسه با افراد کنترل مشخص شدند که 1080 ژن افزایش بیان و 1981 ژن کاهش بیان داشتند. با ادغام ژنهای متفاوت بیان شده و دادههای برهمکنش پروتئین- پروتئین زیرشبکهای با 1440 رأس و 3500 یال ساخته شد. پس از آنالیز ویژگیهای توپولوژیکی زیرشبکه، پنج ژن جدید که مقادیر بالای پارامترهای مرکزیت را داشتند، به عنوان نشانگرهای کاندید معرفی شدند. این نشانگرها در مسیرهای زیستی نظیر تنظیم دینامیک اسکلت سلولی، چرخه سلولی، اسپلایسوزوم نقش دارند. با بررسی متون، ارتباط نشانگرها در بیماریزایی ام.اس تأیید شد. نتیجهگیری: بنابراین، آنالیزهای بر پایه شبکه میتواند نشانگرهایی را معرفی کند که بتوان آنها را به عنوان اهداف دارویی بالقوه برای ام.اس مورد بررسی بیشتری قرار داد.
similar resources
بررسی ویژگیهای توپولوژیکی ژنهای تغییر بیان یافته خون در شبکه برهم کنش پروتئین- پروتئین برای بیماری دیابت نوع 1
سابقه و هدف: بیماری دیابت نوع 1 در نتیجه تخریب خودایمنی سلولهای بتا تولیدکننده انسولین در پانکراس ایجاد میشود. برای گسترش درمان بیماری، شناسایی نشانگرهای درمانی کارآمد مورد نیاز است. روشهای سیستم بیولوژی سبب فهم بهتری از عوامل عملکردی در بیماری میگردند. هدف این مطالعه، جستجوی نشانگرهای کاندید در این بیماری با بررسی ویژگیهای توپولوژیکی زیرشبکه حاصل از تلفیق دادههای بیان ژن و برهمکنش پروت...
full textبررسی ویژگی های توپولوژیکی ژن های تغییر بیان یافته خون در شبکه برهم کنش پروتئین- پروتئین برای بیماری دیابت نوع ۱
سابقه و هدف: بیماری دیابت نوع 1 در نتیجه تخریب خودایمنی سلول های بتا تولید کننده انسولین در پانکراس ایجاد می شود. برای گسترش درمان بیماری، شناسایی نشانگرهای درمانی کارآمد مورد نیاز است. روش های سیستم بیولوژی سبب فهم بهتری از عوامل عملکردی در بیماری می گردند. هدف این مطالعه، جستجوی نشانگرهای کاندید در این بیماری با بررسی ویژگی های توپولوژیکی زیرشبکه حاصل از تلفیق داده های بیان ژن و برهمکنش پروتئ...
full textبررسی الگوی الکتروفورزی پروتئین های مایع مغزی- نخاعی جنین جوجه
در طی رشد و نمو اولیه جنینی، لوله عصبی از نورواپی تلیوم شکل می گیرد، در اطراف یک حفره ای که با مایع مغزی- نخاعی اولیه یا مایع مغزی – نخاعی جنینی پر شده است. مایع مغزی- نخاعی جنینی بوسیله ی بافت مغزی ترشح می شود. در مراحل بعدی رشدونمو شبکه های کوروئید مایع مغزی- نخاعی را ترشح می کنند که از سرتاسر نواحی حفره ی زاینده عبور می کند. مایع مغزی- نخاعی جنینی شامل غلظت های بالایی از پروتئین ها در مقایسه...
15 صفحه اولنقش پروتئین کلاژن در بیماری سیستمیک اسکلروزیس
سیستمیک اسکلروزیس نوعی بیماری بافت پیوندی است که معمولا پوست و در موارد پیشرفته آن ریه، کلیه و قلب را نیز درگیر مینماید. اتیولوژی و پاتولوژی این بیماری ناشناخته است. یک عامل موثر از قبیل ویروس یا مواد شیمیایی برای افرادی که از نظر ژنتیکی مستعد ابتلا به سیستمیک اسکلروزیس باشند، می تواند سرآغاز ایجاد بیماری باشد. از مکانیسم های احتمالی درگیر در پاتولوژی این بیماری آسیب به رگ های خونی کوچک، رسوب ک...
full textبیومارکرهای تشخیصی در بیماری مالتیپل اسکلروزیس
هم زمان با گسترش گزینه های درمانی برای بیماری مالتیپل اسکلروزیس، نیاز روز افزونی برای یافتن بیومارکرهایی وجود دارد که از حساسیت بالاتری برخوردار بوده و می توانند میزان فعالیت و سیر بیماری را مشخص کنند. امروزه، بیومارکرهای مختلفی با دقت و قدرت انتخابی بالا در کمک به درمان اولیه، بررسی پاسخ به درمان های دارویی، تشخیص زودهنگام و نیز شناسایی مقاطع مختلف این بیماری به کار می رود. برای مثال، وجود...
full textمیکروRNA ها در بیماری مالتیپل اسکلروزیس
چکیده زمینه و هدف: بیماری مالتیپل اسکلروزیس (ام اس) یک بیماری خود ایمنی تخریب کننده غلاف میلین در دستگاه عصبی مرکزی می باشد که عامل ایجاد کننده آن هنوز ناشناخته باقی مانده است. مطالعات فراوان اپیدمیولوژیکی و ژنتیکی بر نقش دو عامل ژنتیک و محیط در ایجاد بیماری ام اس تاکید دارند. با ورود میکرو RNA ها به دنیای یافته های ژنتیکی این مولکولهای قدرتمند به زودی توانستند جای خود را در مطالعات انجام شده د...
full textMy Resources
Journal title
volume 20 issue 1
pages 81- 88
publication date 2018-01
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
No Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023