The binding site distance test score: a robust method for the assessment of predicted protein binding sites

نویسندگان
چکیده

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

The binding site distance test score: a robust method for the assessment of predicted protein binding sites

MOTIVATION We propose a novel method for scoring the accuracy of protein binding site predictions-the Binding-site Distance Test (BDT) score. Recently, the Matthews Correlation Coefficient (MCC) has been used to evaluate binding site predictions, both by developers of new methods and by the assessors for the community-wide prediction experiment-CASP8. While being a rigorous scoring method, the ...

متن کامل

THE CALCIUM BINDING SITES OF THE BAKERS' YEAST TRANSKETOLASE

The calcium binding sites of Bakers' Yeast Transketolase (TK) was elucidated by estimating the pKa values of the functional groups that bind to calcium. These pKa's were found to be 6.25 and 7.2 relating to the pKa's of the two immidazol moieties of histidine residues on the enzyme. The rate of the binding of calcium to the enzyme was obtained separately as a function of pH. Maximum values ...

متن کامل

A novel method for scoring of docked protein complexes using predicted protein-protein binding sites.

Docking algorithms produce many possible structures of a protein-protein complex. In most cases some of them resemble the correct structure within an r.m.s.d. of <3 A. A major challenge in the field of docking is to extract the correct structure out of this pool, the so-called 'scoring'. Here, we introduce a new scoring function, which discriminates between the many wrong and few true conformat...

متن کامل

the test for adverse selection in life insurance market: the case of mellat insurance company

انتخاب نامساعد یکی از مشکلات اساسی در صنعت بیمه است. که ابتدا در سال 1960، توسط روتشیلد واستیگلیتز مورد بحث ومطالعه قرار گرفت ازآن موقع تاکنون بسیاری از پژوهشگران مدل های مختلفی را برای تجزیه و تحلیل تقاضا برای صنعت بیمه عمر که تماما ناشی از عدم قطعیت در این صنعت میباشد انجام داده اند .وهدف از آن پیدا کردن شرایطی است که تحت آن شرایط انتخاب یا کنار گذاشتن یک بیمه گزار به نفع و یا زیان شرکت بیمه ...

15 صفحه اول

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Bioinformatics

سال: 2010

ISSN: 1460-2059,1367-4803

DOI: 10.1093/bioinformatics/btq543